MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni 32488

Total Repeats: 1016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021834	TATAGT	2	12	731	742	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525911749
2	NC_021834	CAGTAG	2	12	2522	2533	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525911751
3	NC_021834	TAATTT	2	12	3815	3826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525911752
4	NC_021834	AATTTT	2	12	5275	5286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525911754
5	NC_021834	AACTAT	2	12	7862	7873	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525911755
6	NC_021834	TCCACT	2	12	11376	11387	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525911759
7	NC_021834	AGTTTT	2	12	11758	11769	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525911760
8	NC_021834	TATGAG	2	12	12969	12980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525911761
9	NC_021834	TGGAAT	2	12	13355	13366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525911762
10	NC_021834	TTTAGA	2	12	15932	15943	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525911766
11	NC_021834	AAGCCA	2	12	16977	16988	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525911767
12	NC_021834	AATTTG	2	12	17678	17689	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525911768
13	NC_021834	TGCACA	2	12	18425	18436	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525911768
14	NC_021834	TAACAT	2	12	20914	20925	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525911770
15	NC_021834	CAAAAA	2	12	22745	22756	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525913105
16	NC_021834	TTTATT	2	12	26222	26233	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525911772
17	NC_021834	CAAGGA	2	12	33769	33780	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525911777
18	NC_021834	ACGATA	2	12	34407	34418	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525911777
19	NC_021834	ATTTTC	2	12	37463	37474	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525911779
20	NC_021834	TTTTTG	2	12	38729	38740	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525911780
21	NC_021834	TGGATT	2	12	39610	39621	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525911781
22	NC_021834	TTTTCA	2	12	41323	41334	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525911783
23	NC_021834	CTTTAG	2	12	45557	45568	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525911786
24	NC_021834	TAGCCA	2	12	48486	48497	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525911788
25	NC_021834	TGCCAC	2	12	48987	48998	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525911788
26	NC_021834	AATTTT	2	12	51330	51341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525911790
27	NC_021834	TCCAAA	2	12	51864	51875	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525911790
28	NC_021834	TTTTAT	2	12	53619	53630	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525911792
29	NC_021834	ATTTTT	2	12	55281	55292	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525911796
30	NC_021834	TAAATG	2	12	60124	60135	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525913107
31	NC_021834	TAAGGT	2	12	60623	60634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525913107
32	NC_021834	TAATAT	2	12	61085	61096	50 %	50 %	0 %	0 %	525913108
33	NC_021834	AAGATG	2	12	62556	62567	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525913109
34	NC_021834	TAAAAG	2	12	63032	63043	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525913110
35	NC_021834	TTAGCT	2	12	63251	63262	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525913111
36	NC_021834	TCAAAT	2	12	63462	63473	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525913111
37	NC_021834	AGATGG	2	12	64239	64250	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525913111
38	NC_021834	TGGAGA	2	12	64422	64433	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525913111
39	NC_021834	GGTATA	2	12	67413	67424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525911803
40	NC_021834	ATGAAA	2	12	72122	72133	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525911807
41	NC_021834	TTTTAT	2	12	75582	75593	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525911810
42	NC_021834	TTCTTG	2	12	80127	80138	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525911814
43	NC_021834	TTTTTG	2	12	80846	80857	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525911815
44	NC_021834	ATGCTT	2	12	81607	81618	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525911816
45	NC_021834	GCAAAA	2	12	83390	83401	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525911819
46	NC_021834	AAAAAC	2	12	85519	85530	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525911821
47	NC_021834	AGATGA	2	12	85859	85870	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525911821
48	NC_021834	CAAAGA	2	12	86006	86017	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525911821
49	NC_021834	ATAAAA	2	12	87975	87986	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525913115
50	NC_021834	CTATAA	2	12	89474	89485	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525911824
51	NC_021834	TTTTAA	2	12	90437	90448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525911825
52	NC_021834	AAATTT	2	12	91243	91254	50 %	50 %	0 %	0 %	525911825
53	NC_021834	TGATTT	2	12	91650	91661	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525911826
54	NC_021834	AGCTAT	2	12	92462	92473	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525911826
55	NC_021834	AACAAT	2	12	92474	92485	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525911826
56	NC_021834	TTAAAT	2	12	92739	92750	50 %	50 %	0 %	0 %	525911826
57	NC_021834	AGGTAT	2	12	96236	96247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525911829
58	NC_021834	TAAAAT	2	12	103391	103402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525911835
59	NC_021834	AAAATA	2	12	103887	103898	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525911835
60	NC_021834	CTTAAA	2	12	105926	105937	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525913116
61	NC_021834	TTTTGA	2	12	106025	106036	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525913117
62	NC_021834	TTAAAG	2	12	107085	107096	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525913117
63	NC_021834	TTTCTT	2	12	109905	109916	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525911841
64	NC_021834	ATTTTG	2	12	111060	111071	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525911842
65	NC_021834	TTATTT	2	12	115067	115078	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525911844
66	NC_021834	CCAAAG	2	12	116827	116838	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525911845
67	NC_021834	AATGCA	2	12	118549	118560	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525911846
68	NC_021834	AATTTA	2	12	119202	119213	50 %	50 %	0 %	0 %	525911847
69	NC_021834	ATAAAG	2	12	119404	119415	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525911847
70	NC_021834	AGTGTA	2	12	119852	119863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525911848
