MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1-220

Total Repeats: 1115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021830	TTTACC	2	12	10166	10177	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525732798
2	NC_021830	AGTAAA	2	12	17423	17434	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525732804
3	NC_021830	GTACGT	2	12	18229	18240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525732806
4	NC_021830	ACAGTA	2	12	24852	24863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525732814
5	NC_021830	AAAACA	2	12	25227	25238	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525732815
6	NC_021830	GCATGG	2	12	25408	25419	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525732815
7	NC_021830	CTGTAG	2	12	28352	28363	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525732820
8	NC_021830	GACAAT	2	12	29863	29874	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525732822
9	NC_021830	GTGAGC	2	12	30318	30329	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525732822
10	NC_021830	ATTGAT	2	12	30512	30523	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525732822
11	NC_021830	TAAAAA	2	12	31582	31593	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525735302
12	NC_021830	TGAATC	2	12	32367	32378	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525735303
13	NC_021830	GCTACT	2	12	34059	34070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525735304
14	NC_021830	TTCTGA	2	12	37133	37144	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525732823
15	NC_021830	AAGAAA	2	12	40349	40360	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525732824
16	NC_021830	TTCGTG	2	12	46105	46116	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525732825
17	NC_021830	TAACAA	2	12	49411	49422	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525735308
18	NC_021830	TTTAAC	2	12	50484	50495	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525735309
19	NC_021830	GTTGAG	2	12	52338	52349	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525735310
20	NC_021830	ATTTTT	2	12	52611	52622	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525735310
21	NC_021830	TTTATA	2	12	53155	53166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525735311
22	NC_021830	CCAAAT	2	12	55144	55155	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525735312
23	NC_021830	AGAACT	2	12	57758	57769	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525735314
24	NC_021830	TACAAG	2	12	62002	62013	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525732831
25	NC_021830	CGAAAT	2	12	62056	62067	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525732831
26	NC_021830	CATTAT	2	12	65786	65797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525732833
27	NC_021830	TCTTTT	2	12	66247	66258	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525732833
28	NC_021830	ATCAAT	2	12	68654	68665	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525732835
29	NC_021830	ATGAAA	2	12	69012	69023	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525732836
30	NC_021830	GCTTTT	2	12	70355	70366	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525732838
31	NC_021830	CTTTTA	2	12	70884	70895	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525732838
32	NC_021830	TAGAAA	2	12	71830	71841	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525732839
33	NC_021830	ACGTTG	2	12	73759	73770	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525732841
34	NC_021830	GAAAAC	2	12	75666	75677	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525732842
35	NC_021830	TTTTGA	2	12	81328	81339	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525732848
36	NC_021830	GAAGGG	2	12	86430	86441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525732852
37	NC_021830	AGAACC	2	12	89464	89475	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525732855
38	NC_021830	GATTCA	2	12	90071	90082	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525732855
39	NC_021830	GCAATT	2	12	90101	90112	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525732855
40	NC_021830	TCTGTT	2	12	95011	95022	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525732859
41	NC_021830	GAACCA	2	12	96906	96917	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525732860
42	NC_021830	TCCATT	2	12	99514	99525	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525732863
43	NC_021830	TGGCTC	2	12	100748	100759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525735318
44	NC_021830	TTTTGA	2	12	101284	101295	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525735318
45	NC_021830	GAGAAA	2	12	110463	110474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525735322
46	NC_021830	TTAGAT	2	12	112553	112564	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525735324
47	NC_021830	TAAATT	2	12	112570	112581	50 %	50 %	0 %	0 %	525735324
48	NC_021830	CTGGTT	2	12	117572	117583	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525732867
49	NC_021830	TTTGAG	2	12	120573	120584	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525735327
50	NC_021830	ATTAAA	2	12	121227	121238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525735328
51	NC_021830	TGAAGA	2	12	122249	122260	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525735328
52	NC_021830	TAGTTG	2	12	125283	125294	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525735329
53	NC_021830	AGAAAA	2	12	129949	129960	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525732876
54	NC_021830	GACTTA	2	12	131769	131780	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525735330
55	NC_021830	TAGATT	2	12	137652	137663	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525735331
56	NC_021830	CGCCAG	2	12	140720	140731	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525735332
57	NC_021830	CGCCAG	2	12	140960	140971	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525735332
58	NC_021830	CACCAG	2	12	141200	141211	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525735332
59	NC_021830	CAGAAA	2	12	142397	142408	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525735333
60	NC_021830	AGAAGC	2	12	142470	142481	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525735333
61	NC_021830	TTTAAC	2	12	144787	144798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525735333
62	NC_021830	GAGAAA	2	12	145555	145566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525735333
63	NC_021830	AATTGA	2	12	152586	152597	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525735337
64	NC_021830	TTTTCT	2	12	154435	154446	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525735339
65	NC_021830	GCCATC	2	12	158898	158909	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525732883
66	NC_021830	AAAAGA	2	12	170138	170149	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525732896
67	NC_021830	AATACA	2	12	171375	171386	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525732896
68	NC_021830	CGGAAA	2	12	171778	171789	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525732897
69	NC_021830	CTGACC	2	12	175283	175294	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525732898
70	NC_021830	AATGAA	2	12	175958	175969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525732899
71	NC_021830	GATTTC	2	12	181378	181389	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525732905
72	NC_021830	TATAAA	2	12	184498	184509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732908
