MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain R2-502

Total Repeats: 1130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021838	TGTTCT	2	12	2857	2868	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525927162
2	NC_021838	TGATTC	2	12	7675	7686	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525927171
3	NC_021838	GGAAAT	2	12	18492	18503	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525927188
4	NC_021838	GCGATA	2	12	22089	22100	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525924652
5	NC_021838	TAGTTC	2	12	27451	27462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525924657
6	NC_021838	AATTTT	2	12	27478	27489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525924657
7	NC_021838	GCTTCT	2	12	30175	30186	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525924660
8	NC_021838	TAAATT	2	12	35080	35091	50 %	50 %	0 %	0 %	525924666
9	NC_021838	TTAATG	2	12	35263	35274	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525924666
10	NC_021838	AAAAAG	2	12	37485	37496	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525924669
11	NC_021838	CATCTA	2	12	45653	45664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525924676
12	NC_021838	GTTTTG	2	12	49727	49738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525924679
13	NC_021838	TCTACA	2	12	52489	52500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525924681
14	NC_021838	TGACTT	2	12	64205	64216	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525924685
15	NC_021838	TGGTGT	2	12	65573	65584	0 %	50 %	50 %	0 %	525924686
16	NC_021838	TTTAAA	2	12	68616	68627	50 %	50 %	0 %	0 %	525924689
17	NC_021838	GCTTTG	2	12	69788	69799	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525924690
18	NC_021838	GCAATT	2	12	73728	73739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525924693
19	NC_021838	AAGAAA	2	12	78218	78229	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525924699
20	NC_021838	ATTTAT	2	12	81420	81431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525927192
21	NC_021838	GAATTT	2	12	82521	82532	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525924704
22	NC_021838	CACGAC	2	12	82889	82900	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525924704
23	NC_021838	ACACCA	2	12	83077	83088	50 %	0 %	0 %	50 %	525924704
24	NC_021838	ATCTTC	2	12	91849	91860	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525924712
25	NC_021838	AAATCG	2	12	92304	92315	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525924712
26	NC_021838	AATCGT	2	12	94192	94203	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525924715
27	NC_021838	GGCATT	2	12	99604	99615	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525924720
28	NC_021838	ATCGAA	2	12	100049	100060	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525924721
29	NC_021838	ATTAAC	2	12	104777	104788	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525924725
30	NC_021838	CTTTTT	2	12	105571	105582	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525924726
31	NC_021838	ACTAAA	2	12	105828	105839	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525924726
32	NC_021838	GTAATA	2	12	106364	106375	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525924727
33	NC_021838	TGCGTT	2	12	106725	106736	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525924728
34	NC_021838	TGCTTT	2	12	112272	112283	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525924735
35	NC_021838	TAAGAA	2	12	115859	115870	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525924739
36	NC_021838	CGTTTC	2	12	125136	125147	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525924751
37	NC_021838	AAGTAG	2	12	130464	130475	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525924752
38	NC_021838	ACCAGT	2	12	133359	133370	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525924754
39	NC_021838	CAAAAT	2	12	134531	134542	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525924754
40	NC_021838	CTTGAT	2	12	135416	135427	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525924754
41	NC_021838	CAAAAA	2	12	137464	137475	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525924755
42	NC_021838	TAACAG	2	12	139721	139732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525924757
43	NC_021838	CTATTT	2	12	140450	140461	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525924757
44	NC_021838	TTTGTT	2	12	140528	140539	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525924757
45	NC_021838	CCTTTA	2	12	144765	144776	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525924763
46	NC_021838	ACTGGA	2	12	145620	145631	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525924764
47	NC_021838	TGAAAG	2	12	148325	148336	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525924766
48	NC_021838	TAAATC	2	12	148983	148994	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525924766
49	NC_021838	TGGAAC	2	12	149447	149458	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525924767
50	NC_021838	TACTTC	2	12	149981	149992	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525924767
51	NC_021838	TCTTTT	2	12	151686	151697	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525924769
52	NC_021838	AACCAA	2	12	153331	153342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525924770
53	NC_021838	TTTTCC	2	12	154049	154060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525924770
54	NC_021838	AGTGTA	2	12	158898	158909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525924775
55	NC_021838	GAAATC	2	12	160257	160268	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525924776
56	NC_021838	ATTTAA	2	12	162841	162852	50 %	50 %	0 %	0 %	525927197
57	NC_021838	TTTCCA	2	12	169286	169297	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525924783
58	NC_021838	TGGTCT	2	12	178560	178571	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525924792
59	NC_021838	TGCTTC	2	12	178992	179003	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525924793
60	NC_021838	TACGTT	2	12	180197	180208	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525924793
61	NC_021838	ACCTGA	2	12	181366	181377	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525924794
