MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_02

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021841	ATCC	2	8	2062	2069	25 %	25 %	0 %	50 %	525932972
2	NC_021841	TTAA	2	8	2202	2209	50 %	50 %	0 %	0 %	525932973
3	NC_021841	TAAT	2	8	3183	3190	50 %	50 %	0 %	0 %	525932975
4	NC_021841	AAAG	2	8	3381	3388	75 %	0 %	25 %	0 %	525932975
5	NC_021841	CTAC	2	8	3493	3500	25 %	25 %	0 %	50 %	525932976
6	NC_021841	TACA	2	8	3588	3595	50 %	25 %	0 %	25 %	525932976
7	NC_021841	CTGG	2	8	4092	4099	0 %	25 %	50 %	25 %	525932977
8	NC_021841	AATG	2	8	5136	5143	50 %	25 %	25 %	0 %	525932979
9	NC_021841	AGAC	2	8	5207	5214	50 %	0 %	25 %	25 %	525932979
10	NC_021841	TGAT	2	8	6302	6309	25 %	50 %	25 %	0 %	525932981
11	NC_021841	AGTC	2	8	6756	6763	25 %	25 %	25 %	25 %	525932983
12	NC_021841	TAAT	2	8	6928	6935	50 %	50 %	0 %	0 %	525932983
13	NC_021841	TTAA	2	8	8194	8201	50 %	50 %	0 %	0 %	525932986
14	NC_021841	ATTC	2	8	8264	8271	25 %	50 %	0 %	25 %	525932986
15	NC_021841	AGAA	2	8	9316	9323	75 %	0 %	25 %	0 %	525932988
16	NC_021841	ATTT	2	8	9391	9398	25 %	75 %	0 %	0 %	525932988
17	NC_021841	GTCA	2	8	12874	12881	25 %	25 %	25 %	25 %	525932992
18	NC_021841	ACAA	2	8	15272	15279	75 %	0 %	0 %	25 %	525932995
19	NC_021841	TATT	2	8	15479	15486	25 %	75 %	0 %	0 %	525932996
20	NC_021841	AATG	2	8	16276	16283	50 %	25 %	25 %	0 %	525932997
21	NC_021841	AACG	2	8	16315	16322	50 %	0 %	25 %	25 %	525932997
22	NC_021841	GCGG	2	8	16366	16373	0 %	0 %	75 %	25 %	525932997
23	NC_021841	CTTT	2	8	16515	16522	0 %	75 %	0 %	25 %	525932997
24	NC_021841	GTCT	2	8	17005	17012	0 %	50 %	25 %	25 %	525932998
25	NC_021841	TTCA	2	8	17304	17311	25 %	50 %	0 %	25 %	525932998
26	NC_021841	GTGG	2	8	17891	17898	0 %	25 %	75 %	0 %	525932999
27	NC_021841	CATA	2	8	18143	18150	50 %	25 %	0 %	25 %	525932999
28	NC_021841	CCAT	2	8	19908	19915	25 %	25 %	0 %	50 %	525933001
29	NC_021841	TGTT	2	8	19944	19951	0 %	75 %	25 %	0 %	525933001
30	NC_021841	ATTT	2	8	20304	20311	25 %	75 %	0 %	0 %	525933001
31	NC_021841	AAGC	2	8	20730	20737	50 %	0 %	25 %	25 %	525933002
32	NC_021841	GTAC	2	8	21140	21147	25 %	25 %	25 %	25 %	525933003
33	NC_021841	ACTC	2	8	21508	21515	25 %	25 %	0 %	50 %	525933004
34	NC_021841	CAGG	2	8	21787	21794	25 %	0 %	50 %	25 %	525933004
35	NC_021841	GACA	2	8	22916	22923	50 %	0 %	25 %	25 %	525933004
36	NC_021841	AGGG	2	8	23784	23791	25 %	0 %	75 %	0 %	525933005
37	NC_021841	GCCA	2	8	23848	23855	25 %	0 %	25 %	50 %	525933005
38	NC_021841	TTTC	2	8	23987	23994	0 %	75 %	0 %	25 %	525933005
39	NC_021841	TGTT	2	8	24246	24253	0 %	75 %	25 %	0 %	525933006
40	NC_021841	CTTT	2	8	24554	24561	0 %	75 %	0 %	25 %	525933006
41	NC_021841	AGTT	2	8	24595	24602	25 %	50 %	25 %	0 %	525933007
42	NC_021841	TCCC	2	8	25100	25107	0 %	25 %	0 %	75 %	525933008
43	NC_021841	GAAG	2	8	25173	25180	50 %	0 %	50 %	0 %	525933008
44	NC_021841	ATGA	2	8	25640	25647	50 %	25 %	25 %	0 %	525933009
45	NC_021841	CTCC	2	8	25931	25938	0 %	25 %	0 %	75 %	525933010
46	NC_021841	CTGC	2	8	26930	26937	0 %	25 %	25 %	50 %	525933012
47	NC_021841	GAAA	2	8	27141	27148	75 %	0 %	25 %	0 %	525933012
48	NC_021841	AAAT	2	8	27197	27204	75 %	25 %	0 %	0 %	525933012
49	NC_021841	AATG	2	8	27343	27350	50 %	25 %	25 %	0 %	525933012
50	NC_021841	TCAT	2	8	27416	27423	25 %	50 %	0 %	25 %	525933012
51	NC_021841	TCTT	2	8	28040	28047	0 %	75 %	0 %	25 %	525933012
52	NC_021841	CTGT	2	8	28163	28170	0 %	50 %	25 %	25 %	525933012
53	NC_021841	ATCC	2	8	28177	28184	25 %	25 %	0 %	50 %	525933012
54	NC_021841	AAAT	2	8	28260	28267	75 %	25 %	0 %	0 %	525933012
55	NC_021841	ATCC	2	8	29632	29639	25 %	25 %	0 %	50 %	525933014
56	NC_021841	CTCC	2	8	30061	30068	0 %	25 %	0 %	75 %	525933014
57	NC_021841	TTAC	2	8	30226	30233	25 %	50 %	0 %	25 %	525933014
58	NC_021841	TCTG	2	8	31396	31403	0 %	50 %	25 %	25 %	525933016
59	NC_021841	CTGA	2	8	32411	32418	25 %	25 %	25 %	25 %	525933018
60	NC_021841	CTCG	2	8	32588	32595	0 %	25 %	25 %	50 %	525933019
61	NC_021841	CAGA	2	8	33130	33137	50 %	0 %	25 %	25 %	525933019
62	NC_021841	AAAT	2	8	33138	33145	75 %	25 %	0 %	0 %	525933019
63	NC_021841	GCCA	2	8	33259	33266	25 %	0 %	25 %	50 %	525933019

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.