MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 4055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021839	GCG	2	6	24	29	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021839	AAG	2	6	54	59	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021839	CTT	2	6	64	69	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021839	CGG	2	6	198	203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021839	GGA	2	6	230	235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021839	AGT	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021839	TTG	2	6	415	420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021839	ACC	2	6	813	818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_021839	AGC	2	6	893	898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021839	TGG	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021839	AAG	2	6	1095	1100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021839	ACA	2	6	1203	1208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021839	AGT	2	6	1414	1419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021839	GAG	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021839	CGG	2	6	1712	1717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021839	GAG	2	6	1964	1969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021839	TGG	2	6	1974	1979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021839	TAC	2	6	1982	1987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021839	CCT	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021839	GGT	2	6	2206	2211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021839	TCG	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021839	CGT	2	6	2401	2406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021839	GAG	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021839	GTT	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021839	TTC	2	6	2602	2607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021839	GAT	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021839	TCT	2	6	2742	2747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021839	CAA	2	6	2771	2776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021839	ATT	2	6	2919	2924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021839	TGA	2	6	3510	3515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021839	AGG	2	6	5070	5075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021839	ACA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021839	TGA	2	6	7624	7629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021839	GAT	2	6	7648	7653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021839	AGG	2	6	9186	9191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021839	AGG	2	6	10278	10283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021839	AAT	2	6	11468	11473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021839	TGA	2	6	13060	13065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021839	GAA	2	6	13069	13074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021839	AGG	2	6	13337	13342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021839	CAA	2	6	13343	13348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021839	AGA	2	6	17115	17120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021839	AGG	2	6	18298	18303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021839	GGC	2	6	18306	18311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021839	TGC	2	6	18322	18327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021839	ATT	2	6	18888	18893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021839	GTT	2	6	18901	18906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021839	TTA	2	6	18907	18912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021839	AAT	2	6	19397	19402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021839	AGG	2	6	19509	19514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021839	AGG	2	6	19975	19980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021839	TTG	2	6	20904	20909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021839	TAT	2	6	21483	21488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021839	GGA	2	6	21490	21495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021839	AGA	2	6	22725	22730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021839	AAG	2	6	22858	22863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021839	AGC	2	6	24149	24154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021839	TGC	2	6	24168	24173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021839	TTC	2	6	24174	24179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021839	TGT	2	6	24184	24189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021839	ATA	2	6	24239	24244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021839	TTA	2	6	25288	25293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021839	ATT	2	6	25333	25338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021839	CTT	2	6	32342	32347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021839	AGG	2	6	36253	36258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021839	AGA	2	6	40529	40534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021839	TCT	2	6	42168	42173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021839	ATT	2	6	42180	42185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021839	ATG	2	6	42250	42255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021839	TAT	2	6	43838	43843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021839	TAA	2	6	45591	45596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021839	TAA	2	6	45668	45673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021839	AAT	2	6	45674	45679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021839	AAT	2	6	45715	45720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021839	CTA	2	6	47572	47577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021839	AGG	2	6	49218	49223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021839	AGG	2	6	50560	50565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021839	AGA	2	6	51999	52004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021839	AGG	2	6	52015	52020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021839	TAT	3	9	54653	54661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021839	ATT	2	6	55794	55799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021839	CTT	2	6	55859	55864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021839	CTA	2	6	57984	57989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021839	CAT	2	6	58894	58899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021839	ACA	2	6	58953	58958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021839	ATC	2	6	60265	60270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021839	AAT	2	6	60425	60430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021839	TAT	2	6	60444	60449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021839	ATC	2	6	62158	62163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021839	TAA	2	6	62173	62178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021839	TTA	2	6	62209	62214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021839	GGA	2	6	62254	62259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021839	CCG	2	6	63246	63251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_021839	TTC	2	6	64380	64385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021839	AAG	2	6	64508	64513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021839	TAT	2	6	64625	64630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021839	AGC	2	6	68182	68187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021839	ATA	2	6	68217	68222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021839	ATA	2	6	68281	68286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021839	TAT	2	6	68318	68323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021839	TTC	2	6	69123	69128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021839	AGT	2	6	69202	69207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021839	AAC	2	6	70892	70897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021839	TGT	2	6	71741	71746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021839	CTC	2	6	71828	71833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_021839	TAA	2	6	73318	73323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021839	TGT	2	6	73377	73382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021839	AAG	2	6	74216	74221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021839	TAT	2	6	79389	79394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021839	CTA	2	6	81045	81050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021839	TGG	2	6	81340	81345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021839	GCT	2	6	81543	81548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021839	CAA	2	6	82130	82135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021839	AAT	2	6	83024	83029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021839	TAT	2	6	83950	83955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021839	AGG	2	6	84055	84060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021839	TTA	2	6	86614	86619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021839	ACA	2	6	86621	86626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021839	CCT	2	6	90038	90043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_021839	ATT	3	9	90087	90095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021839	ATT	2	6	90133	90138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021839	ATG	2	6	90151	90156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021839	CAA	2	6	90510	90515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021839	ATT	2	6	91072	91077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021839	ACC	2	6	91105	91110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_021839	GGA	2	6	91158	91163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021839	CAA	2	6	91205	91210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021839	TAG	2	6	93613	93618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021839	GAT	2	6	94129	94134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021839	ATT	2	6	95378	95383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021839	TAA	2	6	95839	95844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021839	ATA	2	6	95873	95878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021839	AGT	2	6	95945	95950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021839	TAT	2	6	95968	95973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021839	TAA	2	6	95985	95990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021839	AGA	2	6	97864	97869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021839	CTT	2	6	97914	97919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021839	AAG	2	6	97970	97975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021839	TAA	2	6	101816	101821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021839	TAA	2	6	101846	101851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021839	ATG	2	6	102660	102665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021839	TAA	2	6	102675	102680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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