62	NC_021838	ATTTTT	2	12	181543	181554	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525924794
63	NC_021838	ACCTGA	2	12	183184	183195	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525924794
64	NC_021838	GTTTTT	2	12	186472	186483	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525924798
65	NC_021838	AAAAAT	2	12	186587	186598	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525924798
66	NC_021838	ATTAAT	2	12	189526	189537	50 %	50 %	0 %	0 %	525927199
67	NC_021838	TCTTGT	2	12	192061	192072	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525924804
68	NC_021838	AGTCCA	2	12	193003	193014	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525924805
69	NC_021838	ATCTAA	2	12	194487	194498	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525924805
70	NC_021838	ATAACC	2	12	198512	198523	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525924809
71	NC_021838	ATTAGA	2	12	200593	200604	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525924810
72	NC_021838	GTTACT	2	12	201803	201814	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525924811
73	NC_021838	AATGTT	2	12	202505	202516	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525924812
74	NC_021838	TTCAAT	2	12	204360	204371	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525924814
75	NC_021838	TTTTCG	2	12	215207	215218	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525924824
76	NC_021838	ATCTAA	2	12	216324	216335	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525924825
77	NC_021838	CTTTTG	2	12	220164	220175	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525924829
78	NC_021838	ATCAAT	2	12	223669	223680	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525924833
79	NC_021838	AGCCGG	2	12	224428	224439	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525924834
80	NC_021838	TAAAAC	2	12	231508	231519	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525924842
81	NC_021838	TTTGGT	2	12	238692	238703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525924849
82	NC_021838	GCCGCA	2	12	240689	240700	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525924851
83	NC_021838	GCATTT	2	12	240995	241006	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525924852
84	NC_021838	CTTTTT	2	12	247508	247519	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525924856
85	NC_021838	TGGTTT	2	12	249717	249728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525924858
86	NC_021838	TTCTGC	2	12	251478	251489	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525924859
87	NC_021838	AATCCA	2	12	253481	253492	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525927201
88	NC_021838	TCTTCA	2	12	257970	257981	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525924862
89	NC_021838	TAAGTT	2	12	265704	265715	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525924871
90	NC_021838	TAATCA	2	12	267761	267772	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525924873
91	NC_021838	ATGATT	2	12	270879	270890	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525924877
92	NC_021838	CAATGT	2	12	272460	272471	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525924879
93	NC_021838	TCTAAG	2	12	282884	282895	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525924888
94	NC_021838	CGGCAC	2	12	283190	283201	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525924888
95	NC_021838	AACCAA	2	12	284103	284114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525924889
96	NC_021838	TGTTCG	2	12	289347	289358	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525927210
97	NC_021838	TACTAG	2	12	289383	289394	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525927210
98	NC_021838	TGTTTC	2	12	292820	292831	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525927214
99	NC_021838	AGTTGC	2	12	296356	296367	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525927215
100	NC_021838	CCTAAA	2	12	297602	297613	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525927215
101	NC_021838	ATGTTG	2	12	298437	298448	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525927215
102	NC_021838	TTAAAT	2	12	299753	299764	50 %	50 %	0 %	0 %	525927217
103	NC_021838	ACAGAA	2	12	299841	299852	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525927218
104	NC_021838	TTGCTT	2	12	299953	299964	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525927218
105	NC_021838	TTTTTG	2	12	305339	305350	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525927226
106	NC_021838	ATTTCC	2	12	308174	308185	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525924893
107	NC_021838	TGTTCT	2	12	308482	308493	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525927227
108	NC_021838	ATATTG	2	12	312956	312967	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525927232
109	NC_021838	TGATTC	2	12	314635	314646	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525927235
110	NC_021838	CCACTC	2	12	315343	315354	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	525927235
111	NC_021838	TCTGCA	2	12	317182	317193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525927237
112	NC_021838	CCCGCT	2	12	324598	324609	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	525927248
113	NC_021838	CCATTT	2	12	330828	330839	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525924903
114	NC_021838	GCACTT	2	12	331666	331677	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525924903
115	NC_021838	AACTAG	2	12	333220	333231	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525924904
116	NC_021838	ATCAAC	2	12	339190	339201	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525927250
117	NC_021838	TAAAAT	2	12	339359	339370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525927250
118	NC_021838	TTTTCC	2	12	342243	342254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525927253
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342	NC_021838	TACGAA	2	12	1036282	1036293	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525925467
343	NC_021838	AAAACT	2	12	1042623	1042634	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525925473
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