MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 2752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021839	TC	3	6	3321	3326	0 %	50 %	0 %	50 %	525929674
2	NC_021839	CT	4	8	3630	3637	0 %	50 %	0 %	50 %	525929675
3	NC_021839	TG	3	6	4495	4500	0 %	50 %	50 %	0 %	525929676
4	NC_021839	GC	3	6	4521	4526	0 %	0 %	50 %	50 %	525929676
5	NC_021839	TA	3	6	4620	4625	50 %	50 %	0 %	0 %	525929676
6	NC_021839	CT	3	6	5229	5234	0 %	50 %	0 %	50 %	525929677
7	NC_021839	AT	3	6	6046	6051	50 %	50 %	0 %	0 %	525929677
8	NC_021839	GA	3	6	6071	6076	50 %	0 %	50 %	0 %	525929677
9	NC_021839	CG	3	6	6746	6751	0 %	0 %	50 %	50 %	525929677
10	NC_021839	TG	3	6	7722	7727	0 %	50 %	50 %	0 %	525929678
11	NC_021839	TA	3	6	8059	8064	50 %	50 %	0 %	0 %	525929678
12	NC_021839	GT	3	6	9220	9225	0 %	50 %	50 %	0 %	525929679
13	NC_021839	TC	3	6	12106	12111	0 %	50 %	0 %	50 %	525929682
14	NC_021839	GA	3	6	14002	14007	50 %	0 %	50 %	0 %	525929684
15	NC_021839	CA	3	6	16128	16133	50 %	0 %	0 %	50 %	525929686
16	NC_021839	GC	3	6	22287	22292	0 %	0 %	50 %	50 %	525929697
17	NC_021839	TG	3	6	23114	23119	0 %	50 %	50 %	0 %	525929698
18	NC_021839	AC	3	6	23282	23287	50 %	0 %	0 %	50 %	525929698
19	NC_021839	TG	3	6	23762	23767	0 %	50 %	50 %	0 %	525929698
20	NC_021839	GA	3	6	25263	25268	50 %	0 %	50 %	0 %	525932159
21	NC_021839	TG	3	6	26302	26307	0 %	50 %	50 %	0 %	525932160
22	NC_021839	AT	3	6	26943	26948	50 %	50 %	0 %	0 %	525932161
23	NC_021839	AC	3	6	27961	27966	50 %	0 %	0 %	50 %	525932161
24	NC_021839	GT	3	6	28225	28230	0 %	50 %	50 %	0 %	525932162
25	NC_021839	TC	3	6	30047	30052	0 %	50 %	0 %	50 %	525929699
26	NC_021839	TA	3	6	31336	31341	50 %	50 %	0 %	0 %	525932163
27	NC_021839	AT	3	6	31515	31520	50 %	50 %	0 %	0 %	525932163
28	NC_021839	AC	3	6	33206	33211	50 %	0 %	0 %	50 %	525929700
29	NC_021839	CT	3	6	35712	35717	0 %	50 %	0 %	50 %	525929700
30	NC_021839	CA	3	6	37405	37410	50 %	0 %	0 %	50 %	525929701
31	NC_021839	GC	3	6	41306	41311	0 %	0 %	50 %	50 %	525929703
32	NC_021839	CA	4	8	41496	41503	50 %	0 %	0 %	50 %	525929703
33	NC_021839	AG	3	6	42397	42402	50 %	0 %	50 %	0 %	525932165
34	NC_021839	CG	3	6	43998	44003	0 %	0 %	50 %	50 %	525932166
35	NC_021839	GA	4	8	48359	48366	50 %	0 %	50 %	0 %	525932168
36	NC_021839	CA	3	6	51398	51403	50 %	0 %	0 %	50 %	525929706
37	NC_021839	CT	3	6	51782	51787	0 %	50 %	0 %	50 %	525929706
38	NC_021839	AT	3	6	53167	53172	50 %	50 %	0 %	0 %	525929708
39	NC_021839	TA	3	6	54879	54884	50 %	50 %	0 %	0 %	525932169
40	NC_021839	AT	3	6	55141	55146	50 %	50 %	0 %	0 %	525932169
41	NC_021839	TA	3	6	55300	55305	50 %	50 %	0 %	0 %	525932169
42	NC_021839	GT	3	6	57260	57265	0 %	50 %	50 %	0 %	525929710
43	NC_021839	AG	5	10	59887	59896	50 %	0 %	50 %	0 %	525929713
44	NC_021839	AT	3	6	60051	60056	50 %	50 %	0 %	0 %	525929713
