MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 7422

Total Repeats: 618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021831	AAAATA	2	12	1592	1603	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525903164
2	NC_021831	TAAAAA	2	12	6427	6438	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525903168
3	NC_021831	TCATTT	2	12	6467	6478	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525903168
4	NC_021831	AATTTA	2	12	6591	6602	50 %	50 %	0 %	0 %	525903168
5	NC_021831	TAATTT	2	12	7974	7985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021831	GAAAAT	2	12	11568	11579	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525903172
7	NC_021831	AATCAA	2	12	14562	14573	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525903174
8	NC_021831	ATTAAC	2	12	15045	15056	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525903176
9	NC_021831	TAATTT	2	12	16021	16032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525903177
10	NC_021831	CTTTTT	2	12	17472	17483	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525903179
11	NC_021831	CAAAAA	2	12	19080	19091	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525903182
12	NC_021831	ATTGAA	2	12	22711	22722	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525903183
13	NC_021831	ATTTCA	2	12	22978	22989	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525903183
14	NC_021831	AATAAG	2	12	24662	24673	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525903185
15	NC_021831	TTTCAT	2	12	24857	24868	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525903185
16	NC_021831	TTTTCA	2	12	25642	25653	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525903185
17	NC_021831	TTAGTT	2	12	30159	30170	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525903188
18	NC_021831	TTTTAA	2	12	30522	30533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525903188
19	NC_021831	AATAAA	2	12	30895	30906	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525903188
20	NC_021831	AAGAAA	2	12	32636	32647	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021831	TTGGGT	2	12	34016	34027	0 %	50 %	50 %	0 %	525903191
22	NC_021831	TGGTTT	2	12	34660	34671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525903191
23	NC_021831	TTGAAA	2	12	35389	35400	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525903192
24	NC_021831	ATTAAA	2	12	37580	37591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525903194
25	NC_021831	TGCAAT	2	12	38312	38323	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525903195
26	NC_021831	ATCAAT	2	12	40576	40587	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525903196
27	NC_021831	TTTTTG	2	12	41428	41439	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525903196
28	NC_021831	GTTCGA	2	12	42162	42173	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525903196
29	NC_021831	TTATTT	2	12	42354	42365	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525903196
30	NC_021831	TTAAAA	2	12	43471	43482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525903197
31	NC_021831	TGAAGT	2	12	45382	45393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525903198
32	NC_021831	ATAAAA	2	12	47156	47167	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525903199
33	NC_021831	TTTTAA	2	12	49123	49134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525903200
34	NC_021831	AATAAA	2	12	51713	51724	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525903202
35	NC_021831	TTTTGT	2	12	52848	52859	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525903203
36	NC_021831	AATTTT	2	12	53609	53620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525903204
37	NC_021831	TGAATT	2	12	55454	55465	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525903205
38	NC_021831	ATATTG	2	12	57637	57648	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525903209
39	NC_021831	ATGATT	2	12	58561	58572	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525903209
40	NC_021831	TATAAA	2	12	59169	59180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525903210
41	NC_021831	CAAAAA	2	12	59188	59199	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525903210
42	NC_021831	TAATTT	2	12	59756	59767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525903211
43	NC_021831	TAATTT	2	12	60250	60261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525903212
44	NC_021831	AAAATT	2	12	60282	60293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021831	ATGTTT	2	12	60378	60389	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525903213
46	NC_021831	CAGTGA	2	12	65338	65349	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525903218
47	NC_021831	GGTATT	2	12	65714	65725	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525903219
48	NC_021831	AGCAAC	2	12	67710	67721	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525903221
49	NC_021831	GTCGAA	2	12	69506	69517	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525903222
50	NC_021831	AATTTT	2	12	70498	70509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525903223
51	NC_021831	TGTTTT	2	12	70687	70698	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525903223
52	NC_021831	GAACAA	2	12	78199	78210	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525903229
53	NC_021831	TTAATT	2	12	79376	79387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525903229
54	NC_021831	TAAAAT	2	12	80015	80026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525903229
55	NC_021831	AACAAA	2	12	81522	81533	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525903229
56	NC_021831	AATCAC	2	12	82274	82285	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525903229
57	NC_021831	CTAATT	2	12	86795	86806	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525903231
58	NC_021831	TTGAAC	2	12	88535	88546	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525903233
59	NC_021831	AATTAA	2	12	89396	89407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525903233
60	NC_021831	TGGTTT	2	12	90061	90072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525903234
61	NC_021831	CAAAAT	2	12	91170	91181	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525903235
62	NC_021831	TTGGTT	2	12	94492	94503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525903240
63	NC_021831	GCCCAC	2	12	97206	97217	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525903242
64	NC_021831	TGCAAG	2	12	98068	98079	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525903242
65	NC_021831	GGAATT	2	12	98114	98125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525903242
66	NC_021831	CAAAAA	2	12	99926	99937	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525903245
67	NC_021831	TTTTGC	2	12	101620	101631	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525903248
68	NC_021831	CATATG	2	12	101670	101681	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525903248
69	NC_021831	TTGGTT	2	12	101937	101948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525903248
70	NC_021831	TTAGGA	2	12	102182	102193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525903248
71	NC_021831	TTCAGG	2	12	104605	104616	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525903250
72	NC_021831	AATTTT	2	12	105004	105015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525903250
73	NC_021831	ATTTTA	2	12	105197	105208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525903250
74	NC_021831	ATATTT	2	12	107345	107356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525903253
75	NC_021831	TAGTAA	2	12	111659	111670	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525903254
76	NC_021831	AATTTC	2	12	111986	111997	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525903254
77	NC_021831	AATTTA	2	12	112592	112603	50 %	50 %	0 %	0 %	525903255
78	NC_021831	TTTTAA	2	12	112962	112973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021831	CAAGAA	2	12	113422	113433	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525903256
80	NC_021831	AAAGAA	3	18	113440	113457	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525903256
81	NC_021831	TAAATT	2	12	114624	114635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021831	TCCAGA	2	12	115739	115750	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525903259
