MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes J1-220

Total Repeats: 43374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021830	CAC	2	6	78	83	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_021830	CCT	2	6	205	210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_021830	TTC	2	6	242	247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021830	TAT	2	6	359	364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021830	ATC	2	6	386	391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021830	ATC	2	6	422	427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021830	AAC	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021830	GAA	2	6	524	529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021830	GGA	2	6	689	694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021830	GCG	2	6	723	728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021830	AAG	2	6	753	758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021830	CTT	2	6	763	768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021830	CGG	2	6	897	902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021830	GGA	2	6	929	934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021830	AGT	2	6	1050	1055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021830	TTG	2	6	1114	1119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021830	ACC	2	6	1512	1517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021830	AGC	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021830	TGG	2	6	1752	1757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021830	AAG	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021830	ACA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021830	AGT	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021830	GAG	2	6	2151	2156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021830	CGG	2	6	2411	2416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021830	GAG	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021830	TGG	2	6	2673	2678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021830	TAC	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021830	CCT	2	6	2769	2774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_021830	GGT	2	6	2905	2910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021830	TCG	2	6	3020	3025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021830	CGT	2	6	3100	3105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021830	GAG	2	6	3149	3154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021830	GTT	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021830	TTC	2	6	3301	3306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021830	GAT	2	6	3327	3332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021830	TCT	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021830	CAA	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021830	ATA	2	6	3785	3790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021830	AGT	2	6	3987	3992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021830	ATT	2	6	4160	4165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021830	CTC	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021830	TTA	2	6	4249	4254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021830	TAT	2	6	4343	4348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021830	AGG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021830	CCA	2	6	4419	4424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021830	ATT	2	6	4426	4431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021830	TGC	2	6	4481	4486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021830	GAA	3	9	4497	4505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021830	AGA	3	9	4531	4539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021830	CAA	2	6	4603	4608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021830	GGC	2	6	4737	4742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021830	GGA	2	6	4771	4776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021830	GCA	2	6	5058	5063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021830	CGC	2	6	5105	5110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_021830	GAA	2	6	5117	5122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021830	TGT	2	6	5144	5149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021830	AGA	2	6	5153	5158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021830	CAG	2	6	5226	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021830	AGA	2	6	5367	5372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021830	GGA	2	6	5417	5422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021830	TGC	2	6	5562	5567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021830	GAA	2	6	5681	5686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021830	GGT	2	6	5755	5760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021830	GTC	2	6	5769	5774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021830	GGA	2	6	5880	5885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021830	ATC	2	6	5904	5909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021830	CAC	2	6	6115	6120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_021830	CCT	2	6	6242	6247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021830	TTC	2	6	6279	6284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021830	TAT	2	6	6396	6401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021830	ATC	2	6	6423	6428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021830	ATC	2	6	6459	6464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021830	AAC	2	6	6486	6491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021830	GAA	2	6	6561	6566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021830	GGA	2	6	6726	6731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021830	GCG	2	6	6760	6765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021830	AAG	2	6	6790	6795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021830	CTT	2	6	6800	6805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021830	CGG	2	6	6934	6939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021830	GGA	2	6	6966	6971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021830	AGT	2	6	7087	7092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021830	TTG	2	6	7151	7156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021830	ACC	2	6	7549	7554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_021830	AGC	2	6	7629	7634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021830	TGG	2	6	7789	7794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021830	AAG	2	6	7831	7836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021830	ACA	2	6	7939	7944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021830	AGT	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021830	GAG	2	6	8188	8193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021830	CGG	2	6	8448	8453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021830	GAG	2	6	8700	8705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021830	TGG	2	6	8710	8715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021830	TAC	2	6	8718	8723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021830	CCT	2	6	8806	8811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_021830	GGT	2	6	8942	8947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021830	TCG	2	6	9057	9062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021830	CGT	2	6	9137	9142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021830	GAG	2	6	9186	9191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021830	GTT	2	6	9240	9245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021830	TTC	2	6	9338	9343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021830	GAT	2	6	9364	9369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021830	TCT	2	6	9478	9483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021830	CAA	2	6	9507	9512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021830	ATT	2	6	9655	9660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021830	AAG	2	6	9857	9862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732798
