MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_02

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021841	T	6	6	126	131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021841	T	6	6	633	638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021841	A	6	6	893	898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021841	T	6	6	949	954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021841	T	7	7	1135	1141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021841	A	7	7	1601	1607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021841	T	6	6	2293	2298	0 %	100 %	0 %	0 %	525932973
8	NC_021841	T	8	8	2340	2347	0 %	100 %	0 %	0 %	525932973
9	NC_021841	A	6	6	3121	3126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021841	T	7	7	3398	3404	0 %	100 %	0 %	0 %	525932975
11	NC_021841	T	6	6	3808	3813	0 %	100 %	0 %	0 %	525932977
12	NC_021841	T	6	6	4069	4074	0 %	100 %	0 %	0 %	525932977
13	NC_021841	T	6	6	4315	4320	0 %	100 %	0 %	0 %	525932977
14	NC_021841	T	6	6	5176	5181	0 %	100 %	0 %	0 %	525932979
15	NC_021841	A	6	6	5730	5735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021841	T	7	7	6405	6411	0 %	100 %	0 %	0 %	525932981
17	NC_021841	A	6	6	6509	6514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021841	T	7	7	6536	6542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021841	T	7	7	7599	7605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021841	T	6	6	7630	7635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021841	T	6	6	8066	8071	0 %	100 %	0 %	0 %	525932985
22	NC_021841	T	7	7	8144	8150	0 %	100 %	0 %	0 %	525932985
23	NC_021841	T	6	6	8407	8412	0 %	100 %	0 %	0 %	525932986
24	NC_021841	T	7	7	8613	8619	0 %	100 %	0 %	0 %	525932987
25	NC_021841	A	7	7	8942	8948	100 %	0 %	0 %	0 %	525932987
26	NC_021841	T	6	6	9199	9204	0 %	100 %	0 %	0 %	525932988
27	NC_021841	T	7	7	9576	9582	0 %	100 %	0 %	0 %	525932988
28	NC_021841	T	7	7	9679	9685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021841	T	6	6	9710	9715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021841	C	6	6	10363	10368	0 %	0 %	0 %	100 %	525932989
31	NC_021841	A	6	6	10583	10588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021841	T	8	8	11057	11064	0 %	100 %	0 %	0 %	525932991
33	NC_021841	A	7	7	11176	11182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021841	T	8	8	11252	11259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021841	A	6	6	11894	11899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021841	T	7	7	11919	11925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021841	T	6	6	11934	11939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021841	T	6	6	11993	11998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021841	T	6	6	12155	12160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021841	T	6	6	12181	12186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021841	A	9	9	12405	12413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021841	A	8	8	12774	12781	100 %	0 %	0 %	0 %	525932992
43	NC_021841	A	8	8	13245	13252	100 %	0 %	0 %	0 %	525932992
44	NC_021841	A	7	7	13332	13338	100 %	0 %	0 %	0 %	525932992
45	NC_021841	T	6	6	13511	13516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021841	A	6	6	14109	14114	100 %	0 %	0 %	0 %	525932994
47	NC_021841	A	6	6	14496	14501	100 %	0 %	0 %	0 %	525932994
48	NC_021841	T	6	6	14540	14545	0 %	100 %	0 %	0 %	525932994
49	NC_021841	T	7	7	14833	14839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021841	T	6	6	16048	16053	0 %	100 %	0 %	0 %	525932997
51	NC_021841	A	6	6	16808	16813	100 %	0 %	0 %	0 %	525932998
52	NC_021841	T	7	7	17555	17561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021841	A	8	8	17625	17632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021841	T	6	6	17642	17647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021841	G	6	6	17952	17957	0 %	0 %	100 %	0 %	525932999
56	NC_021841	A	7	7	17993	17999	100 %	0 %	0 %	0 %	525932999
57	NC_021841	A	6	6	18415	18420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021841	A	6	6	18950	18955	100 %	0 %	0 %	0 %	525933000
59	NC_021841	T	6	6	20157	20162	0 %	100 %	0 %	0 %	525933001
60	NC_021841	T	7	7	20529	20535	0 %	100 %	0 %	0 %	525933001
61	NC_021841	T	6	6	21926	21931	0 %	100 %	0 %	0 %	525933004
62	NC_021841	T	6	6	21956	21961	0 %	100 %	0 %	0 %	525933004
63	NC_021841	T	6	6	22579	22584	0 %	100 %	0 %	0 %	525933004
64	NC_021841	T	7	7	22657	22663	0 %	100 %	0 %	0 %	525933004
65	NC_021841	A	6	6	23671	23676	100 %	0 %	0 %	0 %	525933005
66	NC_021841	T	6	6	25879	25884	0 %	100 %	0 %	0 %	525933010
67	NC_021841	A	7	7	25900	25906	100 %	0 %	0 %	0 %	525933010
68	NC_021841	T	6	6	26051	26056	0 %	100 %	0 %	0 %	525933010
69	NC_021841	A	6	6	26115	26120	100 %	0 %	0 %	0 %	525933011
70	NC_021841	T	6	6	27159	27164	0 %	100 %	0 %	0 %	525933012
71	NC_021841	A	6	6	28702	28707	100 %	0 %	0 %	0 %	525933013
72	NC_021841	A	6	6	28730	28735	100 %	0 %	0 %	0 %	525933013
73	NC_021841	T	7	7	28940	28946	0 %	100 %	0 %	0 %	525933013
74	NC_021841	T	7	7	30458	30464	0 %	100 %	0 %	0 %	525933014
75	NC_021841	C	6	6	31379	31384	0 %	0 %	0 %	100 %	525933016
76	NC_021841	T	7	7	31541	31547	0 %	100 %	0 %	0 %	525933016
77	NC_021841	T	6	6	31859	31864	0 %	100 %	0 %	0 %	525933016
78	NC_021841	T	6	6	32048	32053	0 %	100 %	0 %	0 %	525933016
79	NC_021841	A	8	8	32554	32561	100 %	0 %	0 %	0 %	525933018
80	NC_021841	T	7	7	34578	34584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.