MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain R2-502

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021838	AAATTA	2	12	11385	11396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021838	TAATGC	2	12	11425	11436	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021838	TAATAC	2	12	36543	36554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021838	CGCCTA	2	12	57339	57350	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021838	TTTCCT	2	12	59242	59253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021838	TTGAAT	2	12	60814	60825	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021838	TTGTCT	2	12	171155	171166	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021838	TTATTT	2	12	208574	208585	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021838	CTTTTT	2	12	210639	210650	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021838	ATCCCA	2	12	230552	230563	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021838	TTTTTA	2	12	242380	242391	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021838	AAATAT	2	12	245304	245315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021838	TTTTAT	2	12	286117	286128	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021838	TAACGC	2	12	318407	318418	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021838	CGCCTA	2	12	326989	327000	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021838	TTTCCT	2	12	328892	328903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021838	TTGAAT	2	12	330464	330475	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021838	CCTCTT	2	12	382243	382254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021838	TAAATC	2	12	409231	409242	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021838	TATCAA	2	12	555379	555390	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021838	TAAAAA	2	12	555463	555474	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021838	AAGTAT	2	12	556330	556341	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021838	CTATTA	2	12	613650	613661	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021838	CAGGTT	2	12	759135	759146	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021838	ACACTT	2	12	784663	784674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021838	AATAAA	2	12	810982	810993	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021838	GAAAAC	2	12	838006	838017	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021838	ATTCAA	2	12	848898	848909	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021838	AAGGAA	2	12	850469	850480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021838	TAGGCG	2	12	852122	852133	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021838	ATTCAA	2	12	951739	951750	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021838	AAGGAA	2	12	953310	953321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021838	TAGGCG	2	12	954963	954974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021838	AATAAG	2	12	958467	958478	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021838	AAAGCG	2	12	1022155	1022166	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021838	TTTTTA	2	12	1044462	1044473	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021838	TATTTT	2	12	1045372	1045383	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021838	CTTATT	2	12	1059466	1059477	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021838	ACAACC	2	12	1061021	1061032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021838	ACAACC	2	12	1062494	1062505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021838	TAATGA	2	12	1076819	1076830	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021838	TATTTT	2	12	1097679	1097690	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021838	GAAGAG	2	12	1113142	1113153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021838	GAAATA	2	12	1128976	1128987	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021838	ACTTTT	2	12	1212044	1212055	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021838	ATGATT	2	12	1259920	1259931	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021838	TTGTAC	2	12	1293285	1293296	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021838	TAAAAA	2	12	1321572	1321583	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021838	ATTAAT	2	12	1406571	1406582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021838	ATAAAA	2	12	1513216	1513227	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021838	AAAAAG	2	12	1546523	1546534	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021838	ACTAAA	2	12	1584864	1584875	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021838	TTATTT	2	12	1588753	1588764	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021838	AATTAA	2	12	1591767	1591778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021838	TTGGGA	2	12	1593000	1593011	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021838	ATGCAC	2	12	1600549	1600560	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021838	CATGTA	2	12	1600641	1600652	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021838	ATTGTT	2	12	1650729	1650740	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021838	TCTTCC	2	12	1689731	1689742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021838	AGTCAA	2	12	1699923	1699934	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021838	TTCGTT	2	12	1785896	1785907	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021838	TTTCAT	2	12	1822866	1822877	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021838	TTGTAA	2	12	1831470	1831481	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021838	GATTAC	2	12	1831488	1831499	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021838	CTATTT	2	12	1838291	1838302	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021838	AAAGTA	2	12	1874738	1874749	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021838	CCTTTT	2	12	1929913	1929924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021838	ATCAAC	2	12	1954366	1954377	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021838	TCTAAT	2	12	1965422	1965433	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021838	CCTATA	2	12	1992869	1992880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021838	TAAAAA	2	12	2007926	2007937	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021838	CTAAAA	2	12	2010085	2010096	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021838	TTATTC	2	12	2015779	2015790	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021838	AATGAT	2	12	2042862	2042873	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021838	ATCCTT	2	12	2109844	2109855	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021838	ACATTT	2	12	2163877	2163888	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021838	ACATTT	2	12	2172763	2172774	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021838	ACATTT	2	12	2173279	2173290	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021838	TTACAT	2	12	2173406	2173417	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021838	TTTTTG	2	12	2254930	2254941	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021838	TTTTAC	2	12	2281241	2281252	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021838	TTGTTT	2	12	2313232	2313243	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021838	CATTTC	2	12	2320353	2320364	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021838	AAACTA	2	12	2330741	2330752	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021838	TCTATG	2	12	2372209	2372220	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021838	TGTATT	2	12	2421639	2421650	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021838	TTTTTA	2	12	2426088	2426099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021838	TAAAGT	2	12	2431456	2431467	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021838	ATATAA	2	12	2467167	2467178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021838	TTGACT	2	12	2481952	2481963	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021838	CGCCTA	2	12	2483766	2483777	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021838	TTTCCT	2	12	2485418	2485429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021838	TTGAAT	2	12	2486990	2487001	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021838	CGCCTA	2	12	2489785	2489796	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021838	TTTCCT	2	12	2491437	2491448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021838	TTGAAT	2	12	2493009	2493020	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021838	AAATGG	2	12	2493993	2494004	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021838	GTTTTG	2	12	2500961	2500972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021838	CTCTAT	2	12	2601620	2601631	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021838	TCATTT	2	12	2602818	2602829	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021838	GTTTTC	2	12	2629987	2629998	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021838	CAAAAA	2	12	2647710	2647721	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_021838	GAAAAA	2	12	2651570	2651581	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021838	TTCACT	2	12	2804153	2804164	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021838	ATTCAA	2	12	2814883	2814894	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021838	TATATT	2	12	2876379	2876390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021838	ATCGAC	2	12	2925237	2925248	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021838	AATTTT	2	12	2934063	2934074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021838	AAATTG	2	12	2940239	2940250	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021838	CTCTGT	2	12	2947083	2947094	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021838	TTATTT	2	12	3002103	3002114	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021838	TTTTTG	2	12	3033765	3033776	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.