MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_02

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021841	AAGA	2	8	101	108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021841	TTAC	2	8	537	544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021841	ATTT	2	8	850	857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021841	CATA	2	8	1021	1028	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021841	ATTT	2	8	1213	1220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021841	GAAC	2	8	1350	1357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021841	AGCC	2	8	1715	1722	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021841	CATA	2	8	1801	1808	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021841	ATCC	2	8	2062	2069	25 %	25 %	0 %	50 %	525932972
10	NC_021841	TTAA	2	8	2202	2209	50 %	50 %	0 %	0 %	525932973
11	NC_021841	AATC	2	8	3004	3011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021841	TAAT	2	8	3183	3190	50 %	50 %	0 %	0 %	525932975
13	NC_021841	AAAG	2	8	3381	3388	75 %	0 %	25 %	0 %	525932975
14	NC_021841	CTAC	2	8	3493	3500	25 %	25 %	0 %	50 %	525932976
15	NC_021841	TACA	2	8	3588	3595	50 %	25 %	0 %	25 %	525932976
16	NC_021841	CTGG	2	8	4092	4099	0 %	25 %	50 %	25 %	525932977
17	NC_021841	TACA	2	8	4978	4985	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021841	AATG	2	8	5136	5143	50 %	25 %	25 %	0 %	525932979
19	NC_021841	AGAC	2	8	5207	5214	50 %	0 %	25 %	25 %	525932979
20	NC_021841	GGCA	2	8	5522	5529	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021841	ATTG	2	8	5601	5608	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021841	GAAA	2	8	5725	5732	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021841	TGAT	2	8	6302	6309	25 %	50 %	25 %	0 %	525932981
24	NC_021841	ATCC	2	8	6456	6463	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021841	AGTC	2	8	6756	6763	25 %	25 %	25 %	25 %	525932983
26	NC_021841	TAAT	2	8	6928	6935	50 %	50 %	0 %	0 %	525932983
27	NC_021841	CGAA	2	8	7661	7668	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021841	TTAA	2	8	8194	8201	50 %	50 %	0 %	0 %	525932986
29	NC_021841	ATTC	2	8	8264	8271	25 %	50 %	0 %	25 %	525932986
30	NC_021841	GGCT	2	8	9021	9028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021841	AGAA	2	8	9316	9323	75 %	0 %	25 %	0 %	525932988
32	NC_021841	ATTT	2	8	9391	9398	25 %	75 %	0 %	0 %	525932988
33	NC_021841	CGAA	2	8	9741	9748	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021841	CGGG	2	8	10153	10160	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021841	CGAA	2	8	11289	11296	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021841	AGTT	2	8	11520	11527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021841	AGAT	2	8	11945	11952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021841	AATT	2	8	12011	12018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021841	CTGA	2	8	12319	12326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021841	GTCA	2	8	12874	12881	25 %	25 %	25 %	25 %	525932992
41	NC_021841	ACAG	2	8	13967	13974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021841	TAAT	2	8	14704	14711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021841	CCAG	2	8	15043	15050	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021841	ACAA	2	8	15272	15279	75 %	0 %	0 %	25 %	525932995
45	NC_021841	TATT	2	8	15479	15486	25 %	75 %	0 %	0 %	525932996
