MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 42330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021840	AGC	2	6	40	45	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021840	TGG	2	6	200	205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021840	AAG	2	6	242	247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021840	ACA	2	6	350	355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021840	AGT	2	6	561	566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021840	GAG	2	6	599	604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021840	CGG	2	6	859	864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021840	GAG	2	6	1111	1116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021840	TGG	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021840	TAC	2	6	1129	1134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021840	CCT	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021840	GGT	2	6	1353	1358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021840	TCG	2	6	1468	1473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021840	CGT	2	6	1548	1553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021840	GAG	2	6	1597	1602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021840	GTT	2	6	1651	1656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021840	TTC	2	6	1749	1754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021840	GAT	2	6	1775	1780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021840	TCT	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021840	CAA	2	6	1918	1923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021840	ATT	2	6	2065	2070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021840	CTA	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934213
23	NC_021840	ATA	2	6	2354	2359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934213
24	NC_021840	ATT	2	6	2401	2406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934213
25	NC_021840	TTA	2	6	2459	2464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934213
26	NC_021840	GAT	2	6	2556	2561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934213
27	NC_021840	ATT	2	6	2611	2616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934213
28	NC_021840	GGT	2	6	2668	2673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934213
29	NC_021840	CTT	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021840	TAA	2	6	2802	2807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021840	ATT	2	6	2883	2888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021840	CTG	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934214
33	NC_021840	ATT	3	9	3083	3091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934214
34	NC_021840	GCG	2	6	3107	3112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934214
35	NC_021840	GAC	2	6	3139	3144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934214
36	NC_021840	GTG	2	6	3261	3266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934214
37	NC_021840	GCG	2	6	3287	3292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934214
38	NC_021840	AGA	2	6	3355	3360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934214
39	NC_021840	AGT	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934214
40	NC_021840	TAT	2	6	3425	3430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934215
41	NC_021840	TGG	2	6	3431	3436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934215
42	NC_021840	GCG	2	6	3465	3470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934215
43	NC_021840	TAT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934215
44	NC_021840	GCT	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934215
45	NC_021840	ATT	2	6	3546	3551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934215
46	NC_021840	ATG	2	6	3559	3564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934215
47	NC_021840	ATG	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934215
48	NC_021840	CTG	2	6	3817	3822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934215
49	NC_021840	ACG	2	6	3847	3852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934215
50	NC_021840	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934215
51	NC_021840	CAG	2	6	3895	3900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934215
52	NC_021840	TTG	2	6	3906	3911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934215
53	NC_021840	ATA	2	6	4033	4038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934215
54	NC_021840	GAA	2	6	4095	4100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934215
55	NC_021840	GCA	2	6	4259	4264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934215
56	NC_021840	TTG	2	6	4276	4281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934215
57	NC_021840	ATT	2	6	4396	4401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934215
58	NC_021840	AGA	2	6	4487	4492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934215
59	NC_021840	GGA	2	6	4514	4519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021840	AGA	2	6	4655	4660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934216
61	NC_021840	ATG	2	6	4732	4737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934216
62	NC_021840	ATT	2	6	4896	4901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934216
63	NC_021840	CTA	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934216
64	NC_021840	AAC	2	6	5138	5143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934216
65	NC_021840	GAA	2	6	5283	5288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934216
66	NC_021840	ATT	2	6	5460	5465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934216
67	NC_021840	GGC	2	6	5636	5641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934216
68	NC_021840	ATG	2	6	5644	5649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934216
69	NC_021840	TAG	2	6	5704	5709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934216
70	NC_021840	ATT	2	6	5724	5729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934216
71	NC_021840	GAA	2	6	5745	5750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934216
72	NC_021840	GAA	2	6	5783	5788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934216
73	NC_021840	AGA	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934217
74	NC_021840	GAT	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934217
75	NC_021840	TAA	2	6	6046	6051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934217
76	NC_021840	AAG	2	6	6144	6149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934217
77	NC_021840	ATT	2	6	6155	6160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934217
78	NC_021840	GTT	2	6	6173	6178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934217
79	NC_021840	AGA	2	6	6220	6225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934217
