MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 367

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021840	AACCT	2	10	5838	5847	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021840	ATAAA	2	10	17814	17823	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021840	CTTTT	2	10	27472	27481	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021840	TAAAA	2	10	32265	32274	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021840	GAACA	2	10	40826	40835	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021840	GTAAG	2	10	45930	45939	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021840	TATTT	2	10	55393	55402	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021840	AAAGA	2	10	55547	55556	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021840	GAGTA	2	10	64690	64699	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021840	ATCTT	2	10	70029	70038	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021840	ATGAA	2	10	72886	72895	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021840	ATAAA	2	10	99670	99679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021840	ATGAT	2	10	99711	99720	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021840	TAATT	2	10	99888	99897	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021840	TCGTG	2	10	101047	101056	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021840	AAGGT	2	10	102517	102526	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021840	TAATT	2	10	105909	105918	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021840	TCGTG	2	10	107068	107077	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021840	AAGGT	2	10	108536	108545	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021840	GGCAT	2	10	125829	125838	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021840	AGTGA	2	10	147945	147954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021840	TAAAA	2	10	148523	148532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021840	TGGCT	2	10	157172	157181	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021840	ACTAA	2	10	158548	158557	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021840	TATAA	2	10	163774	163783	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021840	AAAGA	2	10	167002	167011	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021840	TTATT	2	10	189558	189567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021840	TAGAT	2	10	191985	191994	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021840	TAAAA	2	10	203773	203782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021840	AATAA	2	10	217961	217970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021840	ATTGT	2	10	219319	219328	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021840	TTTTA	2	10	229326	229335	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021840	AGGAG	2	10	232717	232726	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021840	ATAGA	2	10	233021	233030	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021840	AAATG	2	10	241899	241908	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021840	CACAC	2	10	242833	242842	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_021840	AAATT	2	10	243463	243472	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021840	GTGAT	2	10	258113	258122	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021840	AAAAC	2	10	259926	259935	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021840	CAAAA	2	10	280798	280807	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021840	TAGAT	2	10	290023	290032	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021840	AGGTG	2	10	312075	312084	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021840	GGAAA	2	10	317200	317209	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021840	AAATC	2	10	334428	334437	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021840	GCCTA	2	10	340541	340550	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_021840	AACAT	2	10	341705	341714	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021840	CTTAT	2	10	346961	346970	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_021840	TTTAT	2	10	357288	357297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021840	TTTCT	2	10	361661	361670	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021840	AATTT	2	10	378019	378028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021840	ATAGT	2	10	378054	378063	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021840	TTATT	2	10	382121	382130	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021840	CTATG	2	10	382287	382296	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021840	ATACA	2	10	387382	387391	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021840	AAAAC	2	10	412213	412222	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021840	GTTTT	2	10	412235	412244	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021840	AAACA	2	10	414741	414750	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021840	TATAG	2	10	424543	424552	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021840	GAAAA	2	10	428652	428661	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021840	TAGAC	2	10	444861	444870	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021840	TAAAA	2	10	450790	450799	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021840	CTATG	2	10	458226	458235	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021840	AAAGA	2	10	463680	463689	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021840	ATAAA	2	10	478651	478660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021840	AGAAT	2	10	479521	479530	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021840	TGGAA	2	10	479649	479658	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021840	AATCA	2	10	482652	482661	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_021840	TATAA	2	10	490572	490581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021840	ATTGA	2	10	490610	490619	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021840	ATTAA	2	10	503918	503927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021840	ATATA	2	10	535364	535373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021840	ATTTT	2	10	538066	538075	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021840	TACAT	2	10	538503	538512	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021840	TATAA	2	10	539557	539566	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021840	GAAAT	2	10	560745	560754	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021840	TTACT	2	10	568767	568776	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021840	ATTTA	2	10	574419	574428	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021840	GGGGA	2	10	584172	584181	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021840	TATTT	2	10	590410	590419	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021840	AGAGA	2	10	590560	590569	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021840	CTTTT	2	10	591535	591544	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021840	CTTTT	2	10	641178	641187	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_021840	TAGTT	2	10	641191	641200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021840	TGAAA	2	10	660085	660094	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021840	AATGA	2	10	677177	677186	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021840	TAATA	2	10	697488	697497	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021840	