MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-031

Total Repeats: 1191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021837	GCCGCA	2	12	4332	4343	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525916943
2	NC_021837	TCGTTA	2	12	4879	4890	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525916943
3	NC_021837	CTCACC	2	12	4990	5001	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	525916943
4	NC_021837	TAGTTC	2	12	5611	5622	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525916944
5	NC_021837	GCTTCT	2	12	18790	18801	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525916958
6	NC_021837	TCATTT	2	12	20816	20827	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525916960
7	NC_021837	TGCAAT	2	12	21254	21265	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525916961
8	NC_021837	CTTTCT	2	12	24269	24280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916963
9	NC_021837	GAAAAA	2	12	27628	27639	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525919448
10	NC_021837	CTTCGA	2	12	30782	30793	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525916967
11	NC_021837	TACCAT	2	12	34005	34016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021837	TTATAG	2	12	43223	43234	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021837	CTTCCA	2	12	44837	44848	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525916978
14	NC_021837	GACACG	2	12	46444	46455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525916979
15	NC_021837	TTTTAT	2	12	51669	51680	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525916983
16	NC_021837	GTTTTA	2	12	53089	53100	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525916984
17	NC_021837	GCAAAT	2	12	53536	53547	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525916984
18	NC_021837	GGTGAG	2	12	54148	54159	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	525916984
19	NC_021837	AGTACA	2	12	54343	54354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525916984
20	NC_021837	AAACAG	2	12	54443	54454	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525916984
21	NC_021837	GCATAA	2	12	56987	56998	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525916987
22	NC_021837	TTGATT	2	12	58415	58426	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525916988
23	NC_021837	AAGTCC	2	12	63887	63898	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525919456
24	NC_021837	TTGCTT	2	12	66817	66828	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525919457
25	NC_021837	TATCGC	2	12	67909	67920	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525919458
26	NC_021837	CATCAA	2	12	68296	68307	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525919458
27	NC_021837	CTAAAT	2	12	69391	69402	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525919458
28	NC_021837	TAATAT	2	12	71316	71327	50 %	50 %	0 %	0 %	525916995
29	NC_021837	ACCAAG	2	12	76242	76253	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525916999
30	NC_021837	TTTCTT	2	12	78199	78210	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525917002
31	NC_021837	GTAAAA	2	12	79037	79048	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525917002
32	NC_021837	ATTAAT	2	12	80949	80960	50 %	50 %	0 %	0 %	525919459
33	NC_021837	TTTTTC	2	12	81529	81540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525919460
34	NC_021837	TTTTAC	2	12	86584	86595	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525917009
35	NC_021837	ATACCA	2	12	87901	87912	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525917010
36	NC_021837	AAATGT	2	12	88087	88098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525917010
37	NC_021837	AGGGAG	2	12	88941	88952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021837	GAACGT	2	12	89511	89522	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525917012
39	NC_021837	AATAAA	2	12	89827	89838	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525917012
40	NC_021837	CAATAC	2	12	97933	97944	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525917018
41	NC_021837	ATATCG	2	12	103357	103368	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525917022
42	NC_021837	CAAAAA	2	12	106343	106354	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525917026
43	NC_021837	ATTTGC	2	12	111634	111645	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525917032
44	NC_021837	TGTTGC	2	12	111673	111684	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525917032
45	NC_021837	TTGATA	2	12	113851	113862	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525917035
46	NC_021837	TGCTTG	2	12	115053	115064	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525917036
47	NC_021837	CATTTC	2	12	120017	120028	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525919465
48	NC_021837	TAGCAC	2	12	121573	121584	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021837	TTTATA	2	12	123207	123218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525917042
50	NC_021837	GAAATC	2	12	126327	126338	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525917045
51	NC_021837	CTTTTA	2	12	127615	127626	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525917047
52	NC_021837	GCTTTT	2	12	131135	131146	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525919469
53	NC_021837	ATTATC	2	12	133211	133222	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021837	TTCATT	2	12	135284	135295	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525917050
55	NC_021837	GGTCTG	2	12	135959	135970	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525917051
56	NC_021837	GAGTCA	2	12	137340	137351	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021837	TGTATT	2	12	139836	139847	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525917053
58	NC_021837	CTTTCG	2	12	140939	140950	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525917053
59	NC_021837	TTAATG	2	12	149154	149165	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525917064
60	NC_021837	TTGCTT	2	12	156157	156168	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525919479
61	NC_021837	AATCTA	2	12	162892	162903	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525919481
62	NC_021837	AAAGAT	2	12	164137	164148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525919481
63	NC_021837	CAGTTT	2	12	169262	169273	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525919482
