MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Spiroplasma taiwanense CT-1 plasmid

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021832	AAT	2	6	24	29	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021832	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021832	TAA	2	6	128	133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021832	TAA	3	9	141	149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021832	GAT	2	6	209	214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905725
6	NC_021832	CTA	2	6	279	284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905725
7	NC_021832	TTA	2	6	469	474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
8	NC_021832	ATT	2	6	507	512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
9	NC_021832	ATT	2	6	531	536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
10	NC_021832	ATA	2	6	556	561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905725
11	NC_021832	TAT	2	6	642	647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
12	NC_021832	ATA	2	6	727	732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905725
13	NC_021832	ATA	2	6	772	777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905725
14	NC_021832	TTA	2	6	787	792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
15	NC_021832	TGT	2	6	929	934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905725
16	NC_021832	GAA	2	6	936	941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905725
17	NC_021832	TAT	2	6	956	961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
18	NC_021832	TTG	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905725
19	NC_021832	GAT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905725
20	NC_021832	AAC	2	6	1088	1093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905725
21	NC_021832	ATA	2	6	1143	1148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021832	AAC	2	6	1199	1204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021832	TAA	2	6	1210	1215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021832	ATC	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021832	ATT	2	6	1407	1412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905726
26	NC_021832	TAC	2	6	1500	1505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905726
27	NC_021832	AAT	2	6	1512	1517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905726
28	NC_021832	ATA	2	6	1522	1527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905726
29	NC_021832	ATA	2	6	1561	1566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021832	AGC	2	6	1636	1641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021832	ATA	2	6	1681	1686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021832	CTT	2	6	1730	1735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021832	GAA	2	6	1774	1779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021832	ATT	2	6	1817	1822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021832	GTT	2	6	1861	1866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021832	ATT	2	6	2081	2086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021832	TAA	2	6	2092	2097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021832	TCT	3	9	2101	2109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021832	TTA	3	9	2114	2122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
40	NC_021832	TTA	2	6	2159	2164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
41	NC_021832	CCA	2	6	2240	2245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525905727
42	NC_021832	TAT	2	6	2248	2253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
43	NC_021832	ATT	2	6	2314	2319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
44	NC_021832	TAA	2	6	2347	2352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905727
45	NC_021832	ATT	3	9	2389	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
46	NC_021832	TAT	2	6	2481	2486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
47	NC_021832	ATT	2	6	2495	2500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
48	NC_021832	TCA	2	6	2507	2512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905727
49	NC_021832	TAT	2	6	2518	2523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
50	NC_021832	TGG	2	6	2613	2618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525905727
51	NC_021832	CTA	2	6	2658	2663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905727
52	NC_021832	TCA	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905727
53	NC_021832	ATT	2	6	2731	2736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
54	NC_021832	ATT	2	6	2755	2760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
55	NC_021832	CCT	2	6	2839	2844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_021832	ATA	2	6	2908	2913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021832	TAA	2	6	2999	3004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021832	AGG	2	6	3017	3022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021832	TTA	2	6	3048	3053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905728
60	NC_021832	ACA	2	6	3075	3080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905728
61	NC_021832	AGT	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905728
62	NC_021832	AGA	2	6	3134	3139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905728
63	NC_021832	AGC	2	6	3146	3151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525905728
64	NC_021832	GAA	2	6	3168	3173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905728
65	NC_021832	TAA	2	6	3184	3189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905728
66	NC_021832	TAG	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905728
67	NC_021832	GAA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905728
68	NC_021832	AAG	2	6	3355	3360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905728
69	NC_021832	TTA	2	6	3541	3546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905729
70	NC_021832	TTA	2	6	3550	3555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905729
71	NC_021832	GTA	2	6	3631	3636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905729
72	NC_021832	ATA	2	6	3665	3670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
73	NC_021832	AAG	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905729
74	NC_021832	ATA	2	6	3698	3703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
75	NC_021832	AAT	3	9	3721	3729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
76	NC_021832	TTA	2	6	3730	3735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905729
77	NC_021832	ATA	2	6	3746	3751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
78	NC_021832	GAT	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905729
79	NC_021832	TAA	2	6	3897	3902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
80	NC_021832	CAA	2	6	3947	3952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905729
81	NC_021832	AGT	2	6	4081	4086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905729
82	NC_021832	GCT	2	6	4099	4104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525905729
83	NC_021832	GCA	3	9	4108	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525905729
84	NC_021832	GCA	3	9	4201	4209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525905729
85	NC_021832	CAA	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905729
86	NC_021832	TAA	2	6	4334	4339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
87	NC_021832	CAG	2	6	4346	4351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525905729
88	NC_021832	TTG	2	6	4365	4370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905729
89	NC_021832	CAA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905729
90	NC_021832	AAT	2	6	4413	4418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
91	NC_021832	TAT	2	6	4588	4593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905730
92	NC_021832	TAT	2	6	4663	4668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905730
93	NC_021832	TGA	2	6	4693	4698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905730
94	NC_021832	TTA	2	6	4718	4723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905730
95	NC_021832	AGA	3	9	4816	4824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905730
96	NC_021832	ATT	2	6	4993	4998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905730
97	NC_021832	TTG	2	6	5020	5025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905730
98	NC_021832	TAA	2	6	5077	5082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905730
99	NC_021832	ATT	2	6	5105	5110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905730
100	NC_021832	AAT	2	6	5158	5163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021832	TGT	2	6	5240	5245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021832	TTC	2	6	5271	5276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021832	ACA	2	6	5290	5295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021832	TAT	2	6	5298	5303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021832	TGT	2	6	5445	5450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905731
106	NC_021832	AGA	2	6	5511	5516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905731
107	NC_021832	TAT	2	6	5549	5554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905731
108	NC_021832	TTA	2	6	5718	5723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905732
109	NC_021832	TTA	2	6	5803	5808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905732
110	NC_021832	AAT	2	6	5835	5840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905732
111	NC_021832	TAG	2	6	5989	5994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905733
112	NC_021832	TCA	2	6	6018	6023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905733
113	NC_021832	TGT	2	6	6029	6034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905733
114	NC_021832	AGA	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905733
115	NC_021832	TAA	2	6	6221	6226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905733
116	NC_021832	GAA	2	6	6234	6239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905733
117	NC_021832	AGA	2	6	6242	6247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905733
118	NC_021832	TGG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525905733
119	NC_021832	GAA	2	6	6360	6365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905733
120	NC_021832	TGA	2	6	6434	6439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905733
121	NC_021832	ATT	2	6	6449	6454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905733
122	NC_021832	AGA	2	6	6494	6499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905733
123	NC_021832	TAG	2	6	6631	6636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905734
124	NC_021832	TCA	2	6	6660	6665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905734
125	NC_021832	TGT	2	6	6671	6676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905734
126	NC_021832	AGA	2	6	6746	6751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905734
127	NC_021832	TAA	2	6	6767	6772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905734
128	NC_021832	GAA	2	6	6780	6785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905734
129	NC_021832	AGA	2	6	6809	6814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905734
130	NC_021832	TGT	2	6	7216	7221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905735
131	NC_021832	GAC	2	6	7237	7242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525905735
132	NC_021832	AGA	2	6	7261	7266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905735
133	NC_021832	ACA	3	9	7281	7289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905735
134	NC_021832	ATA	2	6	7307	7312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905735
135	NC_021832	TTA	2	6	7313	7318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905735
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.