ATTTT	2	10	697646	697655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021840	GTTTT	2	10	700175	700184	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021840	GTATA	2	10	702938	702947	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021840	AATAA	2	10	707352	707361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021840	ATTTT	2	10	710938	710947	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021840	GTTTT	2	10	723874	723883	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021840	AAATT	2	10	724951	724960	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021840	AGGAA	2	10	725474	725483	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021840	GATGA	2	10	737564	737573	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021840	ATAGA	2	10	746225	746234	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021840	ATCTT	2	10	747405	747414	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_021840	TAATT	2	10	751613	751622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021840	ATTTT	2	10	751880	751889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021840	AATGT	2	10	759281	759290	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021840	TTATA	2	10	783018	783027	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021840	ATAAC	2	10	799009	799018	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021840	TTTTA	2	10	800474	800483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021840	ATAGA	2	10	804386	804395	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021840	TATAA	2	10	818647	818656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021840	TGAAA	2	10	828140	828149	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021840	TTTTA	2	10	834476	834485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021840	TTTAT	2	10	834768	834777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021840	ATGAG	2	10	854541	854550	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021840	TTTTA	2	10	861674	861683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021840	TAAAA	2	10	861739	861748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021840	TATAA	2	10	876209	876218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021840	TCTAT	2	10	888980	888989	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021840	AGATA	2	10	892669	892678	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021840	GAGAG	2	10	901610	901619	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021840	AAATG	2	10	906268	906277	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021840	TTCTA	2	10	906283	906292	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021840	TTTTC	2	10	910168	910177	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_021840	AGTTT	2	10	920062	920071	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021840	CAAAA	2	10	922428	922437	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_021840	ACTAA	2	10	922607	922616	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021840	TAGGA	2	10	937054	937063	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021840	GTTTT	2	10	937064	937073	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021840	TAAAC	2	10	941078	941087	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021840	CTTTT	2	10	941562	941571	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_021840	AAAGC	2	10	947493	947502	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_021840	TTATT	2	10	947536	947545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021840	AAGTT	2	10	951238	951247	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021840	ATAAA	2	10	951292	951301	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021840	GCTAT	2	10	952164	952173	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021840	AATAA	2	10	954225	954234	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021840	AGTTT	2	10	988461	988470	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021840	AAATT	2	10	990243	990252	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021840	TTGAA	2	10	995437	995446	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021840	TTGAT	2	10	1021181	1021190	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021840	AAATA	2	10	1049293	1049302	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021840	TAAAA	2	10	1082969	1082978	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021840	ATTTT	2	10	1084563	1084572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021840	TATAA	2	10	1117460	1117469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021840	TAAAA	2	10	1117528	1117537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021840	CTTTA	2	10	1117745	1117754	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021840	CTATA	2	10	1117933	1117942	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021840	TCTTA	2	10	1118528	1118537	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_021840	TTTAG	2	10	1121069	1121078	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021840	ACTTG	2	10	1124955	1124964	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021840	AAAGA	2	10	1127450	1127459	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021840	TACTA	2	10	1136433	1136442	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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149	NC_021840	ATTTA	2	10	1142851	1142860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_021840	TTTAT	2	10	1558956	1558965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_021840	TTGTT	2	10	2196325	2196334	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
284	NC_021840	ATGGT	2	10	2207348	2207357	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_021840	AAGAT	2	10	2211549	2211558	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_021840	TATTT	2	10	2214178	2214187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_021840	TTTCC	2	10	2219515	2219524	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
289	NC_021840	ATAAA	2	10	2221532	2221541	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021840	TTTGC	2	10	2221669	2221678	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
291	NC_021840	TAAAA	2	10	2248812	2248821	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_021840	TTCAT	2	10	2261642	2261651	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
293	NC_021840	AAATA	2	10	2288822	2288831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_021840	CTTAT	2	10	2288839	2288848	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
295	NC_021840	GTTAC	2	10	2303172	2303181	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
296	NC_021840	AAATA	2	10	2303285	2303294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_021840	TGTTT	2	10	2309128	2309137	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_021840	AAATT	2	10	2316675	2316684	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_021840	AACTT	2	10	2334519	2334528	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
301	NC_021840	TAATT	2	10	2345861	2345870	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_021840	TCGTG	2	10	2347020	2347029	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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310	NC_021840	TATAT	2	10	2447636	2447645	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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330	NC_021840	AGTAA	2	10	2666569	2666578	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.