MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 42298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021839	GCG	2	6	24	29	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021839	AAG	2	6	54	59	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021839	CTT	2	6	64	69	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021839	CGG	2	6	198	203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021839	GGA	2	6	230	235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021839	AGT	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021839	TTG	2	6	415	420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021839	ACC	2	6	813	818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_021839	AGC	2	6	893	898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021839	TGG	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021839	AAG	2	6	1095	1100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021839	ACA	2	6	1203	1208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021839	AGT	2	6	1414	1419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021839	GAG	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021839	CGG	2	6	1712	1717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021839	GAG	2	6	1964	1969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021839	TGG	2	6	1974	1979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021839	TAC	2	6	1982	1987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021839	CCT	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021839	GGT	2	6	2206	2211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021839	TCG	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021839	CGT	2	6	2401	2406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021839	GAG	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021839	GTT	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021839	TTC	2	6	2602	2607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021839	GAT	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021839	TCT	2	6	2742	2747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021839	CAA	2	6	2771	2776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021839	ATT	2	6	2919	2924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021839	AAG	2	6	3121	3126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929674
31	NC_021839	TAA	2	6	3174	3179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929674
32	NC_021839	GTG	4	12	3225	3236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929674
33	NC_021839	ATT	2	6	3248	3253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929674
34	NC_021839	GAA	3	9	3362	3370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929674
35	NC_021839	TAA	2	6	3372	3377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929674
36	NC_021839	GAA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929674
37	NC_021839	TGG	2	6	3399	3404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929674
38	NC_021839	TGA	2	6	3510	3515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021839	GAT	2	6	3517	3522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929675
40	NC_021839	CAA	2	6	3563	3568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929675
41	NC_021839	CTT	2	6	3691	3696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929675
42	NC_021839	AGA	2	6	3712	3717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929675
43	NC_021839	ATT	2	6	3836	3841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929675
44	NC_021839	GAG	2	6	3965	3970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525929675
45	NC_021839	GCT	2	6	3980	3985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929675
46	NC_021839	TGA	2	6	3994	3999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929675
47	NC_021839	TGA	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
48	NC_021839	GAT	2	6	4087	4092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
49	NC_021839	GTT	2	6	4093	4098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929676
50	NC_021839	TTG	2	6	4172	4177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929676
51	NC_021839	ATA	2	6	4178	4183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929676
52	NC_021839	TGA	2	6	4197	4202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
53	NC_021839	TGG	2	6	4256	4261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929676
54	NC_021839	ATG	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
55	NC_021839	GAA	2	6	4327	4332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929676
56	NC_021839	TAT	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929676
57	NC_021839	ATT	2	6	4398	4403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929676
58	NC_021839	ACA	2	6	4558	4563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929676
59	NC_021839	TGA	2	6	4826	4831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
60	NC_021839	ATT	2	6	4840	4845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929676
61	NC_021839	AAG	2	6	4853	4858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929676
62	NC_021839	AGA	2	6	5001	5006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929676
63	NC_021839	ATG	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
64	NC_021839	AGG	2	6	5070	5075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021839	ACA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021839	ATG	2	6	5084	5089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
67	NC_021839	AAG	2	6	5136	5141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
68	NC_021839	TTA	2	6	5186	5191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929677
69	NC_021839	GCG	2	6	5219	5224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929677
70	NC_021839	GCA	2	6	5263	5268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929677
71	NC_021839	GAC	2	6	5308	5313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929677
72	NC_021839	GGC	2	6	5510	5515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929677
73	NC_021839	GTC	2	6	5670	5675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929677
74	NC_021839	GAA	2	6	5680	5685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
75	NC_021839	CAA	2	6	5747	5752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929677
76	NC_021839	TGT	2	6	5818	5823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929677
