MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes J1-220

Total Repeats: 2229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021830	AAGGT	2	10	1227	1236	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021830	TAATT	2	10	4619	4628	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021830	TCGTG	2	10	5778	5787	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021830	AAGGT	2	10	7264	7273	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021830	GAGAA	2	10	11704	11713	60 %	0 %	40 %	0 %	525732800
6	NC_021830	GAACA	2	10	11908	11917	60 %	0 %	20 %	20 %	525732801
7	NC_021830	GAACA	2	10	12130	12139	60 %	0 %	20 %	20 %	525732801
8	NC_021830	AAAGA	2	10	16372	16381	80 %	0 %	20 %	0 %	525732803
9	NC_021830	AAAAT	2	10	17086	17095	80 %	20 %	0 %	0 %	525732804
10	NC_021830	TGGAC	2	10	24236	24245	20 %	20 %	40 %	20 %	525732812
11	NC_021830	GGCAT	2	10	24557	24566	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021830	CAAAG	2	10	25667	25676	60 %	0 %	20 %	20 %	525732816
13	NC_021830	TATTT	2	10	29321	29330	20 %	80 %	0 %	0 %	525732821
14	NC_021830	ATTTG	2	10	30040	30049	20 %	60 %	20 %	0 %	525732822
15	NC_021830	TACTG	2	10	31565	31574	20 %	40 %	20 %	20 %	525735302
16	NC_021830	TGAAA	2	10	34731	34740	60 %	20 %	20 %	0 %	525735304
17	NC_021830	TTATG	2	10	34925	34934	20 %	60 %	20 %	0 %	525735305
18	NC_021830	ATTTA	2	10	37663	37672	40 %	60 %	0 %	0 %	525735306
19	NC_021830	ACAAA	2	10	38629	38638	80 %	0 %	0 %	20 %	525735306
20	NC_021830	TTTAA	2	10	38711	38720	40 %	60 %	0 %	0 %	525735306
21	NC_021830	GCTTG	2	10	39787	39796	0 %	40 %	40 %	20 %	525732824
22	NC_021830	ACGTG	2	10	40788	40797	20 %	20 %	40 %	20 %	525732824
23	NC_021830	AGTGA	2	10	46672	46681	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021830	GGCTG	2	10	47768	47777	0 %	20 %	60 %	20 %	525732827
25	NC_021830	ATTTC	2	10	48243	48252	20 %	60 %	0 %	20 %	525732827
26	NC_021830	AATTA	2	10	48830	48839	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021830	AGTAT	2	10	49214	49223	40 %	40 %	20 %	0 %	525735308
28	NC_021830	AGAAA	2	10	49353	49362	80 %	0 %	20 %	0 %	525735308
29	NC_021830	AATCA	2	10	50558	50567	60 %	20 %	0 %	20 %	525735309
30	NC_021830	AATAA	2	10	51126	51135	80 %	20 %	0 %	0 %	525735309
31	NC_021830	GATAG	2	10	51624	51633	40 %	20 %	40 %	0 %	525735310
32	NC_021830	AGGTA	2	10	52971	52980	40 %	20 %	40 %	0 %	525735311
33	NC_021830	AATAC	2	10	53967	53976	60 %	20 %	0 %	20 %	525735312
34	NC_021830	GAAAA	2	10	55546	55555	80 %	0 %	20 %	0 %	525735313
35	NC_021830	AAATC	2	10	56257	56266	60 %	20 %	0 %	20 %	525735313
36	NC_021830	AAATC	2	10	56323	56332	60 %	20 %	0 %	20 %	525735313
37	NC_021830	TTGGG	2	10	57527	57536	0 %	40 %	60 %	0 %	525735314
38	NC_021830	AAAAT	2	10	58270	58279	80 %	20 %	0 %	0 %	525735314
39	NC_021830	GAATG	2	10	58875	58884	40 %	20 %	40 %	0 %	525735314
40	NC_021830	TGGCT	2	10	58971	58980	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021830	GAAAC	2	10	60134	60143	60 %	0 %	20 %	20 %	525732828
42	NC_021830	ACTAA	2	10	60347	60356	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021830	ATTGC	2	10	60505	60514	20 %	40 %	20 %	20 %	525732829
44	NC_021830	GGAAT	2	10	61882	61891	40 %	20 %	40 %	0 %	525732831
45	NC_021830	GTTTT	2	10	64849	64858	0 %	80 %	20 %	0 %	525735315
46	NC_021830	ATTTT	2	10	65214	65223	20 %	80 %	0 %	0 %	525735315
47	NC_021830	TATAA	2	10	65573	65582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021830	AGGTA	2	10	66138	66147	40 %	20 %	40 %	0 %	525732833
49	NC_021830	AAAGA	2	10	68801	68810	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021830	ATTGT	2	10	69968	69977	20 %	60 %	20 %	0 %	525732837
51	NC_021830	CTCTT	2	10	71130	71139	0 %	60 %	0 %	40 %	525732839