46	NC_021841	AATG	2	8	16276	16283	50 %	25 %	25 %	0 %	525932997
47	NC_021841	AACG	2	8	16315	16322	50 %	0 %	25 %	25 %	525932997
48	NC_021841	GCGG	2	8	16366	16373	0 %	0 %	75 %	25 %	525932997
49	NC_021841	CTTT	2	8	16515	16522	0 %	75 %	0 %	25 %	525932997
50	NC_021841	GTCT	2	8	17005	17012	0 %	50 %	25 %	25 %	525932998
51	NC_021841	TTCA	2	8	17304	17311	25 %	50 %	0 %	25 %	525932998
52	NC_021841	GTGG	2	8	17891	17898	0 %	25 %	75 %	0 %	525932999
53	NC_021841	CATA	2	8	18143	18150	50 %	25 %	0 %	25 %	525932999
54	NC_021841	CAGC	2	8	18684	18691	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021841	CGAT	2	8	19711	19718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021841	CCAT	2	8	19908	19915	25 %	25 %	0 %	50 %	525933001
57	NC_021841	TGTT	2	8	19944	19951	0 %	75 %	25 %	0 %	525933001
58	NC_021841	ATTT	2	8	20304	20311	25 %	75 %	0 %	0 %	525933001
59	NC_021841	GCTG	2	8	20590	20597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021841	AAGC	2	8	20730	20737	50 %	0 %	25 %	25 %	525933002
61	NC_021841	TAAT	2	8	21119	21126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021841	GTAC	2	8	21140	21147	25 %	25 %	25 %	25 %	525933003
63	NC_021841	ACTC	2	8	21508	21515	25 %	25 %	0 %	50 %	525933004
64	NC_021841	CAGG	2	8	21787	21794	25 %	0 %	50 %	25 %	525933004
65	NC_021841	GACA	2	8	22916	22923	50 %	0 %	25 %	25 %	525933004
66	NC_021841	AGGG	2	8	23784	23791	25 %	0 %	75 %	0 %	525933005
67	NC_021841	GCCA	2	8	23848	23855	25 %	0 %	25 %	50 %	525933005
68	NC_021841	TTTC	2	8	23987	23994	0 %	75 %	0 %	25 %	525933005
69	NC_021841	TGTT	2	8	24246	24253	0 %	75 %	25 %	0 %	525933006
70	NC_021841	CTTT	2	8	24554	24561	0 %	75 %	0 %	25 %	525933006
71	NC_021841	AGTT	2	8	24595	24602	25 %	50 %	25 %	0 %	525933007
72	NC_021841	TCCC	2	8	25100	25107	0 %	25 %	0 %	75 %	525933008
73	NC_021841	GAAG	2	8	25173	25180	50 %	0 %	50 %	0 %	525933008
74	NC_021841	ATGA	2	8	25640	25647	50 %	25 %	25 %	0 %	525933009
75	NC_021841	CTCC	2	8	25931	25938	0 %	25 %	0 %	75 %	525933010
76	NC_021841	CTGC	2	8	26930	26937	0 %	25 %	25 %	50 %	525933012
77	NC_021841	GAAA	2	8	27141	27148	75 %	0 %	25 %	0 %	525933012
78	NC_021841	AAAT	2	8	27197	27204	75 %	25 %	0 %	0 %	525933012
79	NC_021841	AATG	2	8	27343	27350	50 %	25 %	25 %	0 %	525933012
80	NC_021841	TCAT	2	8	27416	27423	25 %	50 %	0 %	25 %	525933012
81	NC_021841	TCTT	2	8	28040	28047	0 %	75 %	0 %	25 %	525933012
82	NC_021841	CTGT	2	8	28163	28170	0 %	50 %	25 %	25 %	525933012
83	NC_021841	ATCC	2	8	28177	28184	25 %	25 %	0 %	50 %	525933012
84	NC_021841	AAAT	2	8	28260	28267	75 %	25 %	0 %	0 %	525933012
85	NC_021841	ATCC	2	8	29632	29639	25 %	25 %	0 %	50 %	525933014
86	NC_021841	CTCC	2	8	30061	30068	0 %	25 %	0 %	75 %	525933014
87	NC_021841	TTAC	2	8	30226	30233	25 %	50 %	0 %	25 %	525933014
88	NC_021841	AATA	2	8	31357	31364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021841	TCTG	2	8	31396	31403	0 %	50 %	25 %	25 %	525933016
90	NC_021841	GAAG	2	8	32111	32118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021841	CTGA	2	8	32411	32418	25 %	25 %	25 %	25 %	525933018
92	NC_021841	CTCG	2	8	32588	32595	0 %	25 %	25 %	50 %	525933019
93	NC_021841	CAGA	2	8	33130	33137	50 %	0 %	25 %	25 %	525933019
94	NC_021841	AAAT	2	8	33138	33145	75 %	25 %	0 %	0 %	525933019
95	NC_021841	GCCA	2	8	33259	33266	25 %	0 %	25 %	50 %	525933019

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.