45	NC_021839	AC	3	6	60085	60090	50 %	0 %	0 %	50 %	525929713
46	NC_021839	AC	4	8	63045	63052	50 %	0 %	0 %	50 %	525929716
47	NC_021839	AG	3	6	63128	63133	50 %	0 %	50 %	0 %	525929716
48	NC_021839	CG	3	6	65387	65392	0 %	0 %	50 %	50 %	525929718
49	NC_021839	TA	3	6	65527	65532	50 %	50 %	0 %	0 %	525929718
50	NC_021839	AC	3	6	65651	65656	50 %	0 %	0 %	50 %	525929718
51	NC_021839	TA	3	6	66064	66069	50 %	50 %	0 %	0 %	525929718
52	NC_021839	AT	3	6	67416	67421	50 %	50 %	0 %	0 %	525932170
53	NC_021839	GT	3	6	68649	68654	0 %	50 %	50 %	0 %	525929721
54	NC_021839	TC	3	6	68933	68938	0 %	50 %	0 %	50 %	525929721
55	NC_021839	CG	3	6	70526	70531	0 %	0 %	50 %	50 %	525929723
56	NC_021839	CG	3	6	72345	72350	0 %	0 %	50 %	50 %	525929725
57	NC_021839	TG	3	6	72967	72972	0 %	50 %	50 %	0 %	525929725
58	NC_021839	AT	3	6	75213	75218	50 %	50 %	0 %	0 %	525929727
59	NC_021839	AG	3	6	75844	75849	50 %	0 %	50 %	0 %	525929727
60	NC_021839	GA	3	6	77317	77322	50 %	0 %	50 %	0 %	525929728
61	NC_021839	TC	3	6	77700	77705	0 %	50 %	0 %	50 %	525929729
62	NC_021839	TC	3	6	78905	78910	0 %	50 %	0 %	50 %	525929730
63	NC_021839	AG	3	6	79493	79498	50 %	0 %	50 %	0 %	525929731
64	NC_021839	GC	3	6	79527	79532	0 %	0 %	50 %	50 %	525929731
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66	NC_021839	TA	3	6	85919	85924	50 %	50 %	0 %	0 %	525929735
67	NC_021839	AT	3	6	87716	87721	50 %	50 %	0 %	0 %	525929736
68	NC_021839	AT	3	6	87953	87958	50 %	50 %	0 %	0 %	525929736
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70	NC_021839	AG	3	6	90436	90441	50 %	0 %	50 %	0 %	525932172
71	NC_021839	GT	3	6	93097	93102	0 %	50 %	50 %	0 %	525929740
72	NC_021839	AT	3	6	93227	93232	50 %	50 %	0 %	0 %	525929740
73	NC_021839	AT	3	6	93954	93959	50 %	50 %	0 %	0 %	525932175
74	NC_021839	AC	3	6	94299	94304	50 %	0 %	0 %	50 %	525932176
75	NC_021839	AT	3	6	94771	94776	50 %	50 %	0 %	0 %	525932176
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77	NC_021839	TA	3	6	96981	96986	50 %	50 %	0 %	0 %	525932178
78	NC_021839	AT	3	6	98009	98014	50 %	50 %	0 %	0 %	525932179
79	NC_021839	AT	3	6	98032	98037	50 %	50 %	0 %	0 %	525932179
80	NC_021839	GA	3	6	98671	98676	50 %	0 %	50 %	0 %	525932179
81	NC_021839	AG	3	6	99970	99975	50 %	0 %	50 %	0 %	525932182
82	NC_021839	CA	3	6	100627	100632	50 %	0 %	0 %	50 %	525932182
83	NC_021839	AT	3	6	101024	101029	50 %	50 %	0 %	0 %	525932183
84	NC_021839	AT	3	6	101188	101193	50 %	50 %	0 %	0 %	525932183
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88	NC_021839	GC	3	6	108104	108109	0 %	0 %	50 %	50 %	525932184
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90	NC_021839	CG	3	6	113381	113386	0 %	0 %	50 %	50 %	525929752
91	NC_021839	AG	3	6	113744	113749	50 %	0 %	50 %	0 %	525929752