83	NC_021831	ATTTTT	2	12	118056	118067	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525903260
84	NC_021831	ACAAAA	2	12	118735	118746	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525903260
85	NC_021831	AATTTT	2	12	119124	119135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525903260
86	NC_021831	TCATAA	2	12	120262	120273	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021831	ATTTTT	2	12	120773	120784	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021831	TAATTT	2	12	123299	123310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021831	AAGGAA	2	12	128524	128535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525903267
90	NC_021831	AGTTCA	2	12	133094	133105	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525903269
91	NC_021831	ATAATT	2	12	133268	133279	50 %	50 %	0 %	0 %	525903269
92	NC_021831	TATAAT	2	12	136346	136357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021831	CTTGAT	2	12	137661	137672	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525903274
94	NC_021831	TGACTT	2	12	138023	138034	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525903274
95	NC_021831	TTGAAA	2	12	140340	140351	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525903275
96	NC_021831	AGAACT	2	12	141547	141558	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021831	GTACTT	2	12	141644	141655	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525903277
98	NC_021831	CAAAAA	2	12	142903	142914	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525903277
99	NC_021831	AAAGAT	2	12	142991	143002	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525903277
100	NC_021831	TTGCAT	2	12	143257	143268	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525903278
101	NC_021831	AAATCC	2	12	143453	143464	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525903278
102	NC_021831	TAATTT	2	12	144920	144931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525903278
103	NC_021831	GAAAAA	2	12	145191	145202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525903278
104	NC_021831	TAAAAA	2	12	145400	145411	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525903278
105	NC_021831	TATAAA	2	12	145519	145530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525903279
106	NC_021831	TCAAAA	2	12	146832	146843	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525903280
107	NC_021831	GATTTA	2	12	147717	147728	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525903281
108	NC_021831	CAAAAA	2	12	147902	147913	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525903281
109	NC_021831	AGATTT	2	12	149209	149220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525903283
110	NC_021831	AGTAAA	2	12	149289	149300	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021831	GTTTTT	2	12	151171	151182	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021831	GGAATT	2	12	152718	152729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525903286
113	NC_021831	TGCTTT	2	12	154371	154382	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525903287
114	NC_021831	GAAGAT	2	12	155254	155265	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525903287
115	NC_021831	TGATAA	2	12	155511	155522	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525903287
116	NC_021831	AAAAAG	2	12	156167	156178	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525903287
117	NC_021831	TGATAA	2	12	158891	158902	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525903290
118	NC_021831	ATTTAA	2	12	159349	159360	50 %	50 %	0 %	0 %	525903290
119	NC_021831	ATTTGA	2	12	159593	159604	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525903290
120	NC_021831	ATTTAG	2	12	159898	159909	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525903290
121	NC_021831	AATTTA	2	12	160116	160127	50 %	50 %	0 %	0 %	525903290
122	NC_021831	AAGGTC	2	12	160932	160943	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525903291
123	NC_021831	ATTGAA	2	12	160988	160999	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525903291
124	NC_021831	TAAAAA	2	12	162082	162093	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021831	GCAATT	2	12	163302	163313	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021831	AGGCAA	2	12	163454	163465	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021831	ATAATT	2	12	168016	168027	50 %	50 %	0 %	0 %	525903294
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131	NC_021831	TTTAAA	2	12	172153	172164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021831	TTTAAT	2	12	173555	173566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021831	ATTTAA	2	12	174929	174940	50 %	50 %	0 %	0 %	525903297
134	NC_021831	ATTGCA	2	12	175817	175828	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525903298
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140	NC_021831	AGATCA	2	12	180524	180535	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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230	NC_021831	CATAAT	2	12	313574	313585	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525903426
231	NC_021831	AATTTG	2	12	313619	313630	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525903426
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234	NC_021831	TTAAGT	2	12	317150	317161	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
235	NC_021831	ATACAA	2	12	317480	317491	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525903429
236	NC_021831	TTGCAA	2	12	318056	318067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525903429
237	NC_021831	AATTTT	2	12	321370	321381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525903432
238	NC_021831	TTATAA	2	12	322795	322806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_021831	GAAAAA	2	12	323444	323455	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525903435
240	NC_021831	AAAATC	2	12	324306	324317	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525903435
241	NC_021831	GACTTT	2	12	325164	325175	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525903436
242	NC_021831	GATATT	2	12	328467	328478	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525903441
243	NC_021831	AGTTAA	2	12	332318	332329	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525903445
244	NC_021831	AAATCA	2	12	333917	333928	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525903446
245	NC_021831	TTTTTC	2	12	335894	335905	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525903447
246	NC_021831	TTATAA	2	12	337194	337205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_021831	AACTTC	2	12	337906	337917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_021831	TTATTT	2	12	339707	339718	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525903450
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256	NC_021831	AGGAAT	2	12	345681	345692	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525903452
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260	NC_021831	AATTTA	2	12	360536	360547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_021831	AGAATT	2	12	360918	360929	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_021831	TTGATT	2	12	366088	366099	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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352	NC_021831	AAGATT	2	12	503353	503364	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
353	NC_021831	TTGCTA	2	12	505801	505812	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525903573
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357	NC_021831	AATTTA	2	12	515077	515088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
358	NC_021831	AAAAAT	2	12	515279	515290	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
359	NC_021831	ATTTTT	2	12	515478	515489	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
360	NC_021831	TAAAAA	2	12	515524	515535	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
361	NC_021831	GTAATT	2	12	517313	517324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525903585
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