MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain R2-502

Total Repeats: 364

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021838	ACTTG	2	10	15249	15258	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021838	TATAA	2	10	15332	15341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021838	CTTTT	2	10	17640	17649	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021838	CTTTT	2	10	18753	18762	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021838	TCACT	2	10	21039	21048	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_021838	CTATA	2	10	36483	36492	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021838	GAAAA	2	10	42580	42589	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021838	TTAAT	2	10	53994	54003	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021838	TTACC	2	10	57998	58007	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_021838	CACGA	2	10	59719	59728	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_021838	AATTA	2	10	60878	60887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021838	AAGTT	2	10	72220	72229	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021838	AATTT	2	10	90352	90361	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021838	TTATG	2	10	95683	95692	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021838	AAACA	2	10	97899	97908	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021838	TATTT	2	10	103741	103750	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021838	TCCTC	2	10	108140	108149	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_021838	ATAAG	2	10	118187	118196	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021838	GTTTT	2	10	126770	126779	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021838	TTTTA	2	10	158210	158219	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021838	CTTTT	2	10	164357	164366	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021838	AGCAA	2	10	185349	185358	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021838	TTTAT	2	10	185487	185496	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021838	GGAAA	2	10	187504	187513	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021838	ATCTT	2	10	195470	195479	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_021838	TATCA	2	10	198220	198229	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021838	TACCA	2	10	199670	199679	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_021838	GCTTT	2	10	212692	212701	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021838	ATAAA	2	10	212705	212714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021838	GTTTG	2	10	230515	230524	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021838	GAAAG	2	10	242370	242379	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021838	CCAAT	2	10	243640	243649	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_021838	CTTTT	2	10	244213	244222	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021838	AAATC	2	10	245061	245070	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021838	AAATA	2	10	257627	257636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021838	AAGTC	2	10	257656	257665	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021838	ATTAT	2	10	260826	260835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021838	ATCAT	2	10	269993	270002	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021838	TTATA	2	10	281934	281943	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021838	TTTTA	2	10	282349	282358	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021838	CACCC	2	10	285757	285766	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
42	NC_021838	TAAAA	2	10	286282	286291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021838	TACGT	2	10	321433	321442	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_021838	CTTTT	2	10	323801	323810	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021838	TTACC	2	10	327648	327657	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_021838	CACGA	2	10	329369	329378	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_021838	AATTA	2	10	330528	330537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021838	TCGTT	2	10	334908	334917	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021838	CAAGG	2	10	334954	334963	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021838	GAAAA	2	10	334985	334994	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021838	GGGGC	2	10	336011	336020	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021838	AATAT	2	10	344929	344938	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021838	AAACT	2	10	356250	356259	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021838	TTAAT	2	10	367264	367273	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021838	TACAA	2	10	372049	372058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021838	TTAGA	2	10	372270	372279	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021838	ATTTT	2	10	372365	372374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021838	TAAAA	2	10	395173	395182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021838	ACATC	2	10	413845	413854	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_021838	ATTAA	2	10	433922	433931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021838	TTTCC	2	10	435144	435153	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_021838	TCATG	2	10	447659	447668	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021838	TAAAA	2	10	449125	449134	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021838	CAAAC	2	10	450119	450128	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_021838	CTTTT	2	10	456784	456793	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021838	GGCTA	2	10	458393	458402	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021838	TTGGA	2	10	467288	467297	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021838	TATAG	2	10	473476	473485	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021838	AAAAT	2	10	479394	479403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021838	TATAT	2	10	491556	491565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021838	TAGAA	2	10	502241	502250	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021838	CTTAA	2	10	533160	533169	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_021838	TTTTA	2	10	534661	534670	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021838	TAAAA	2	10	546950	546959	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021838	AAACC	2	10	547835	547844	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_021838	GGTTT	2	10	556274	556283	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021838	CACTC	2	10	567654	567663	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_021838	TATCA	2	10	611162	611171	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_021838	TACAT	2	10	612154	612163	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_021838	AAATG	2	10	635887	635896	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021838	GAAAA	2	10	646219	646228	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021838	AAAGG	2	10	647446	647455	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021838	TTCTA	2	10	647940	647949	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021838	GACTT	2	10	663242	663251	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021838	ATGGT	2	10	665493	665502	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021838	AAATA	2	10	667549	667558	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021838	TAAAA	2	10	668531	668540	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021838	TTATG	2	10	670738	670747	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021838	AGTAG	2	10	690877	690886	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021838	TTTTA	2	10	695245	695254	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021838	TTTTA	2	10	695350	695359	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021838	ATTTT	2	10	704686	704695	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021838	ATATC	2	10	725027	725036	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_021838	AGAGA	2	10	739244	739253	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021838	TTACT	2	10	740683	740692	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_021838	AAAGT	2	10	742924	742933	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021838	GATAA	2	10	765643	765652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021838	ATATG	2	10	772623	772632	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021838	