MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni 32488

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021834	GCTTTT	2	12	282	293	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021834	ATTTTG	2	12	686	697	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021834	AATAAA	2	12	25262	25273	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021834	TTTAAA	2	12	43662	43673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021834	ATTTTT	2	12	43823	43834	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021834	TTCATT	2	12	44221	44232	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021834	ATCTTA	2	12	54412	54423	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021834	CATTAA	2	12	58616	58627	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021834	CAATCT	2	12	59187	59198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021834	ATCTTA	2	12	59614	59625	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021834	CTCATC	2	12	111771	111782	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021834	TCATCT	2	12	112345	112356	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021834	TTTTCC	2	12	112725	112736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021834	TCAATA	2	12	112834	112845	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021834	GCTCTT	2	12	113194	113205	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021834	TATTTG	2	12	170770	170781	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021834	ATTTTA	2	12	216594	216605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021834	TTAATT	2	12	313445	313456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021834	TTAATT	2	12	341433	341444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021834	AATTTT	2	12	376709	376720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021834	TAAAAA	2	12	412884	412895	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021834	CTTTAT	2	12	424704	424715	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021834	CTTTTA	2	12	462802	462813	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021834	TATCTA	2	12	479720	479731	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021834	CAAAAA	2	12	499988	499999	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021834	TTAATT	2	12	509254	509265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021834	TGCTTG	2	12	540283	540294	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021834	TTCCAG	2	12	540793	540804	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021834	ATTTTT	2	12	540836	540847	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021834	ATTATA	2	12	542918	542929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021834	CAAGAA	2	12	582086	582097	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021834	TATTAA	2	12	582799	582810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021834	AAAAGA	2	12	583327	583338	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021834	AAAATA	2	12	588119	588130	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021834	TTTTCT	2	12	615474	615485	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021834	TATAAT	2	12	656682	656693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021834	TAAAAA	2	12	722945	722956	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021834	TTGGAC	2	12	738689	738700	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021834	ATTTTT	2	12	781112	781123	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021834	ATATAA	2	12	794612	794623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021834	ACTATT	2	12	794926	794937	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021834	CAAATA	2	12	795050	795061	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021834	TGGTAG	2	12	796762	796773	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021834	CTTATG	2	12	797610	797621	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021834	TAAAAA	2	12	824064	824075	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021834	TAAAAT	2	12	835004	835015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021834	AAGCCT	2	12	835107	835118	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021834	TAAAAT	2	12	840019	840030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021834	AATTTA	2	12	859545	859556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021834	ATTTAT	2	12	879625	879636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021834	TACAGC	2	12	907612	907623	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021834	CTTTTA	2	12	907766	907777	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021834	TAAAAT	2	12	935907	935918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021834	AAATAA	2	12	985887	985898	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021834	ATTTTT	2	12	1005048	1005059	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021834	ATATTA	2	12	1012083	1012094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021834	AATATT	2	12	1012225	1012236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021834	AAAACC	2	12	1022893	1022904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021834	GTTTAT	2	12	1045934	1045945	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021834	AAAATT	2	12	1048302	1048313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021834	TTAATT	2	12	1063458	1063469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021834	TATATT	2	12	1064030	1064041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021834	AAAAAT	2	12	1065440	1065451	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021834	TATATT	2	12	1080194	1080205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021834	TATAAA	2	12	1080332	1080343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021834	AAAATT	2	12	1114377	1114388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021834	TTTAAA	2	12	1155461	1155472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021834	CTATGA	2	12	1155706	1155717	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021834	GCTTTA	2	12	1170515	1170526	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021834	TATTTT	2	12	1209593	1209604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021834	TGTGTT	2	12	1217024	1217035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021834	ATTTAT	2	12	1242048	1242059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021834	TTTATT	2	12	1245753	1245764	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021834	TTTTAT	2	12	1294420	1294431	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021834	AATTTA	2	12	1323640	1323651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021834	GTTTTT	2	12	1332139	1332150	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021834	TTTTAA	2	12	1368579	1368590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021834	CTTATA	2	12	1408431	1408442	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021834	ATATTT	2	12	1424215	1424226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021834	ATATAA	2	12	1433789	1433800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021834	TAATAG	2	12	1464270	1464281	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021834	ATTTAA	2	12	1473213	1473224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021834	TTTATT	2	12	1483427	1483438	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021834	TAAATT	2	12	1483496	1483507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021834	ATTTTT	2	12	1489675	1489686	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021834	ATAATT	2	12	1517154	1517165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021834	TTAAAT	2	12	1536736	1536747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021834	AACTTT	2	12	1542809	1542820	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021834	AATTTA	2	12	1543354	1543365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021834	ATTTAT	2	12	1546226	1546237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021834	TCTTAT	2	12	1549905	1549916	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021834	GGGTTG	2	12	1550262	1550273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021834	GTTTGG	2	12	1550444	1550455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021834	AATTAA	2	12	1551746	1551757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021834	TTAGCT	2	12	1552217	1552228	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021834	CTTCTA	2	12	1552235	1552246	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021834	TAACAA	2	12	1601243	1601254	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021834	ATATAG	2	12	1621869	1621880	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021834	AAATTT	2	12	1624874	1624885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021834	AATTTT	2	12	1638172	1638183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021834	ATATTT	2	12	1662167	1662178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021834	AAATTA	2	12	1665962	1665973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021834	ACAAAG	2	12	1678787	1678798	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021834	TTTTTA	2	12	1681264	1681275	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021834	ATTCTA	2	12	1694712	1694723	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021834	TTTGAT	2	12	1702094	1702105	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.