52	NC_021830	ATGAA	2	10	71140	71149	60 %	20 %	20 %	0 %	525732839
53	NC_021830	CTTCT	2	10	71699	71708	0 %	60 %	0 %	40 %	525732839
54	NC_021830	CAAAT	2	10	71937	71946	60 %	20 %	0 %	20 %	525732839
55	NC_021830	AGTTA	2	10	73090	73099	40 %	40 %	20 %	0 %	525732841
56	NC_021830	CGATG	2	10	75296	75305	20 %	20 %	40 %	20 %	525732842
57	NC_021830	AGAAA	2	10	83309	83318	80 %	0 %	20 %	0 %	525732850
58	NC_021830	TGCAA	2	10	84273	84282	40 %	20 %	20 %	20 %	525732851
59	NC_021830	CGAAT	2	10	84627	84636	40 %	20 %	20 %	20 %	525732851
60	NC_021830	GACAA	2	10	86169	86178	60 %	0 %	20 %	20 %	525732852
61	NC_021830	ATGGC	2	10	87034	87043	20 %	20 %	40 %	20 %	525732852
62	NC_021830	GTTAC	2	10	87138	87147	20 %	40 %	20 %	20 %	525732852
63	NC_021830	TTATT	2	10	91357	91366	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021830	GTTAT	2	10	92918	92927	20 %	60 %	20 %	0 %	525732857
65	NC_021830	TAGAT	2	10	93784	93793	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021830	GTTTT	2	10	94914	94923	0 %	80 %	20 %	0 %	525732859
67	NC_021830	AATCG	2	10	94959	94968	40 %	20 %	20 %	20 %	525732859
68	NC_021830	ACTTT	2	10	98558	98567	20 %	60 %	0 %	20 %	525732862
69	NC_021830	AGATG	2	10	99716	99725	40 %	20 %	40 %	0 %	525732863
70	NC_021830	CTTTT	2	10	101095	101104	0 %	80 %	0 %	20 %	525735318
71	NC_021830	AAACC	2	10	103279	103288	60 %	0 %	0 %	40 %	525735319
72	NC_021830	TAATT	2	10	103610	103619	40 %	60 %	0 %	0 %	525735319
73	NC_021830	GTTTT	2	10	104539	104548	0 %	80 %	20 %	0 %	525735320
74	NC_021830	AAAAG	2	10	106035	106044	80 %	0 %	20 %	0 %	525735320
75	NC_021830	AAAAC	2	10	108038	108047	80 %	0 %	0 %	20 %	525735322
76	NC_021830	AATTT	2	10	108680	108689	40 %	60 %	0 %	0 %	525735322
77	NC_021830	ATAAA	2	10	109239	109248	80 %	20 %	0 %	0 %	525735322
78	NC_021830	GAAAA	2	10	109459	109468	80 %	0 %	20 %	0 %	525735322
79	NC_021830	TACTT	2	10	109480	109489	20 %	60 %	0 %	20 %	525735322
80	NC_021830	CTATT	2	10	110477	110486	20 %	60 %	0 %	20 %	525735322
81	NC_021830	TTTTA	2	10	110509	110518	20 %	80 %	0 %	0 %	525735322
82	NC_021830	GAAAT	2	10	111165	111174	60 %	20 %	20 %	0 %	525735322
83	NC_021830	TGCTT	2	10	118151	118160	0 %	60 %	20 %	20 %	525732868
84	NC_021830	CTAAT	2	10	119223	119232	40 %	40 %	0 %	20 %	525732869
85	NC_021830	ATTTC	2	10	121654	121663	20 %	60 %	0 %	20 %	525735328
86	NC_021830	ATTCT	2	10	122227	122236	20 %	60 %	0 %	20 %	525735328
87	NC_021830	AGAGA	2	10	122601	122610	60 %	0 %	40 %	0 %	525735328
88	NC_021830	GAAAT	2	10	123330	123339	60 %	20 %	20 %	0 %	525732871
89	NC_021830	AAGTG	2	10	123828	123837	40 %	20 %	40 %	0 %	525732871
90	NC_021830	TTGTT	2	10	124574	124583	0 %	80 %	20 %	0 %	525735329
91	NC_021830	TTGTT	2	10	124586	124595	0 %	80 %	20 %	0 %	525735329
92	NC_021830	TTCTT	2	10	126643	126652	0 %	80 %	0 %	20 %	525732872
93	NC_021830	AATAA	2	10	126954	126963	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021830	ATTGT	2	10	128312	128321	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021830	TCAAG	2	10	128525	128534	40 %	20 %	20 %	20 %	525732875
96	NC_021830	CTTTC	2	10	128672	128681	0 %	60 %	0 %	40 %	525732875
97	NC_021830	GCCAA	2	10	129861	129870	40 %	0 %	20 %	40 %	525732876
98	NC_021830	AAATA	2	10	135891	135900	80 %	20 %	0 %	0 %	525732878
99	NC_021830	TAGTT	2	10	137772	137781	20 %	60 %	20 %	0 %	525735331
100	NC_021830	TTTTA	2	10	138319	138328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021830	CAAAA	2	10	138669	138678	80 %	0 %	0 %	20 %	525735332
102	NC_021830	TCACT	2	10	138989	138998	20 %	40 %	0 %	40 %	525735332
103	NC_021830	TGAAG	2	10	140283	140292	40 %	20 %	40 %	0 %	525735332
104	NC_021830	AAACG	2	10	140526	140535	60 %	0 %	20 %	20 %	525735332