106	NC_021830	TAA	2	6	9910	9915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732798
107	NC_021830	GTG	4	12	9961	9972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732798
108	NC_021830	ATT	2	6	9984	9989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732798
109	NC_021830	GAA	3	9	10098	10106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732798
110	NC_021830	TAA	2	6	10108	10113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732798
111	NC_021830	GAA	2	6	10115	10120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732798
112	NC_021830	TGG	2	6	10135	10140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732798
113	NC_021830	TGA	2	6	10246	10251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021830	GAT	2	6	10253	10258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732799
115	NC_021830	CAA	2	6	10299	10304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732799
116	NC_021830	CTT	2	6	10427	10432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525732799
117	NC_021830	AGA	2	6	10448	10453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732799
118	NC_021830	GTT	2	6	10470	10475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732799
119	NC_021830	ATT	2	6	10572	10577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732799
120	NC_021830	GAG	2	6	10701	10706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525732799
121	NC_021830	GCT	2	6	10716	10721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732799
122	NC_021830	TGA	2	6	10730	10735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732799
123	NC_021830	TGA	2	6	10816	10821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732800
124	NC_021830	GAT	2	6	10823	10828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732800
125	NC_021830	GTT	2	6	10829	10834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732800
126	NC_021830	TTG	2	6	10908	10913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732800
127	NC_021830	ATA	2	6	10914	10919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732800
128	NC_021830	TGA	2	6	10933	10938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732800
129	NC_021830	TGG	2	6	10992	10997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732800
130	NC_021830	ATG	2	6	11021	11026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732800
131	NC_021830	GAA	2	6	11063	11068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732800
132	NC_021830	TAT	2	6	11077	11082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732800
133	NC_021830	ATT	2	6	11134	11139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732800
134	NC_021830	ACA	2	6	11294	11299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732800
135	NC_021830	TGA	2	6	11562	11567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732800
136	NC_021830	ATT	2	6	11576	11581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732800
137	NC_021830	AAG	2	6	11589	11594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732800
138	NC_021830	AGA	2	6	11737	11742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732800
139	NC_021830	ATG	2	6	11788	11793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732800
140	NC_021830	AGG	2	6	11806	11811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021830	ACA	2	6	11814	11819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021830	ATG	2	6	11820	11825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732801
143	NC_021830	AAG	2	6	11872	11877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732801
144	NC_021830	TTA	2	6	11922	11927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732801
145	NC_021830	GCG	2	6	11955	11960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525732801
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162	NC_021830	TGA	2	6	13001	13006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732801
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251	NC_021830	GAA	2	6	19805	19810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_021830	AGG	2	6	20073	20078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
253	NC_021830	CAA	2	6	20079	20084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_021830	AGA	2	6	20103	20108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732807
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266	NC_021830	GAT	2	6	20920	20925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732808
267	NC_021830	TGA	2	6	21000	21005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732808
268	NC_021830	ATT	2	6	21070	21075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732808
269	NC_021830	GCA	2	6	21195	21200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732808
270	NC_021830	ACT	2	6	21461	21466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732808
271	NC_021830	TTA	2	6	21527	21532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732808
272	NC_021830	ATG	2	6	21539	21544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732808
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274	NC_021830	ATG	2	6	21620	21625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732808
275	NC_021830	AGA	2	6	21633	21638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732808
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278	NC_021830	GAT	2	6	21781	21786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732808
279	NC_021830	GAT	3	9	21790	21798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732808
280	NC_021830	TAC	2	6	21819	21824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732808
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282	NC_021830	GAT	2	6	21970	21975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732808
283	NC_021830	GAA	2	6	21997	22002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732808
284	NC_021830	TGA	2	6	22041	22046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732808
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287	NC_021830	GAA	3	9	22333	22341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732809
288	NC_021830	TAG	2	6	22508	22513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732809
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296	NC_021830	ATT	3	9	22917	22925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732810
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299	NC_021830	GTA	2	6	23080	23085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732810
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322	NC_021830	GAA	2	6	24691	24696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732813
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335	NC_021830	ATT	2	6	25624	25629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
336	NC_021830	GTT	2	6	25637	25642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
337	NC_021830	TTA	2	6	25643	25648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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367	NC_021830	TTG	2	6	27640	27645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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374	NC_021830	TAT	2	6	28219	28224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
375	NC_021830	GGA	2	6	28226	28231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
376	NC_021830	GAA	2	6	28255	28260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732820
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381	NC_021830	GCT	3	9	28378	28386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732820
382	NC_021830	CTG	2	6	28418	28423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732820
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387	NC_021830	GAA	2	6	28570	28575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732820
388	NC_021830	TAC	2	6	28760	28765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732821
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