MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069 plasmid pCFSAN002069_02

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021842	CGAAA	2	10	1019	1028	60 %	0 %	20 %	20 %	525933209
2	NC_021842	CTGGT	2	10	1031	1040	0 %	40 %	40 %	20 %	525933209
3	NC_021842	ATTAT	2	10	5148	5157	40 %	60 %	0 %	0 %	525933214
4	NC_021842	GAAAT	2	10	6872	6881	60 %	20 %	20 %	0 %	525933217
5	NC_021842	TCATT	2	10	7698	7707	20 %	60 %	0 %	20 %	525933217
6	NC_021842	GCCCT	2	10	10774	10783	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_021842	ACACC	2	10	11525	11534	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_021842	CATAC	2	10	14406	14415	40 %	20 %	0 %	40 %	525933225
9	NC_021842	AGCCA	2	10	15470	15479	40 %	0 %	20 %	40 %	525933227
10	NC_021842	ATTTC	2	10	16417	16426	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021842	CAAAA	2	10	17029	17038	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021842	AGATA	2	10	18747	18756	60 %	20 %	20 %	0 %	525933232
13	NC_021842	TTATG	2	10	21162	21171	20 %	60 %	20 %	0 %	525933237
14	NC_021842	CAGAA	2	10	22334	22343	60 %	0 %	20 %	20 %	525933238
15	NC_021842	CGCAA	2	10	23206	23215	40 %	0 %	20 %	40 %	525933239
16	NC_021842	AATGA	2	10	25116	25125	60 %	20 %	20 %	0 %	525933242
17	NC_021842	GAAAA	2	10	25846	25855	80 %	0 %	20 %	0 %	525933242
18	NC_021842	TTTTG	2	10	27902	27911	0 %	80 %	20 %	0 %	525933244
19	NC_021842	TATCG	2	10	30102	30111	20 %	40 %	20 %	20 %	525933246
20	NC_021842	GTTTT	2	10	31022	31031	0 %	80 %	20 %	0 %	525933247
21	NC_021842	AAAAT	2	10	31150	31159	80 %	20 %	0 %	0 %	525933248
22	NC_021842	TTTCG	2	10	33304	33313	0 %	60 %	20 %	20 %	525933249
23	NC_021842	GAAAA	2	10	35791	35800	80 %	0 %	20 %	0 %	525933252
24	NC_021842	AATAG	2	10	35972	35981	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021842	AAAGC	2	10	37084	37093	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.