MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 7422

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021831	AAACA	2	10	151	160	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021831	ATATA	2	10	1715	1724	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021831	AATAA	2	10	9095	9104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021831	TTAAA	2	10	9146	9155	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021831	TATAA	2	10	17074	17083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021831	ATATT	2	10	17862	17871	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021831	AAAAT	2	10	18442	18451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021831	AATTA	2	10	21019	21028	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021831	TTATT	2	10	21072	21081	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021831	AATTA	2	10	21241	21250	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021831	AATTA	2	10	23459	23468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021831	AATTA	2	10	23604	23613	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021831	TAAAT	2	10	26911	26920	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021831	GTTTT	2	10	28731	28740	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021831	TAAAA	2	10	28814	28823	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021831	AATTA	2	10	29123	29132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021831	TAAAA	2	10	31252	31261	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021831	AATTA	2	10	31561	31570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021831	TAAAT	2	10	45043	45052	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021831	TAATT	2	10	66222	66231	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021831	TTGTT	2	10	82567	82576	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021831	AATTA	2	10	96429	96438	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021831	TTTAT	2	10	99675	99684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021831	TTTAA	2	10	101193	101202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021831	TTTTA	2	10	102858	102867	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021831	TAAAA	2	10	102903	102912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021831	TTAAA	2	10	110388	110397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021831	TTTAA	2	10	110416	110425	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021831	AATTT	2	10	111001	111010	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021831	ATAAA	2	10	120796	120805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021831	AGGTA	2	10	123361	123370	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021831	TAAAA	2	10	124384	124393	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021831	TTTAA	2	10	135032	135041	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021831	GATTT	2	10	135866	135875	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021831	ATTTA	2	10	136287	136296	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021831	TCAAA	2	10	147355	147364	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021831	ATTTA	4	20	151151	151170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021831	TTATT	2	10	162296	162305	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021831	AAATA	2	10	173301	173310	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021831	AATTA	2	10	180490	180499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021831	GATTG	2	10	180666	180675	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021831	TTAAA	2	10	182421	182430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021831	TTCTT	2	10	182738	182747	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_021831	AATTA	2	10	182857	182866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021831	GATTG	2	10	183033	183042	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021831	AATTT	2	10	184565	184574	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021831	AATTT	2	10	185914	185923	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021831	ATATT	2	10	186033	186042	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021831	GTGTT	2	10	192561	192570	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021831	ATTAT	2	10	196842	196851	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021831	AAATT	2	10	208320	208329	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021831	ATATT	2	10	212671	212680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021831	TTAAT	2	10	213716	213725	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021831	TTTAT	2	10	214089	214098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021831	ATAAA	2	10	214110	214119	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021831	TTTGT	2	10	219677	219686	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021831	TAAAA	2	10	224062	224071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021831	AAATT	2	10	228283	228292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021831	TTTTC	2	10	237302	237311	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021831	ATTAT	2	10	240845	240854	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021831	TATTT	2	10	252965	252974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021831	TTATT	2	10	260643	260652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021831	ATTAA	2	10	277237	277246	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021831	ATAAA	2	10	277492	277501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021831	CATAT	2	10	283768	283777	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021831	ATTTT	2	10	307242	307251	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021831	ATTTT	2	10	307340	307349	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021831	AAAGA	2	10	317128	317137	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021831	TAATT	2	10	317225	317234	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021831	ATAAA	2	10	337173	337182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021831	CAAAG	2	10	338380	338389	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_021831	TAAAA	2	10	348278	348287	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021831	TTTAA	2	10	352618	352627	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021831	ATTTA	2	10	358976	358985	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021831	ACTTA	2	10	361880	361889	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021831	ATTTT	2	10	363601	363610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021831	AAAAT	2	10	365752	365761	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021831	TCAAA	2	10	366807	366816	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_021831	TAATT	2	10	374200	374209	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021831	TAACT	2	10	376711	376720	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_021831	GCTTT	2	10	379018	379027	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021831	TTATT	2	10	383751	383760	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021831	TATTT	2	10	400477	400486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021831	TACTA	2	10	405028	405037	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021831	AAATT	2	10	405120	405129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021831	AATTT	2	10	405314	405323	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021831	TTATA	2	10	407715	407724	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021831	TAATT	2	10	408376	408385	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021831	TTATT	2	10	412194	412203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021831	AAGTA	2	10	412240	412249	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021831	TTAAT	2	10	414594	414603	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021831	TTTGT	2	10	414613	414622	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021831	TTAAA	2	10	416446	416455	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021831	TATAA	2	10	417461	417470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021831	TCAAT	2	10	418195	418204	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_021831	TAATT	2	10	418729	418738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021831	AAAAT	2	10	418931	418940	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021831	TAATT	2	10	421169	421178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021831	CTAAT	2	10	423097	423106	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_021831	TTTAA	2	10	429341	429350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021831	TTCTT	2	10	429370	429379	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021831	AAATT	2	10	429384	429393	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021831	AAACT	2	10	429483	429492	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_021831	TATAA	2	10	429514	429523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021831	TTTTC	2	10	429847	429856	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021831	TTTGG	2	10	429961	429970	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021831	ATTAT	2	10	435086	435095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021831	TAAAT	2	10	435098	435107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021831	TTTCT	2	10	437777	437786	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021831	TAATT	2	10	437855	437864	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021831	TTAAT	2	10	438622	438631	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021831	ATTTT	2	10	440784	440793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021831	TATTT	2	10	444471	444480	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021831	TATAA	2	10	447107	447116	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021831	ATTTT	2	10	447138	447147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021831	TTAAA	2	10	452994	453003	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021831	TAAAA	2	10	454621	454630	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021831	AAATT	2	10	454691	454700	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021831	AATTT	2	10	456528	456537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021831	TTTTA	2	10	462167	462176	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021831	TCAAG	2	10	462287	462296	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021831	TAGTT	2	10	463043	463052	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021831	TTTAA	2	10	463133	463142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021831	ATGAA	2	10	482931	482940	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021831	AATTT	2	10	486034	486043	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021831	ATTTA	2	10	503052	503061	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021831	ATAAA	2	10	503327	503336	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021831	TTTTG	2	10	510354	510363	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021831	TAAAA	2	10	510607	510616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021831	TATTT	2	10	514867	514876	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021831	AAACA	2	10	526062	526071	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_021831	TTTTA	2	10	526101	526110	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021831	AAACA	2	10	531944	531953	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021831	TATAA	2	10	539476	539485	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021831	ATTAA	2	10	539535	539544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021831	TTTAA	2	10	539591	539600	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021831	TTTAA	2	10	546370	546379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021831	AAATT	2	10	548089	548098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021831	ATGGT	2	10	586203	586212	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021831	ATTAT	2	10	587536	587545	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021831	ATTAC	2	10	596703	596712	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021831	AGCAG	2	10	598536	598545	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021831	ATTTA	2	10	598610	598619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021831	AATAA	2	10	601419	601428	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021831	AATAA	3	15	601453	601467	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021831	TAATT	2	10	603083	603092	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021831	TATAA	2	10	605548	605557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021831	TTAAT	2	10	634860	634869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021831	TATAA	2	10	637995	638004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.