77	NC_021839	GTG	2	6	5841	5846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929677
78	NC_021839	TGG	2	6	5941	5946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929677
79	NC_021839	GCC	2	6	5983	5988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525929677
80	NC_021839	GTG	2	6	5997	6002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929677
81	NC_021839	CAA	2	6	6021	6026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929677
82	NC_021839	TGC	2	6	6061	6066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929677
83	NC_021839	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
84	NC_021839	TGA	2	6	6181	6186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
85	NC_021839	GCT	2	6	6197	6202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929677
86	NC_021839	TGA	2	6	6265	6270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
87	NC_021839	AGC	2	6	6394	6399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929677
88	NC_021839	AGA	2	6	6439	6444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
89	NC_021839	AGA	2	6	6496	6501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
90	NC_021839	TTG	2	6	6504	6509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929677
91	NC_021839	GTT	2	6	6515	6520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929677
92	NC_021839	TGC	2	6	6622	6627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929677
93	NC_021839	TGA	2	6	6772	6777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
94	NC_021839	GAT	2	6	6784	6789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
95	NC_021839	CTC	2	6	6846	6851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525929677
96	NC_021839	GAA	2	6	6869	6874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
97	NC_021839	AGT	2	6	6916	6921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
98	NC_021839	GGT	2	6	7015	7020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929677
99	NC_021839	TCA	2	6	7038	7043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929677
100	NC_021839	TGA	2	6	7195	7200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
101	NC_021839	AAG	2	6	7392	7397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
102	NC_021839	GAA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
103	NC_021839	AAC	2	6	7516	7521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929677
104	NC_021839	TGA	2	6	7624	7629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021839	GAT	2	6	7648	7653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021839	TTA	2	6	8008	8013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929678
107	NC_021839	GAA	2	6	8071	8076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929678
108	NC_021839	ATC	2	6	8228	8233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929678
109	NC_021839	TTG	2	6	8330	8335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929678
110	NC_021839	TCA	2	6	8421	8426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929678
111	NC_021839	GAA	2	6	8545	8550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929678
112	NC_021839	TAA	2	6	8685	8690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929678
113	NC_021839	AGC	2	6	8763	8768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929678
114	NC_021839	TGG	2	6	8769	8774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929678
115	NC_021839	CAA	2	6	8846	8851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929678
116	NC_021839	TCG	2	6	8898	8903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929678
117	NC_021839	AAC	2	6	8918	8923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929678
118	NC_021839	AAG	2	6	8930	8935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929678
119	NC_021839	GAA	2	6	9045	9050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929678
120	NC_021839	AGG	2	6	9186	9191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021839	TTA	2	6	9356	9361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929679
122	NC_021839	AGT	2	6	9534	9539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929679
123	NC_021839	GTC	2	6	9593	9598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929679
124	NC_021839	AGA	3	9	9651	9659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929679
125	NC_021839	AGA	2	6	9666	9671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929679
126	NC_021839	ATT	2	6	9712	9717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929679
127	NC_021839	ACT	2	6	9742	9747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929679
128	NC_021839	GGT	2	6	9765	9770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929679
129	NC_021839	AGA	2	6	9879	9884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929679
130	NC_021839	TTG	2	6	9977	9982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929679
131	NC_021839	GTT	2	6	10072	10077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929679
132	NC_021839	GAT	2	6	10150	10155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929679
133	NC_021839	GAT	2	6	10161	10166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929679
134	NC_021839	TGT	2	6	10167	10172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929679
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386	NC_021839	GTT	2	6	26961	26966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932161
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450	NC_021839	TAT	2	6	32106	32111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932164
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453	NC_021839	CTT	2	6	32342	32347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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459	NC_021839	ATT	2	6	32926	32931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929700
460	NC_021839	ATT	2	6	33169	33174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929700
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496	NC_021839	GAA	2	6	35533	35538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929700
497	NC_021839	GAA	2	6	35557	35562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929700
498	NC_021839	TGA	2	6	35676	35681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929700
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500	NC_021839	TGG	2	6	35736	35741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929700

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