MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_02

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021841	AAGA	2	8	101	108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021841	TTAC	2	8	537	544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021841	ATTT	2	8	850	857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021841	CATA	2	8	1021	1028	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021841	ATTT	2	8	1213	1220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021841	GAAC	2	8	1350	1357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021841	AGCC	2	8	1715	1722	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021841	CATA	2	8	1801	1808	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021841	AATC	2	8	3004	3011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021841	TACA	2	8	4978	4985	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021841	GGCA	2	8	5522	5529	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021841	ATTG	2	8	5601	5608	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021841	GAAA	2	8	5725	5732	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021841	ATCC	2	8	6456	6463	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021841	CGAA	2	8	7661	7668	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021841	GGCT	2	8	9021	9028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021841	CGAA	2	8	9741	9748	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021841	CGGG	2	8	10153	10160	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021841	CGAA	2	8	11289	11296	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021841	AGTT	2	8	11520	11527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021841	AGAT	2	8	11945	11952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021841	AATT	2	8	12011	12018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021841	CTGA	2	8	12319	12326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021841	ACAG	2	8	13967	13974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021841	TAAT	2	8	14704	14711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021841	CCAG	2	8	15043	15050	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021841	CAGC	2	8	18684	18691	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021841	CGAT	2	8	19711	19718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021841	GCTG	2	8	20590	20597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021841	TAAT	2	8	21119	21126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021841	AATA	2	8	31357	31364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021841	GAAG	2	8	32111	32118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.