73	NC_021830	TATCAA	2	12	191282	191293	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525732915
74	NC_021830	TAACAA	2	12	193346	193357	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525732918
75	NC_021830	GCAGAA	2	12	196396	196407	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525732921
76	NC_021830	TTTTTG	2	12	198786	198797	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525732924
77	NC_021830	GTAACC	2	12	200936	200947	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525735354
78	NC_021830	GGTATT	2	12	204358	204369	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525732926
79	NC_021830	TGCGGA	2	12	210971	210982	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525732932
80	NC_021830	TGGTAT	2	12	212863	212874	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525732934
81	NC_021830	TTTTAT	2	12	212908	212919	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525732934
82	NC_021830	GTACGA	2	12	212992	213003	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525732934
83	NC_021830	TTTATT	2	12	220979	220990	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525732940
84	NC_021830	TGCAGC	2	12	221157	221168	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525732940
85	NC_021830	TTGGTA	2	12	222903	222914	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525732942
86	NC_021830	AAAGTA	2	12	224217	224228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525732943
87	NC_021830	AAGAAA	2	12	230154	230165	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525732950
88	NC_021830	AAAGTG	2	12	230814	230825	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525732951
89	NC_021830	TAGCAC	2	12	231677	231688	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525732953
90	NC_021830	CTTGGT	2	12	232111	232122	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525732953
91	NC_021830	GCAAAA	2	12	238341	238352	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525735360
92	NC_021830	GAATTC	2	12	239934	239945	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525735360
93	NC_021830	ATGCAA	2	12	242026	242037	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525735360
94	NC_021830	TGATGG	2	12	244100	244111	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525735360
95	NC_021830	GATGAA	2	12	244160	244171	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525735360
96	NC_021830	AGCCAA	2	12	244307	244318	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525735360
97	NC_021830	TAAAAA	2	12	248160	248171	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525735367
98	NC_021830	CAGAAG	2	12	248421	248432	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525735367
99	NC_021830	GTGTAT	2	12	248810	248821	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525735368
100	NC_021830	TTTTTA	2	12	249510	249521	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525735370
101	NC_021830	AGATTT	2	12	256052	256063	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525735378
102	NC_021830	TTGATG	2	12	257149	257160	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525735378
103	NC_021830	AAAAGC	2	12	258626	258637	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525735379
104	NC_021830	GGATTT	2	12	261588	261599	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525735380
105	NC_021830	AATCAA	2	12	267058	267069	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525732964
106	NC_021830	CTTATG	2	12	268485	268496	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525732965
107	NC_021830	CTGTTT	2	12	271030	271041	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525732968
108	NC_021830	CGTACT	2	12	271130	271141	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525732968
109	NC_021830	CTCACC	2	12	271325	271336	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	525732968
110	NC_021830	ATTTGC	2	12	271937	271948	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525732968
111	NC_021830	TAAAAC	2	12	272384	272395	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525732968
112	NC_021830	AGCCGA	2	12	283331	283342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525735383
113	NC_021830	TTTGAT	2	12	283896	283907	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525735383
114	NC_021830	AAACAA	2	12	298539	298550	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525732978
115	NC_021830	TGGGAT	2	12	301412	301423	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525735396
116	NC_021830	AGAAAG	2	12	312415	312426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732989
117	NC_021830	ATTGCA	2	12	313842	313853	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525732991
118	NC_021830	AAATGA	2	12	314280	314291	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525732991
119	NC_021830	AAAGAT	2	12	324672	324683	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525733003
120	NC_021830	TAACGA	2	12	329726	329737	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525733009
121	NC_021830	TGCGGC	2	12	330273	330284	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525733009
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125	NC_021830	CGAAAT	2	12	345723	345734	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525733021
126	NC_021830	GCCGGA	2	12	348496	348507	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525733022
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130	NC_021830	TTTTTC	2	12	359983	359994	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525733033
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147	NC_021830	GCAACC	2	12	404496	404507	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525733076
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152	NC_021830	AATTTC	2	12	419523	419534	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525735402
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229	NC_021830	GGAGAA	2	12	650129	650140	50 %	0 %	50 %	0 %	525733298
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231	NC_021830	TTATCT	2	12	660535	660546	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525735425
232	NC_021830	GCGGAA	2	12	666301	666312	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525733311
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343	NC_021830	GTTATT	2	12	990232	990243	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525733617
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455	NC_021830	TCTGTT	2	12	1293888	1293899	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525733873
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457	NC_021830	CAATAC	2	12	1300366	1300377	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525733878
458	NC_021830	CTCATT	2	12	1302070	1302081	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525733880
459	NC_021830	AACAAA	2	12	1303399	1303410	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525733881
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461	NC_021830	TTTTTC	2	12	1304531	1304542	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525733881
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463	NC_021830	AAATAA	2	12	1306502	1306513	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525733884
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487	NC_021830	TTTTTC	2	12	1391530	1391541	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525733964
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