MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 4065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021840	AGC	2	6	40	45	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021840	TGG	2	6	200	205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021840	AAG	2	6	242	247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021840	ACA	2	6	350	355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021840	AGT	2	6	561	566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021840	GAG	2	6	599	604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021840	CGG	2	6	859	864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021840	GAG	2	6	1111	1116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021840	TGG	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021840	TAC	2	6	1129	1134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021840	CCT	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021840	GGT	2	6	1353	1358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021840	TCG	2	6	1468	1473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021840	CGT	2	6	1548	1553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021840	GAG	2	6	1597	1602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021840	GTT	2	6	1651	1656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021840	TTC	2	6	1749	1754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021840	GAT	2	6	1775	1780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021840	TCT	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021840	CAA	2	6	1918	1923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021840	ATT	2	6	2065	2070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021840	CTT	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021840	TAA	2	6	2802	2807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021840	ATT	2	6	2883	2888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021840	GGA	2	6	4514	4519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021840	GAG	2	6	11186	11191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021840	ATT	2	6	15757	15762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021840	TAA	2	6	17785	17790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021840	TCA	2	6	17804	17809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021840	TAA	2	6	17911	17916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021840	GGA	2	6	17938	17943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021840	GTA	2	6	18635	18640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021840	TGG	2	6	18667	18672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021840	GAA	2	6	20903	20908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021840	TGT	2	6	24066	24071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021840	TTC	2	6	24094	24099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021840	GTA	2	6	24130	24135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021840	AGG	2	6	24149	24154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021840	AGG	2	6	24465	24470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021840	GCT	2	6	27402	27407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021840	AAC	2	6	27483	27488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021840	ATT	2	6	28522	28527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021840	TAA	2	6	30802	30807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021840	TAA	2	6	30823	30828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021840	ATC	2	6	30965	30970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021840	CTT	2	6	31004	31009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021840	GGA	2	6	31061	31066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021840	GTT	2	6	31650	31655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021840	GAT	2	6	32157	32162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021840	TCC	2	6	32167	32172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_021840	ATT	2	6	32181	32186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021840	TAC	2	6	32193	32198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021840	CTT	2	6	32289	32294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021840	GTA	2	6	32301	32306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021840	ATA	2	6	32326	32331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021840	GGA	2	6	32345	32350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021840	GGA	2	6	32983	32988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021840	GGA	3	9	36525	36533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021840	ATA	2	6	37428	37433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021840	TAG	2	6	39655	39660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021840	GAG	2	6	39662	39667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021840	AAG	3	9	40807	40815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021840	ATT	2	6	41038	41043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021840	GAA	2	6	41758	41763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021840	GAT	2	6	43313	43318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021840	TAT	2	6	45874	45879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021840	TAC	2	6	45917	45922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021840	AAT	2	6	45971	45976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021840	AGG	2	6	46012	46017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021840	CTC	2	6	52986	52991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_021840	TCC	2	6	55199	55204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_021840	TTA	2	6	55353	55358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021840	TAT	2	6	55364	55369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021840	AGA	2	6	55491	55496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021840	TGT	2	6	55569	55574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021840	AGG	2	6	55610	55615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021840	GTT	2	6	61051	61056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021840	TAA	2	6	61064	61069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021840	AGA	2	6	63213	63218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021840	TAA	2	6	63221	63226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021840	AGA	2	6	67469	67474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021840	AGG	2	6	67525	67530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021840	GAT	2	6	68231	68236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021840	TAA	2	6	70042	70047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021840	TAA	2	6	70082	70087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021840	ATT	2	6	70118	70123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021840	ATT	2	6	70151	70156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021840	TAT	2	6	70869	70874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021840	CAT	2	6	70932	70937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021840	AGG	2	6	71631	71636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021840	TTA	2	6	71667	71672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021840	AAG	2	6	71745	71750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021840	ATT	2	6	72871	72876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021840	TAT	2	6	76262	76267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021840	AGG	2	6	76356	76361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021840	GCT	2	6	77192	77197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021840	TAG	2	6	78343	78348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021840	CCT	2	6	79948	79953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_021840	TAC	2	6	79979	79984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021840	TAA	2	6	79994	79999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021840	AGA	2	6	80023	80028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021840	ACT	2	6	80424	80429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021840	GCT	2	6	80435	80440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021840	ATG	2	6	80472	80477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021840	TGG	2	6	81873	81878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021840	AGG	2	6	82298	82303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021840	TTC	2	6	82915	82920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021840	ATA	2	6	83868	83873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021840	ATA	2	6	83894	83899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021840	TCC	2	6	85591	85596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_021840	TAG	2	6	90055	90060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021840	AGG	2	6	90098	90103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021840	CCT	2	6	92645	92650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_021840	GTG	2	6	92676	92681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021840	TAC	2	6	92781	92786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021840	TAA	3	9	94793	94801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021840	TTC	3	9	96553	96561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021840	TAT	2	6	96562	96567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021840	TAT	2	6	99031	99036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021840	ATA	2	6	99041	99046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021840	ATT	2	6	99047	99052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021840	AGC	2	6	99644	99649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021840	GTT	2	6	99688	99693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021840	AGA	3	9	99800	99808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021840	CAA	2	6	99872	99877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021840	GGC	2	6	100006	100011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021840	GGA	2	6	100040	100045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021840	GCA	2	6	100327	100332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021840	CGC	2	6	100374	100379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_021840	GAA	2	6	100386	100391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021840	TGT	2	6	100413	100418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021840	AGA	2	6	100422	100427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021840	CAG	2	6	100495	100500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021840	AGA	2	6	100636	100641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021840	GGA	2	6	100686	100691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021840	TGC	2	6	100831	100836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021840	GAA	2	6	100950	100955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021840	GGT	2	6	101024	101029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021840	GTC	2	6	101038	101043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021840	GGA	2	6	101149	101154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021840	ATC	2	6	101173	101178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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