MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 38243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021839	AAG	2	6	3121	3126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929674
2	NC_021839	TAA	2	6	3174	3179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929674
3	NC_021839	GTG	4	12	3225	3236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929674
4	NC_021839	ATT	2	6	3248	3253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929674
5	NC_021839	GAA	3	9	3362	3370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929674
6	NC_021839	TAA	2	6	3372	3377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929674
7	NC_021839	GAA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929674
8	NC_021839	TGG	2	6	3399	3404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929674
9	NC_021839	GAT	2	6	3517	3522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929675
10	NC_021839	CAA	2	6	3563	3568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929675
11	NC_021839	CTT	2	6	3691	3696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929675
12	NC_021839	AGA	2	6	3712	3717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929675
13	NC_021839	ATT	2	6	3836	3841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929675
14	NC_021839	GAG	2	6	3965	3970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525929675
15	NC_021839	GCT	2	6	3980	3985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929675
16	NC_021839	TGA	2	6	3994	3999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929675
17	NC_021839	TGA	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
18	NC_021839	GAT	2	6	4087	4092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
19	NC_021839	GTT	2	6	4093	4098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929676
20	NC_021839	TTG	2	6	4172	4177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929676
21	NC_021839	ATA	2	6	4178	4183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929676
22	NC_021839	TGA	2	6	4197	4202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
23	NC_021839	TGG	2	6	4256	4261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929676
24	NC_021839	ATG	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
25	NC_021839	GAA	2	6	4327	4332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929676
26	NC_021839	TAT	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929676
27	NC_021839	ATT	2	6	4398	4403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929676
28	NC_021839	ACA	2	6	4558	4563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929676
29	NC_021839	TGA	2	6	4826	4831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
30	NC_021839	ATT	2	6	4840	4845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929676
31	NC_021839	AAG	2	6	4853	4858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929676
32	NC_021839	AGA	2	6	5001	5006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929676
33	NC_021839	ATG	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
34	NC_021839	ATG	2	6	5084	5089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
35	NC_021839	AAG	2	6	5136	5141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
36	NC_021839	TTA	2	6	5186	5191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929677
37	NC_021839	GCG	2	6	5219	5224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929677
38	NC_021839	GCA	2	6	5263	5268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929677
39	NC_021839	GAC	2	6	5308	5313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929677
40	NC_021839	GGC	2	6	5510	5515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929677
41	NC_021839	GTC	2	6	5670	5675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929677
42	NC_021839	GAA	2	6	5680	5685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
43	NC_021839	CAA	2	6	5747	5752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929677
44	NC_021839	TGT	2	6	5818	5823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929677
45	NC_021839	GTG	2	6	5841	5846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929677
46	NC_021839	TGG	2	6	5941	5946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929677
47	NC_021839	GCC	2	6	5983	5988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525929677
48	NC_021839	GTG	2	6	5997	6002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929677
49	NC_021839	CAA	2	6	6021	6026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929677
50	NC_021839	TGC	2	6	6061	6066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929677
51	NC_021839	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
52	NC_021839	TGA	2	6	6181	6186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
53	NC_021839	GCT	2	6	6197	6202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929677
54	NC_021839	TGA	2	6	6265	6270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
55	NC_021839	AGC	2	6	6394	6399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929677
56	NC_021839	AGA	2	6	6439	6444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
57	NC_021839	AGA	2	6	6496	6501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
58	NC_021839	TTG	2	6	6504	6509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929677
59	NC_021839	GTT	2	6	6515	6520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929677
60	NC_021839	TGC	2	6	6622	6627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929677
61	NC_021839	TGA	2	6	6772	6777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
62	NC_021839	GAT	2	6	6784	6789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
63	NC_021839	CTC	2	6	6846	6851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525929677
64	NC_021839	GAA	2	6	6869	6874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
65	NC_021839	AGT	2	6	6916	6921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