105	NC_021830	AGGAG	2	10	141950	141959	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021830	ATAGA	2	10	142254	142263	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021830	CAATT	2	10	148677	148686	40 %	40 %	0 %	20 %	525732880
108	NC_021830	GAAAA	2	10	149872	149881	80 %	0 %	20 %	0 %	525735334
109	NC_021830	GAACA	2	10	150742	150751	60 %	0 %	20 %	20 %	525735334
110	NC_021830	TATAC	2	10	152752	152761	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021830	ATTTA	2	10	154183	154192	40 %	60 %	0 %	0 %	525735339
112	NC_021830	CAATT	2	10	155212	155221	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_021830	GCCTC	2	10	155693	155702	0 %	20 %	20 %	60 %	525735342
114	NC_021830	ACAGA	2	10	155771	155780	60 %	0 %	20 %	20 %	525735342
115	NC_021830	ATGGA	2	10	156111	156120	40 %	20 %	40 %	0 %	525735343
116	NC_021830	AAATT	2	10	156921	156930	60 %	40 %	0 %	0 %	525735344
117	NC_021830	CCATT	2	10	160222	160231	20 %	40 %	0 %	40 %	525732885
118	NC_021830	AGTTC	2	10	160398	160407	20 %	40 %	20 %	20 %	525732885
119	NC_021830	TTCAC	2	10	162494	162503	20 %	40 %	0 %	40 %	525732888
120	NC_021830	AGTCC	2	10	162552	162561	20 %	20 %	20 %	40 %	525732888
121	NC_021830	ATTTC	2	10	162927	162936	20 %	60 %	0 %	20 %	525732889
122	NC_021830	ACAAA	2	10	165140	165149	80 %	0 %	0 %	20 %	525732893
123	NC_021830	ATTAT	2	10	165957	165966	40 %	60 %	0 %	0 %	525732894
124	NC_021830	AAATG	2	10	166353	166362	60 %	20 %	20 %	0 %	525732894
125	NC_021830	AAAAT	2	10	167293	167302	80 %	20 %	0 %	0 %	525735345
126	NC_021830	GGCAC	2	10	169517	169526	20 %	0 %	40 %	40 %	525732895
127	NC_021830	ATTAA	2	10	170520	170529	60 %	40 %	0 %	0 %	525732896
128	NC_021830	GTGAT	2	10	171571	171580	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021830	TGAAG	2	10	171838	171847	40 %	20 %	40 %	0 %	525732897
130	NC_021830	AAAAC	2	10	173384	173393	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021830	GGCGG	2	10	175258	175267	0 %	0 %	80 %	20 %	525732898
132	NC_021830	GAAAC	2	10	176702	176711	60 %	0 %	20 %	20 %	525735346
133	NC_021830	TGGAT	2	10	177043	177052	20 %	40 %	40 %	0 %	525735347
134	NC_021830	ATGAT	2	10	177562	177571	40 %	40 %	20 %	0 %	525732900
135	NC_021830	CGATA	2	10	178448	178457	40 %	20 %	20 %	20 %	525732900
136	NC_021830	TTGAT	2	10	180426	180435	20 %	60 %	20 %	0 %	525732904
137	NC_021830	AAAAT	2	10	180677	180686	80 %	20 %	0 %	0 %	525732904
138	NC_021830	TGGTT	2	10	184994	185003	0 %	60 %	40 %	0 %	525732909
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234	NC_021830	GTTTT	2	10	324115	324124	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
235	NC_021830	AAACA	2	10	326621	326630	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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242	NC_021830	AGTAA	2	10	340075	340084	60 %	20 %	20 %	0 %	525733017
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256	NC_021830	TAGAC	2	10	358288	358297	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
257	NC_021830	GAATT	2	10	361751	361760	40 %	40 %	20 %	0 %	525733035
258	NC_021830	CATTT	2	10	361929	361938	20 %	60 %	0 %	20 %	525733035
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261	NC_021830	CATTT	2	10	364892	364901	20 %	60 %	0 %	20 %	525733039
262	NC_021830	ACTGA	2	10	366976	366985	40 %	20 %	20 %	20 %	525735401
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264	NC_021830	AAGAA	2	10	370215	370224	80 %	0 %	20 %	0 %	525733043
265	NC_021830	CTATG	2	10	371662	371671	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
266	NC_021830	GGCTG	2	10	374659	374668	0 %	20 %	60 %	20 %	525733047
267	NC_021830	AAAGA	2	10	377116	377125	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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