MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_02

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021841	TCCAC	2	10	903	912	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_021841	TCATT	2	10	1078	1087	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021841	TTTCT	2	10	1118	1127	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021841	GTAAA	2	10	1188	1197	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021841	GTAAT	2	10	4751	4760	40 %	40 %	20 %	0 %	525932978
6	NC_021841	CGCTG	2	10	5793	5802	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_021841	AAAAC	2	10	6372	6381	80 %	0 %	0 %	20 %	525932981
8	NC_021841	CAGAT	2	10	7064	7073	40 %	20 %	20 %	20 %	525932983
9	NC_021841	CATTT	2	10	7491	7500	20 %	60 %	0 %	20 %	525932984
10	NC_021841	CCTGC	2	10	7508	7517	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_021841	ATTTT	2	10	7949	7958	20 %	80 %	0 %	0 %	525932985
12	NC_021841	ACCAG	2	10	9299	9308	40 %	0 %	20 %	40 %	525932988
13	NC_021841	CCTGC	2	10	9588	9597	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_021841	ATCGC	2	10	10061	10070	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_021841	GCAGA	2	10	13875	13884	40 %	0 %	40 %	20 %	525932993
16	NC_021841	GATTA	2	10	15006	15015	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021841	GGCAG	2	10	17682	17691	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021841	GAGCA	2	10	17744	17753	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021841	TAAGG	2	10	18536	18545	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021841	CGGCA	2	10	19103	19112	20 %	0 %	40 %	40 %	525933000
21	NC_021841	TGAAG	2	10	19373	19382	40 %	20 %	40 %	0 %	525933000
22	NC_021841	CTTTT	2	10	21420	21429	0 %	80 %	0 %	20 %	525933004
23	NC_021841	TTTCT	2	10	21858	21867	0 %	80 %	0 %	20 %	525933004
24	NC_021841	TGAAC	2	10	22276	22285	40 %	20 %	20 %	20 %	525933004
25	NC_021841	GCTTT	2	10	22407	22416	0 %	60 %	20 %	20 %	525933004
26	NC_021841	TCGGA	2	10	24930	24939	20 %	20 %	40 %	20 %	525933007
27	NC_021841	CAACT	2	10	25193	25202	40 %	20 %	0 %	40 %	525933008
28	NC_021841	CTTTC	2	10	26575	26584	0 %	60 %	0 %	40 %	525933012
29	NC_021841	CTTTC	2	10	29996	30005	0 %	60 %	0 %	40 %	525933014

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.