92	NC_021839	TA	3	6	114822	114827	50 %	50 %	0 %	0 %	525932185
93	NC_021839	AC	3	6	116614	116619	50 %	0 %	0 %	50 %	525932185
94	NC_021839	TA	3	6	117214	117219	50 %	50 %	0 %	0 %	525932185
95	NC_021839	AC	3	6	117256	117261	50 %	0 %	0 %	50 %	525932185
96	NC_021839	TA	3	6	117421	117426	50 %	50 %	0 %	0 %	525932185
97	NC_021839	AC	3	6	118734	118739	50 %	0 %	0 %	50 %	525929753
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99	NC_021839	TC	3	6	120032	120037	0 %	50 %	0 %	50 %	525932186
100	NC_021839	CT	3	6	121006	121011	0 %	50 %	0 %	50 %	525932186
101	NC_021839	AT	3	6	125600	125605	50 %	50 %	0 %	0 %	525932188
102	NC_021839	TC	3	6	126207	126212	0 %	50 %	0 %	50 %	525932188
103	NC_021839	TA	3	6	130980	130985	50 %	50 %	0 %	0 %	525929754
104	NC_021839	GA	3	6	131322	131327	50 %	0 %	50 %	0 %	525929755
105	NC_021839	AT	3	6	132206	132211	50 %	50 %	0 %	0 %	525932189
106	NC_021839	TA	3	6	133351	133356	50 %	50 %	0 %	0 %	525932189
107	NC_021839	AT	3	6	133546	133551	50 %	50 %	0 %	0 %	525932190
108	NC_021839	AT	3	6	134356	134361	50 %	50 %	0 %	0 %	525932192
109	NC_021839	CG	3	6	136909	136914	0 %	0 %	50 %	50 %	525929758
110	NC_021839	GC	3	6	139970	139975	0 %	0 %	50 %	50 %	525929762
111	NC_021839	CA	3	6	140148	140153	50 %	0 %	0 %	50 %	525929762
112	NC_021839	GT	3	6	141227	141232	0 %	50 %	50 %	0 %	525929764
113	NC_021839	AT	3	6	141391	141396	50 %	50 %	0 %	0 %	525929764
114	NC_021839	AT	3	6	141892	141897	50 %	50 %	0 %	0 %	525929764
115	NC_021839	GA	3	6	143148	143153	50 %	0 %	50 %	0 %	525929767
116	NC_021839	TA	3	6	144372	144377	50 %	50 %	0 %	0 %	525929768
117	NC_021839	GT	3	6	144602	144607	0 %	50 %	50 %	0 %	525929769
118	NC_021839	TA	3	6	144763	144768	50 %	50 %	0 %	0 %	525929769
119	NC_021839	TA	3	6	145491	145496	50 %	50 %	0 %	0 %	525932196
120	NC_021839	GT	3	6	146004	146009	0 %	50 %	50 %	0 %	525932196
121	NC_021839	GC	3	6	147206	147211	0 %	0 %	50 %	50 %	525929770
122	NC_021839	CG	3	6	147320	147325	0 %	0 %	50 %	50 %	525929770
123	NC_021839	TA	3	6	148112	148117	50 %	50 %	0 %	0 %	525929770
124	NC_021839	TC	3	6	149532	149537	0 %	50 %	0 %	50 %	525929771
125	NC_021839	AC	3	6	149568	149573	50 %	0 %	0 %	50 %	525929771
126	NC_021839	TA	3	6	153367	153372	50 %	50 %	0 %	0 %	525929773
127	NC_021839	AT	3	6	153810	153815	50 %	50 %	0 %	0 %	525929773
128	NC_021839	GT	3	6	154069	154074	0 %	50 %	50 %	0 %	525929773
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130	NC_021839	AT	3	6	155592	155597	50 %	50 %	0 %	0 %	525932198
131	NC_021839	AT	3	6	155633	155638	50 %	50 %	0 %	0 %	525932198
132	NC_021839	AT	3	6	156221	156226	50 %	50 %	0 %	0 %	525929775
133	NC_021839	TA	3	6	156461	156466	50 %	50 %	0 %	0 %	525929775
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