66	NC_021839	GGT	2	6	7015	7020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929677
67	NC_021839	TCA	2	6	7038	7043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929677
68	NC_021839	TGA	2	6	7195	7200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
69	NC_021839	AAG	2	6	7392	7397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
70	NC_021839	GAA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
71	NC_021839	AAC	2	6	7516	7521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929677
72	NC_021839	TTA	2	6	8008	8013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929678
73	NC_021839	GAA	2	6	8071	8076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929678
74	NC_021839	ATC	2	6	8228	8233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929678
75	NC_021839	TTG	2	6	8330	8335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929678
76	NC_021839	TCA	2	6	8421	8426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929678
77	NC_021839	GAA	2	6	8545	8550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929678
78	NC_021839	TAA	2	6	8685	8690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929678
79	NC_021839	AGC	2	6	8763	8768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929678
80	NC_021839	TGG	2	6	8769	8774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929678
81	NC_021839	CAA	2	6	8846	8851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929678
82	NC_021839	TCG	2	6	8898	8903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929678
83	NC_021839	AAC	2	6	8918	8923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929678
84	NC_021839	AAG	2	6	8930	8935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929678
85	NC_021839	GAA	2	6	9045	9050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929678
86	NC_021839	TTA	2	6	9356	9361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929679
87	NC_021839	AGT	2	6	9534	9539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929679
88	NC_021839	GTC	2	6	9593	9598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929679
89	NC_021839	AGA	3	9	9651	9659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929679
90	NC_021839	AGA	2	6	9666	9671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929679
91	NC_021839	ATT	2	6	9712	9717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929679
92	NC_021839	ACT	2	6	9742	9747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929679
93	NC_021839	GGT	2	6	9765	9770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929679
94	NC_021839	AGA	2	6	9879	9884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929679
95	NC_021839	TTG	2	6	9977	9982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929679
96	NC_021839	GTT	2	6	10072	10077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929679
97	NC_021839	GAT	2	6	10150	10155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929679
98	NC_021839	GAT	2	6	10161	10166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929679
99	NC_021839	TGT	2	6	10167	10172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929679
100	NC_021839	AGA	2	6	10173	10178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929679
101	NC_021839	TTA	2	6	10190	10195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929679
102	NC_021839	CAG	2	6	10238	10243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929679
103	NC_021839	GAA	2	6	10244	10249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929679
104	NC_021839	GTT	2	6	10425	10430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929680
105	NC_021839	TTG	2	6	10440	10445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929680
106	NC_021839	AAG	2	6	10452	10457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929680
107	NC_021839	GCA	2	6	10556	10561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929680
108	NC_021839	ATG	2	6	10602	10607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929680
109	NC_021839	ATT	2	6	10634	10639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929680
110	NC_021839	ATT	2	6	10645	10650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929680
111	NC_021839	GTG	2	6	10715	10720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929680
112	NC_021839	CGC	2	6	10773	10778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525929680
113	NC_021839	TAT	2	6	10904	10909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929680
114	NC_021839	ATG	2	6	11005	11010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929681
115	NC_021839	TTG	2	6	11041	11046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929681
116	NC_021839	CTT	2	6	11103	11108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929681
117	NC_021839	CTA	2	6	11272	11277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929681
118	NC_021839	GAA	2	6	11412	11417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929681
119	NC_021839	AAT	2	6	11452	11457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929681
120	NC_021839	ATG	2	6	11584	11589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929682
121	NC_021839	GAA	2	6	11646	11651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929682
122	NC_021839	CAA	2	6	11769	11774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929682
123	NC_021839	GAA	2	6	11814	11819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929682
124	NC_021839	GTC	2	6	11884	11889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929682
125	NC_021839	AAC	2	6	11902	11907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929682
126	NC_021839	AAG	2	6	11917	11922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929682
127	NC_021839	TTC	2	6	12115	12120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929682
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129	NC_021839	ATT	2	6	12258	12263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929682
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