TTGTA	2	10	784676	784685	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021838	ATAGA	2	10	805381	805390	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021838	TTGTC	2	10	810907	810916	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021838	ACAAA	2	10	811272	811281	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021838	ATATA	2	10	819018	819027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021838	GAGTG	2	10	827148	827157	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021838	AGCCG	2	10	835325	835334	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_021838	GAATA	2	10	846950	846959	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021838	AAATT	2	10	848635	848644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021838	TAATT	2	10	848836	848845	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021838	TCGTG	2	10	849995	850004	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021838	AAGGT	2	10	851463	851472	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021838	AACCT	2	10	857627	857636	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_021838	ATAAA	2	10	869603	869612	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021838	CTTTT	2	10	879261	879270	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021838	TAAAA	2	10	884054	884063	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021838	GAACA	2	10	892615	892624	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_021838	GTAAG	2	10	897719	897728	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021838	TATTT	2	10	907182	907191	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021838	AAAGA	2	10	907336	907345	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021838	GAGTA	2	10	916479	916488	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021838	ATCTT	2	10	921818	921827	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_021838	ATGAA	2	10	924675	924684	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021838	AAATA	2	10	946475	946484	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021838	TATTT	2	10	946498	946507	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021838	ATAAA	2	10	951459	951468	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021838	ATGAT	2	10	951500	951509	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021838	TAATT	2	10	951677	951686	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021838	TCGTG	2	10	952836	952845	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021838	AAGGT	2	10	954304	954313	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021838	ATTAT	2	10	958198	958207	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021838	TATGA	2	10	984407	984416	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021838	ATGGA	2	10	990783	990792	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021838	TAAAA	2	10	994396	994405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021838	AATAA	2	10	994453	994462	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021838	ATTTT	2	10	996722	996731	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021838	TTGCA	2	10	997119	997128	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021838	TTTTA	2	10	1000382	1000391	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021838	GTAAA	2	10	1034479	1034488	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021838	TTGAC	2	10	1042878	1042887	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_021838	AAATT	2	10	1049723	1049732	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021838	CTTTT	2	10	1055738	1055747	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_021838	TTAAC	2	10	1061065	1061074	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021838	AGTAT	2	10	1063326	1063335	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021838	TTTGT	2	10	1063910	1063919	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021838	AATAG	2	10	1063920	1063929	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021838	TAAAA	2	10	1063988	1063997	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021838	TATAT	2	10	1068367	1068376	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021838	ATATT	2	10	1075080	1075089	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_021838	CAAAA	2	10	2313204	2313213	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_021838	AATTT	2	10	2318555	2318564	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021838	ATTTA	2	10	2320120	2320129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_021838	TAAAA	2	10	2320563	2320572	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_021838	TCTTT	2	10	2329966	2329975	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
293	NC_021838	GTTTT	2	10	2334105	2334114	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
294	NC_021838	TTGTT	2	10	2334458	2334467	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_021838	AACTC	2	10	2351111	2351120	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
297	NC_021838	TCTCC	2	10	2359004	2359013	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
298	NC_021838	TAAAA	2	10	2362906	2362915	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_021838	TTTTA	2	10	2383355	2383364	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_021838	CATTT	2	10	2397249	2397258	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
301	NC_021838	AAAAT	2	10	2397383	2397392	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_021838	TATGA	2	10	2397409	2397418	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
303	NC_021838	AAAAT	2	10	2400338	2400347	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_021838	TTACC	2	10	2490444	2490453	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
310	NC_021838	CACGA	2	10	2491914	2491923	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
311	NC_021838	AATTA	2	10	2493073	2493082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_021838	ACTCC	2	10	2500389	2500398	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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320	NC_021838	CATTT	2	10	2573340	2573349	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
321	NC_021838	TAGCA	2	10	2577558	2577567	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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323	NC_021838	AGCAT	2	10	2602685	2602694	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
324	NC_021838	ATAGA	2	10	2627174	2627183	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
325	NC_021838	CTTTA	2	10	2633693	2633702	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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327	NC_021838	CTAGC	2	10	2647298	2647307	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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330	NC_021838	ACCTT	2	10	2680007	2680016	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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332	NC_021838	TAACA	2	10	2694027	2694036	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
333	NC_021838	TTGCT	2	10	2698361	2698370	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
334	NC_021838	AAATT	2	10	2706352	2706361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
335	NC_021838	CTTTT	2	10	2727393	2727402	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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340	NC_021838	CACTT	2	10	2768803	2768812	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
341	NC_021838	AATTC	2	10	2774623	2774632	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
342	NC_021838	TTTTA	2	10	2779093	2779102	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_021838	CTTTT	2	10	2795297	2795306	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
344	NC_021838	AGCAT	2	10	2808628	2808637	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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347	NC_021838	AATTT	2	10	2864313	2864322	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
348	NC_021838	CACTA	2	10	2872203	2872212	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
349	NC_021838	GTATC	2	10	2875308	2875317	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
350	NC_021838	GAAAA	2	10	2875514	2875523	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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362	NC_021838	TAACA	2	10	3005211	3005220	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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364	NC_021838	TGAAT	2	10	3033616	3033625	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.