80	NC_021840	TAG	2	6	6249	6254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934217
81	NC_021840	GAT	2	6	6269	6274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934217
82	NC_021840	ATG	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934217
83	NC_021840	GCT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934217
84	NC_021840	TAA	2	6	6373	6378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934217
85	NC_021840	ATT	2	6	6391	6396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934217
86	NC_021840	TCG	2	6	6544	6549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934217
87	NC_021840	AGG	2	6	6615	6620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934217
88	NC_021840	AGA	2	6	6729	6734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934218
89	NC_021840	AGG	2	6	6863	6868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934218
90	NC_021840	GAG	2	6	6955	6960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934219
91	NC_021840	TAT	2	6	7077	7082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934219
92	NC_021840	AAT	2	6	7192	7197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934219
93	NC_021840	AAG	2	6	7268	7273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934219
94	NC_021840	ATT	2	6	7313	7318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934219
95	NC_021840	ATA	2	6	7352	7357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934219
96	NC_021840	ATG	2	6	7450	7455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934219
97	NC_021840	AGA	2	6	7476	7481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934219
98	NC_021840	ATT	2	6	7483	7488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934219
99	NC_021840	AGG	2	6	7538	7543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934219
100	NC_021840	ATC	2	6	7851	7856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934220
101	NC_021840	CGG	2	6	7897	7902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934220
102	NC_021840	TGG	2	6	8059	8064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934220
103	NC_021840	GAA	2	6	8252	8257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934220
104	NC_021840	AAC	3	9	8262	8270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934220
105	NC_021840	CTG	2	6	8274	8279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934220
106	NC_021840	TTG	2	6	8309	8314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934220
107	NC_021840	GAT	2	6	8450	8455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
108	NC_021840	GAA	2	6	8549	8554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934220
109	NC_021840	TGT	2	6	8590	8595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934220
110	NC_021840	GAT	2	6	8612	8617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
111	NC_021840	ATT	2	6	8630	8635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934220
112	NC_021840	CAT	2	6	8636	8641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934220
113	NC_021840	AGT	2	6	8647	8652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
114	NC_021840	AGA	2	6	8680	8685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934220
115	NC_021840	AAG	2	6	8739	8744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934220
116	NC_021840	TGT	2	6	8872	8877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934220
117	NC_021840	GCG	2	6	8891	8896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934220
118	NC_021840	GCG	2	6	9005	9010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934220
119	NC_021840	TAG	2	6	9237	9242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
120	NC_021840	CAA	2	6	9350	9355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934220
121	NC_021840	CAA	2	6	9410	9415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934220
122	NC_021840	AGC	2	6	9610	9615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934220
123	NC_021840	GTA	2	6	9659	9664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
124	NC_021840	GAT	2	6	9671	9676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
125	NC_021840	AAC	2	6	9718	9723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934220
126	NC_021840	GAA	2	6	9784	9789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934221
127	NC_021840	ATC	2	6	9812	9817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934221
128	NC_021840	TAT	2	6	9838	9843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934221
129	NC_021840	ACA	2	6	9858	9863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934221
130	NC_021840	AAG	2	6	9872	9877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934221
131	NC_021840	AGC	2	6	9984	9989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934221
132	NC_021840	TTC	2	6	10068	10073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934221
133	NC_021840	AGA	3	9	10131	10139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934221
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140	NC_021840	GCG	2	6	10882	10887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934221
141	NC_021840	CCA	2	6	10912	10917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934221
142	NC_021840	ATT	2	6	10979	10984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934221
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244	NC_021840	ATA	2	6	17740	17745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934228
245	NC_021840	TAA	2	6	17785	17790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_021840	TCA	2	6	17804	17809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_021840	TAA	2	6	17911	17916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_021840	GGA	2	6	17938	17943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
249	NC_021840	TAT	2	6	18034	18039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934229
250	NC_021840	TGG	2	6	18040	18045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934229
251	NC_021840	ATT	2	6	18088	18093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934229
252	NC_021840	AGT	2	6	18175	18180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934229
253	NC_021840	CAG	2	6	18270	18275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934229
254	NC_021840	GCT	2	6	18515	18520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934229
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256	NC_021840	ATT	2	6	18560	18565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934229
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258	NC_021840	GTA	2	6	18635	18640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_021840	TGG	2	6	18667	18672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_021840	GAA	2	6	20903	20908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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