MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 1091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021839	TTTACC	2	12	3430	3441	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525929674
2	NC_021839	AGTAAA	2	12	10687	10698	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525929680
3	NC_021839	GTACGT	2	12	11493	11504	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525929682
4	NC_021839	AAGTCG	2	12	16763	16774	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525929687
5	NC_021839	ACAGTA	2	12	18116	18127	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525929690
6	NC_021839	AAAACA	2	12	18491	18502	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525929691
7	NC_021839	GCATGG	2	12	18672	18683	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525929691
8	NC_021839	CTGTAG	2	12	21616	21627	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525929696
9	NC_021839	GACAAT	2	12	23128	23139	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525929698
10	NC_021839	GTGAGC	2	12	23583	23594	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525929698
11	NC_021839	ATTGAT	2	12	23777	23788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525929698
12	NC_021839	TAAAAA	2	12	24847	24858	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525932159
13	NC_021839	TGAATC	2	12	25632	25643	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525932160
14	NC_021839	GCTACT	2	12	27324	27335	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525932161
15	NC_021839	TTCTGA	2	12	30398	30409	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525929699
16	NC_021839	TTCGTG	2	12	39370	39381	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525929701
17	NC_021839	CCAAAT	2	12	45354	45365	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525932166
18	NC_021839	AGAACT	2	12	47951	47962	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525932168
19	NC_021839	TACAAG	2	12	52195	52206	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525929707
20	NC_021839	CGAAAT	2	12	52249	52260	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525929707
21	NC_021839	CATTAT	2	12	55979	55990	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525929709
22	NC_021839	TCTTTT	2	12	56440	56451	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525929709
23	NC_021839	TTTACC	2	12	57840	57851	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525929710
24	NC_021839	ATCAAT	2	12	58847	58858	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525929711
25	NC_021839	ATGAAA	2	12	59205	59216	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525929712
26	NC_021839	GCTTTT	2	12	60548	60559	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525929714
27	NC_021839	CTTTTA	2	12	61077	61088	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525929714
28	NC_021839	TAGAAA	2	12	62023	62034	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525929715
29	NC_021839	ACGTTG	2	12	63952	63963	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525929717
30	NC_021839	GAAAAC	2	12	65859	65870	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525929718
31	NC_021839	TTTTGA	2	12	71521	71532	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525929724
32	NC_021839	GAAGGG	2	12	76623	76634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525929728
33	NC_021839	AGAACC	2	12	79657	79668	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525929731
34	NC_021839	GATTCA	2	12	80264	80275	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525929731
35	NC_021839	GCAATT	2	12	80294	80305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525929731
36	NC_021839	TCTGTT	2	12	85203	85214	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525929735
37	NC_021839	GAACCA	2	12	87098	87109	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525929736
38	NC_021839	TCCATT	2	12	89706	89717	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525929739
39	NC_021839	GTAGAT	2	12	94892	94903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932176
40	NC_021839	TGAAAA	2	12	98901	98912	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525932180
41	NC_021839	TATCTG	2	12	99923	99934	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525932182
42	NC_021839	ATATGA	2	12	101074	101085	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525932183
43	NC_021839	TGCGGG	2	12	102581	102592	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	525929741
44	NC_021839	CTGGTT	2	12	104106	104117	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525929743
45	NC_021839	TAGTTG	2	12	108282	108293	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525932184
46	NC_021839	AGAAAA	2	12	112948	112959	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525929751
47	NC_021839	GACTTA	2	12	114768	114779	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525932185
48	NC_021839	TAGATT	2	12	120651	120662	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525932186
49	NC_021839	CGCCAG	2	12	123719	123730	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525932187
50	NC_021839	CGCCAG	2	12	123959	123970	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525932187
51	NC_021839	CAGAAA	2	12	125156	125167	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525932188
52	NC_021839	AGAAGC	2	12	125229	125240	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525932188
53	NC_021839	GAGAAA	2	12	128314	128325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932188
54	NC_021839	AATTTG	2	12	133282	133293	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525932189
55	NC_021839	AAAAGA	2	12	148672	148683	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525929771
56	NC_021839	AATACA	2	12	149909	149920	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525929771
57	NC_021839	CGGAAA	2	12	150312	150323	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525929772
58	NC_021839	CTGACC	2	12	153817	153828	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525929773
59	NC_021839	AATGAA	2	12	154492	154503	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525929774
60	NC_021839	GATTTC	2	12	159909	159920	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525929780
61	NC_021839	TATAAA	2	12	163029	163040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929783
62	NC_021839	GAAATG	2	12	165671	165682	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525932202