71	NC_021834	TTTTTA	2	12	120599	120610	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525911848
72	NC_021834	GCATTA	2	12	121833	121844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525911848
73	NC_021834	TCCACC	2	12	125364	125375	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	525911852
74	NC_021834	TTATAA	2	12	125993	126004	50 %	50 %	0 %	0 %	525911853
75	NC_021834	TAGCTT	2	12	126539	126550	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525911853
76	NC_021834	TTACTT	2	12	127003	127014	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525911853
77	NC_021834	GCATAG	2	12	127118	127129	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525911853
78	NC_021834	CCTTAT	2	12	127959	127970	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525911854
79	NC_021834	CCTTAG	2	12	131649	131660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525911857
80	NC_021834	GCTTTA	2	12	132911	132922	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525911859
81	NC_021834	CTATAT	2	12	133931	133942	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525911860
82	NC_021834	GATCAA	2	12	135115	135126	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525911862
83	NC_021834	CTTTTT	2	12	137126	137137	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525913118
84	NC_021834	TTAAGA	2	12	137152	137163	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525913118
85	NC_021834	GTGGGA	2	12	137225	137236	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	525913118
86	NC_021834	TCAAAC	2	12	144306	144317	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525913123
87	NC_021834	TTATCA	2	12	144639	144650	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525913125
88	NC_021834	ATCATT	2	12	149470	149481	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525913131
89	NC_021834	CCAAAA	2	12	150892	150903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525913134
90	NC_021834	GCATTA	2	12	151968	151979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525913135
91	NC_021834	ACTTTA	2	12	152109	152120	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525913135
92	NC_021834	TAAAAG	2	12	152811	152822	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525913137
93	NC_021834	TATCAA	2	12	154820	154831	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525913139
94	NC_021834	AGGTGA	2	12	155892	155903	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525913140
95	NC_021834	GAAAAA	2	12	157253	157264	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525913142
96	NC_021834	GAAAAA	2	12	157295	157306	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525913142
97	NC_021834	TAAATG	2	12	158151	158162	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525911866
98	NC_021834	GCTTTA	2	12	158612	158623	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525913145
99	NC_021834	GAAAAT	2	12	158624	158635	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525913145
100	NC_021834	TCTACT	2	12	161867	161878	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525913150
101	NC_021834	TGAGTT	2	12	162094	162105	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525913150
102	NC_021834	TTTCAT	2	12	165649	165660	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525913157
103	NC_021834	CTTTTT	2	12	167941	167952	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525913162
104	NC_021834	TTCCTG	2	12	168636	168647	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525913163
105	NC_021834	AATTAG	2	12	171686	171697	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525913165
106	NC_021834	CTCTAA	2	12	173961	173972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525913166
107	NC_021834	ATTTTT	2	12	174156	174167	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525913166
108	NC_021834	TAAAAT	2	12	176733	176744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525911868
109	NC_021834	CTGCAA	2	12	177741	177752	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525911869
110	NC_021834	CACACC	2	12	181578	181589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525911872
111	NC_021834	CGCTTT	2	12	182240	182251	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525911872
112	NC_021834	TTCATT	2	12	184135	184146	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525911874
113	NC_021834	TTTAGA	2	12	184891	184902	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525911874
114	NC_021834	TTCAAA	2	12	187154	187165	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525911875
115	NC_021834	TTAAAA	2	12	187890	187901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525911875
116	NC_021834	ATTTTG	2	12	190334	190345	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525911879
117	NC_021834	AGCAAA	2	12	193185	193196	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525911882
118	NC_021834	TATTTT	2	12	194012	194023	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525911884
119	NC_021834	CCTTTA	2	12	194115	194126	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525911884
120	NC_021834	GAACAT	2	12	197811	197822	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525911887
121	NC_021834	ATTTCA	2	12	198187	198198	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525911888
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230	NC_021834	TTTAAA	2	12	348487	348498	50 %	50 %	0 %	0 %	525912021
231	NC_021834	GCATTT	2	12	349764	349775	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525912022
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233	NC_021834	TTTAAA	2	12	352732	352743	50 %	50 %	0 %	0 %	525912026
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236	NC_021834	TTTTAG	2	12	361716	361727	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525912035
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350	NC_021834	ATTTTA	2	12	563885	563896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525913250
351	NC_021834	ATCCTT	2	12	565359	565370	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525913251
352	NC_021834	ATTTTA	2	12	566040	566051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525913251
353	NC_021834	TATCTA	2	12	566644	566655	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525913252
354	NC_021834	ATTTAA	2	12	567403	567414	50 %	50 %	0 %	0 %	525913252
355	NC_021834	CTTTTT	2	12	567925	567936	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525913252
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381	NC_021834	TTTAAA	2	12	629039	629050	50 %	50 %	0 %	0 %	525912206
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462	NC_021834	AAATCA	2	12	766332	766343	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525912322
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468	NC_021834	TTTGAA	2	12	772392	772403	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525912328
469	NC_021834	TATCTT	2	12	774334	774345	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525912330
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