64	NC_021837	TTTTCT	2	12	170668	170679	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525917070
65	NC_021837	ATTTTC	2	12	178000	178011	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525917076
66	NC_021837	AACCAG	2	12	179352	179363	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525917078
67	NC_021837	ATACTA	2	12	181716	181727	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525919484
68	NC_021837	TATAAT	2	12	181962	181973	50 %	50 %	0 %	0 %	525919484
69	NC_021837	GTAAAA	2	12	182107	182118	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525919484
70	NC_021837	CATCTA	2	12	185265	185276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525919487
71	NC_021837	CAAGAA	2	12	186153	186164	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525919488
72	NC_021837	AATGGA	2	12	190453	190464	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525917082
73	NC_021837	GTCCAA	2	12	193104	193115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021837	CAATTG	2	12	199851	199862	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525917089
75	NC_021837	TGAATC	2	12	199882	199893	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525917089
76	NC_021837	CCCTTC	2	12	203528	203539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525917092
77	NC_021837	TTATTT	2	12	205325	205336	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525917093
78	NC_021837	AAATCA	2	12	208629	208640	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525917096
79	NC_021837	CGCAGC	2	12	209032	209043	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525917096
80	NC_021837	AGAATA	2	12	214656	214667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525919496
81	NC_021837	AATTGA	2	12	215285	215296	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525919497
82	NC_021837	CGTTTT	2	12	217119	217130	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525917102
83	NC_021837	CAACGT	2	12	219027	219038	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525917103
84	NC_021837	TAAAAG	2	12	221904	221915	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525917106
85	NC_021837	TGTATT	2	12	222733	222744	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021837	TTTTCA	2	12	223776	223787	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525917108
87	NC_021837	ATTGAT	2	12	224135	224146	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525917109
88	NC_021837	TGAACT	2	12	224278	224289	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525917109
89	NC_021837	AAAAGA	2	12	226543	226554	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525917111
90	NC_021837	ATTTCG	2	12	229506	229517	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525917113
91	NC_021837	TAAAGT	2	12	231323	231334	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021837	GTTTTT	2	12	232106	232117	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525917116
93	NC_021837	TAATTC	2	12	233805	233816	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525919498
94	NC_021837	ATTTGG	2	12	236412	236423	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525919500
95	NC_021837	CACGAA	2	12	242400	242411	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525917119
96	NC_021837	AGTGTA	2	12	243912	243923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525917119
97	NC_021837	TTTCTT	2	12	248156	248167	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525917120
98	NC_021837	ATTGTC	2	12	250740	250751	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525917121
99	NC_021837	GCTACA	2	12	255108	255119	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525917123
100	NC_021837	ATTTTT	2	12	257385	257396	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525917127
101	NC_021837	TTGTTT	2	12	258233	258244	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525917128
102	NC_021837	TACTGT	2	12	258609	258620	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525917129
103	NC_021837	ATATAA	2	12	258938	258949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021837	TCCTTT	2	12	262776	262787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917136
105	NC_021837	ACCTTT	2	12	263910	263921	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525917137
106	NC_021837	CTTTTA	2	12	266034	266045	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525917139
107	NC_021837	TCTTTT	2	12	270371	270382	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525917142
108	NC_021837	GGTAAA	2	12	273293	273304	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525917145
109	NC_021837	TTGACT	2	12	273722	273733	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021837	CGCCTA	2	12	275536	275547	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021837	TTTCCT	2	12	277188	277199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021837	TTGAAT	2	12	278760	278771	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021837	CGCCTA	2	12	281559	281570	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021837	TTTCCT	2	12	283211	283222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021837	TTGAAT	2	12	284783	284794	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021837	TGGTTC	2	12	287069	287080	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525917147
117	NC_021837	TTTTTC	2	12	287633	287644	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525917147
118	NC_021837	ATCAAT	2	12	288096	288107	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525917148
119	NC_021837	CAAAAC	2	12	289042	289053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021837	TGGAGA	2	12	290754	290765	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525917150
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122	NC_021837	CACCGA	2	12	294619	294630	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525917153
123	NC_021837	GTTTTC	2	12	295670	295681	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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125	NC_021837	CACTTG	2	12	298539	298550	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525917155
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230	NC_021837	TTTGGC	2	12	570621	570632	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525917357
231	NC_021837	ATTTTG	2	12	573587	573598	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525917360
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