MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_02

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021841	CCATTA	2	12	574	585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021841	TTCTTT	2	12	2394	2405	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525932973
3	NC_021841	GTTTTC	2	12	2904	2915	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525932974
4	NC_021841	TGCTCA	2	12	5259	5270	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525932979
5	NC_021841	CCTTTA	2	12	6870	6881	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525932983
6	NC_021841	AAACTC	2	12	8012	8023	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525932985
7	NC_021841	CCTTCA	2	12	11027	11038	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525932991
8	NC_021841	TGCCTG	2	12	14051	14062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021841	ACACAT	2	12	16526	16537	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525932997
10	NC_021841	TATCCT	2	12	21937	21948	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525933004
11	NC_021841	ATCTGA	2	12	23889	23900	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525933005
12	NC_021841	AATCGT	2	12	24203	24214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525933006
13	NC_021841	ACGACT	2	12	26797	26808	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525933012
14	NC_021841	AAATCA	2	12	27233	27244	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525933012
15	NC_021841	TTCCTG	2	12	31093	31104	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525933015
16	NC_021841	TGAAAC	2	12	31503	31514	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525933016
17	NC_021841	ATGATT	2	12	33437	33448	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525933019

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.