MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_02

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021841	AT	3	6	610	615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021841	TA	3	6	1499	1504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021841	AC	3	6	1613	1618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021841	TG	3	6	2282	2287	0 %	50 %	50 %	0 %	525932973
5	NC_021841	AT	3	6	2835	2840	50 %	50 %	0 %	0 %	525932974
6	NC_021841	GT	3	6	3020	3025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021841	AT	3	6	3099	3104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021841	CT	3	6	3788	3793	0 %	50 %	0 %	50 %	525932977
9	NC_021841	CT	3	6	3908	3913	0 %	50 %	0 %	50 %	525932977
10	NC_021841	GT	3	6	9143	9148	0 %	50 %	50 %	0 %	525932988
11	NC_021841	AC	3	6	10049	10054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021841	AC	3	6	10089	10094	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021841	GA	3	6	10210	10215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021841	CT	3	6	10577	10582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021841	TA	3	6	12977	12982	50 %	50 %	0 %	0 %	525932992
16	NC_021841	TA	3	6	13091	13096	50 %	50 %	0 %	0 %	525932992
17	NC_021841	AG	3	6	13539	13544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021841	GA	3	6	13586	13591	50 %	0 %	50 %	0 %	525932993
19	NC_021841	GT	4	8	14515	14522	0 %	50 %	50 %	0 %	525932994
20	NC_021841	TA	3	6	14810	14815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021841	TA	4	8	14852	14859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021841	TA	3	6	15262	15267	50 %	50 %	0 %	0 %	525932995
23	NC_021841	CA	3	6	15391	15396	50 %	0 %	0 %	50 %	525932995
24	NC_021841	GT	3	6	15461	15466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021841	GT	3	6	15800	15805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021841	GT	3	6	15929	15934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021841	GT	3	6	16245	16250	0 %	50 %	50 %	0 %	525932997
28	NC_021841	GT	3	6	16629	16634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021841	GT	3	6	16700	16705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021841	CG	3	6	16871	16876	0 %	0 %	50 %	50 %	525932998
31	NC_021841	CA	3	6	17026	17031	50 %	0 %	0 %	50 %	525932998
32	NC_021841	GA	3	6	17374	17379	50 %	0 %	50 %	0 %	525932998
33	NC_021841	GA	3	6	17468	17473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021841	TC	3	6	18075	18080	0 %	50 %	0 %	50 %	525932999
35	NC_021841	AT	3	6	18869	18874	50 %	50 %	0 %	0 %	525933000
36	NC_021841	AT	3	6	18908	18913	50 %	50 %	0 %	0 %	525933000
37	NC_021841	CA	3	6	23771	23776	50 %	0 %	0 %	50 %	525933005
38	NC_021841	TA	3	6	24097	24102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021841	TA	3	6	24479	24484	50 %	50 %	0 %	0 %	525933006
40	NC_021841	CA	3	6	25031	25036	50 %	0 %	0 %	50 %	525933007
41	NC_021841	TC	3	6	29042	29047	0 %	50 %	0 %	50 %	525933013
42	NC_021841	TG	3	6	29811	29816	0 %	50 %	50 %	0 %	525933014
43	NC_021841	TA	3	6	31706	31711	50 %	50 %	0 %	0 %	525933016
44	NC_021841	CA	3	6	32170	32175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021841	AT	3	6	33009	33014	50 %	50 %	0 %	0 %	525933019
46	NC_021841	TC	3	6	35108	35113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.