MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 356

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021839	AAGGT	2	10	528	537	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021839	GGCAT	2	10	17821	17830	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021839	AGTGA	2	10	39937	39946	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021839	TAAAA	2	10	40515	40524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021839	TGGCT	2	10	49164	49173	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021839	ACTAA	2	10	50540	50549	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021839	TATAA	2	10	55766	55775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021839	AAAGA	2	10	58994	59003	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021839	TTATT	2	10	81550	81559	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021839	TAGAT	2	10	83977	83986	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021839	TAAAA	2	10	95765	95774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021839	AATAA	2	10	109953	109962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021839	ATTGT	2	10	111311	111320	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021839	TTTTA	2	10	121318	121327	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021839	AGGAG	2	10	124709	124718	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021839	ATAGA	2	10	125013	125022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021839	AAATG	2	10	133891	133900	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021839	CACAC	2	10	134825	134834	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_021839	AAATT	2	10	135455	135464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021839	GTGAT	2	10	150105	150114	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021839	AAAAC	2	10	151918	151927	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021839	CAAAA	2	10	172790	172799	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021839	TAGAT	2	10	182015	182024	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021839	AGGTG	2	10	204067	204076	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021839	GGAAA	2	10	209192	209201	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021839	AAATC	2	10	226420	226429	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021839	GCCTA	2	10	232533	232542	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_021839	AACAT	2	10	233697	233706	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021839	CTTAT	2	10	238953	238962	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021839	TTTAT	2	10	249280	249289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021839	TTTCT	2	10	253653	253662	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021839	AATTT	2	10	270011	270020	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021839	ATAGT	2	10	270046	270055	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021839	TTATT	2	10	274113	274122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021839	CTATG	2	10	274279	274288	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021839	ATACA	2	10	279374	279383	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021839	AAAAC	2	10	304205	304214	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021839	GTTTT	2	10	304227	304236	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021839	AAACA	2	10	306733	306742	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021839	TATAG	2	10	316535	316544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021839	GAAAA	2	10	320644	320653	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021839	TAGAC	2	10	336853	336862	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021839	TAAAA	2	10	342782	342791	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021839	CTATG	2	10	350218	350227	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021839	AAAGA	2	10	355672	355681	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021839	ATAAA	2	10	370643	370652	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021839	AGAAT	2	10	371513	371522	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021839	TGGAA	2	10	371641	371650	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021839	AATCA	2	10	374644	374653	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021839	TATAA	2	10	382564	382573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021839	ATTGA	2	10	382602	382611	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021839	ATTAA	2	10	395910	395919	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021839	ATATA	2	10	427356	427365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021839	ATTTT	2	10	430058	430067	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021839	TACAT	2	10	430495	430504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021839	TATAA	2	10	431549	431558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021839	GAAAT	2	10	452737	452746	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021839	TTACT	2	10	460759	460768	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_021839	ATTTA	2	10	466411	466420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021839	GGGGA	2	10	476164	476173	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021839	TATTT	2	10	482402	482411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021839	AGAGA	2	10	482552	482561	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021839	CTTTT	2	10	483527	483536	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021839	CTTTT	2	10	533170	533179	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021839	TAGTT	2	10	533183	533192	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021839	TGAAA	2	10	552077	552086	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021839	AATGA	2	10	569169	569178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021839	TAATA	2	10	589480	589489	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021839	ATTTT	2	10	589638	589647	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021839	GTTTT	2	10	592167	592176	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021839	GTATA	2	10	594930	594939	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021839	AATAA	2	10	599344	599353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021839	ATTTT	2	10	602930	602939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021839	GTTTT	2	10	615866	615875	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021839	AAATT	2	10	616943	616952	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021839	AGGAA	2	10	617466	617475	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021839	GATGA	2	10	629556	629565	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021839	ATAGA	2	10	638217	638226	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021839	ATCTT	2	10	639397	639406	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_021839	TAATT	