63	NC_021839	TATCAA	2	12	171846	171857	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525929790
64	NC_021839	TAACAA	2	12	173909	173920	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525929793
65	NC_021839	GCAGAA	2	12	176959	176970	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525929796
66	NC_021839	TTTTTG	2	12	179349	179360	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525929799
67	NC_021839	GTAACC	2	12	181498	181509	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525932211
68	NC_021839	GGTATT	2	12	184920	184931	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525929801
69	NC_021839	TGCGGA	2	12	191533	191544	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525929807
70	NC_021839	TGGTAT	2	12	193425	193436	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525929809
71	NC_021839	TTTTAT	2	12	193470	193481	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525929809
72	NC_021839	GTACGA	2	12	193554	193565	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525929809
73	NC_021839	TGCAGC	2	12	201719	201730	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525929815
74	NC_021839	TTGGTA	2	12	203465	203476	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525929817
75	NC_021839	AAAGTA	2	12	204779	204790	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525929818
76	NC_021839	AAGAAA	2	12	210715	210726	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525929825
77	NC_021839	AAAGTG	2	12	211375	211386	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525929826
78	NC_021839	TAGCAC	2	12	212238	212249	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525929828
79	NC_021839	CTTGGT	2	12	212672	212683	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525929828
80	NC_021839	GCAAAA	2	12	218902	218913	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525932217
81	NC_021839	GAATTC	2	12	220495	220506	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525932217
82	NC_021839	AAAGGA	2	12	222751	222762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
83	NC_021839	GATGAA	2	12	224721	224732	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525932217
84	NC_021839	GACCCA	2	12	224980	224991	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525932217
85	NC_021839	TAAAAA	2	12	225549	225560	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525932218
86	NC_021839	GGATAC	2	12	226026	226037	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525932218
87	NC_021839	GACCCA	2	12	226713	226724	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525932219
88	NC_021839	AATTAG	2	12	227183	227194	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525932220
89	NC_021839	TAGAGG	2	12	227280	227291	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525932221
90	NC_021839	AGCCAA	2	12	228367	228378	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525932222
91	NC_021839	GACCCA	2	12	228479	228490	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525932222
92	NC_021839	AAAATT	2	12	228950	228961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932222
93	NC_021839	TGATGG	2	12	230031	230042	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525932224
94	NC_021839	GATGAA	2	12	230091	230102	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525932224
95	NC_021839	TCAAAC	2	12	230759	230770	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525932224
96	NC_021839	AGATTT	2	12	234796	234807	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525932230
97	NC_021839	TTGATG	2	12	235893	235904	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525932230
98	NC_021839	AAAAGC	2	12	237361	237372	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525932231
99	NC_021839	GGATTT	2	12	240323	240334	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525932232
100	NC_021839	AATCAA	2	12	245792	245803	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525929838
101	NC_021839	CTTATG	2	12	247219	247230	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525929839
102	NC_021839	CTGTTT	2	12	249764	249775	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525929842
103	NC_021839	CGTACT	2	12	249864	249875	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525929842
104	NC_021839	CTCACC	2	12	250059	250070	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	525929842
105	NC_021839	ATTTGC	2	12	250671	250682	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525929842
106	NC_021839	TAAAAC	2	12	251118	251129	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525929842
107	NC_021839	AAACAA	2	12	278650	278661	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525929852
108	NC_021839	TGGGAT	2	12	281524	281535	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525932249
109	NC_021839	AGAAAG	2	12	292527	292538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929864
110	NC_021839	ATTGCA	2	12	293954	293965	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525929866
111	NC_021839	AAATGA	2	12	294392	294403	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525929866
112	NC_021839	TATCGT	2	12	302517	302528	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525929876
113	NC_021839	AAAGAT	2	12	304784	304795	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525929878
114	NC_021839	TGTGAC	2	12	308474	308485	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525929882
115	NC_021839	TAACGA	2	12	309838	309849	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525929884
116	NC_021839	TGCGGC	2	12	310385	310396	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525929884
117	NC_021839	CGGTTG	2	12	318197	318208	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525929892
118	NC_021839	TTTTTC	2	12	320088	320099	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525929893
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229	NC_021839	GCGGAA	2	12	648679	648690	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525930187
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448	NC_021839	TTTTTC	2	12	1261881	1261892	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525930745
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454	NC_021839	AATCAA	2	12	1276178	1276189	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525930764
455	NC_021839	TTTATC	2	12	1281635	1281646	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525930769
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