2	10	643605	643614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021839	ATTTT	2	10	643872	643881	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021839	AATGT	2	10	651273	651282	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021839	TTATA	2	10	675011	675020	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021839	ATAAC	2	10	691002	691011	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021839	TTTTA	2	10	692467	692476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021839	ATAGA	2	10	696379	696388	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021839	TATAA	2	10	710640	710649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021839	TGAAA	2	10	720133	720142	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021839	TTTTA	2	10	726469	726478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021839	TTTAT	2	10	726761	726770	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021839	ATGAG	2	10	746534	746543	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021839	TTTTA	2	10	753667	753676	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021839	TAAAA	2	10	753732	753741	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021839	TATAA	2	10	768202	768211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021839	TCTAT	2	10	780973	780982	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_021839	AGATA	2	10	784662	784671	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021839	GAGAG	2	10	793603	793612	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021839	AAATG	2	10	798261	798270	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021839	TTCTA	2	10	798276	798285	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_021839	TTTTC	2	10	802161	802170	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021839	AGTTT	2	10	812055	812064	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021839	CAAAA	2	10	814421	814430	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021839	ACTAA	2	10	814600	814609	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_021839	TGCGG	2	10	818247	818256	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_021839	TAGGA	2	10	829048	829057	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021839	GTTTT	2	10	829058	829067	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021839	TAAAC	2	10	833072	833081	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021839	CTTTT	2	10	833556	833565	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_021839	AAAGC	2	10	839487	839496	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021839	TTATT	2	10	839530	839539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021839	AAGTT	2	10	843232	843241	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021839	ATAAA	2	10	843286	843295	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021839	GCTAT	2	10	844158	844167	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021839	AATAA	2	10	846219	846228	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021839	AGTTT	2	10	880455	880464	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021839	AAATT	2	10	882237	882246	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021839	TTGAA	2	10	887431	887440	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021839	TTGAT	2	10	913175	913184	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021839	AAATA	2	10	941287	941296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021839	TAAAA	2	10	974964	974973	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021839	ATTTT	2	10	976558	976567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021839	TATAA	2	10	1009455	1009464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021839	TAAAA	2	10	1009523	1009532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021839	CTTTA	2	10	1009740	1009749	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021839	CTATA	2	10	1009928	1009937	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_021839	TCTTA	2	10	1010523	1010532	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_021839	TTTAG	2	10	1013064	1013073	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021839	ACTTG	2	10	1016950	1016959	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_021839	AAAGA	2	10	1019445	1019454	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021839	TACTA	2	10	1028428	1028437	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021839	TAAAA	2	10	1028473	1028482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021839	ATTTA	2	10	1034846	1034855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021839	ATTTC	2	10	1060885	1060894	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021839	TACTT	2	10	1069106	1069115	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_021839	TTTAT	2	10	1083910	1083919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021839	GAATA	2	10	1084117	1084126	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021839	ATACT	2	10	1153470	1153479	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_021839	AACCG	2	10	1153503	1153512	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_021839	AAATA	2	10	1159488	1159497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021839	TAAAA	2	10	1179994	1180003	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021839	AGGAA	2	10	1182514	1182523	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021839	TAATA	2	10	1183964	1183973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021839	AAAAC	2	10	1186875	1186884	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_021839	TGTAT	2	10	1189690	1189699	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021839	AAATA	2	10	1189735	1189744	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021839	TTTAT	2	10	1196214	1196223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021839	ATAAA	2	10	1222601	1222610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_021839	CTTTA	2	10	1249861	1249870	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_021839	TTACC	2	10	2427284	2427293	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
287	NC_021839	CACGA	2	10	2429006	2429015	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
288	NC_021839	GCATG	2	10	2429891	2429900	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
289	NC_021839	AATTA	2	10	2430165	2430174	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021839	TCGTT	2	10	2434548	2434557	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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297	NC_021839	CTTTG	2	10	2444372	2444381	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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317	NC_021839	TAAAA	2	10	2638881	2638890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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330	NC_021839	TTATG	2	10	2764750	2764759	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.