MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 2177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021829	TAATC	2	10	1506	1515	40 %	40 %	0 %	20 %	525723661
2	NC_021829	TTATT	2	10	4024	4033	20 %	80 %	0 %	0 %	525723663
3	NC_021829	TGCAA	2	10	5151	5160	40 %	20 %	20 %	20 %	525723667
4	NC_021829	GATTT	2	10	5380	5389	20 %	60 %	20 %	0 %	525723667
5	NC_021829	ATTCA	2	10	5418	5427	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021829	ATTAT	2	10	6954	6963	40 %	60 %	0 %	0 %	525723668
7	NC_021829	TTTGG	2	10	9846	9855	0 %	60 %	40 %	0 %	525723670
8	NC_021829	AATTT	2	10	10613	10622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021829	TATTT	2	10	11042	11051	20 %	80 %	0 %	0 %	525723672
10	NC_021829	TCATT	2	10	11828	11837	20 %	60 %	0 %	20 %	525721266
11	NC_021829	TAAAC	2	10	12394	12403	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021829	TTCTT	2	10	12882	12891	0 %	80 %	0 %	20 %	525723673
13	NC_021829	GCCTT	2	10	15933	15942	0 %	40 %	20 %	40 %	525721271
14	NC_021829	CATAT	2	10	16723	16732	40 %	40 %	0 %	20 %	525721272
15	NC_021829	CGTAT	2	10	17305	17314	20 %	40 %	20 %	20 %	525721272
16	NC_021829	AATCA	2	10	18478	18487	60 %	20 %	0 %	20 %	525721273
17	NC_021829	ATCCG	2	10	19247	19256	20 %	20 %	20 %	40 %	525721274
18	NC_021829	ACGTA	2	10	19937	19946	40 %	20 %	20 %	20 %	525723674
19	NC_021829	TTTAA	2	10	21047	21056	40 %	60 %	0 %	0 %	525723675
20	NC_021829	CGATA	2	10	21228	21237	40 %	20 %	20 %	20 %	525723675
21	NC_021829	TAATT	2	10	21854	21863	40 %	60 %	0 %	0 %	525723675
22	NC_021829	GAATG	2	10	22495	22504	40 %	20 %	40 %	0 %	525721275
23	NC_021829	AAAAG	2	10	22826	22835	80 %	0 %	20 %	0 %	525721275
24	NC_021829	GGATA	2	10	27547	27556	40 %	20 %	40 %	0 %	525723678
25	NC_021829	ATATT	2	10	28194	28203	40 %	60 %	0 %	0 %	525723678
26	NC_021829	CAAAT	2	10	29333	29342	60 %	20 %	0 %	20 %	525723679
27	NC_021829	TACAA	2	10	30279	30288	60 %	20 %	0 %	20 %	525723679
28	NC_021829	ATTTT	2	10	30800	30809	20 %	80 %	0 %	0 %	525723680
29	NC_021829	GACAC	2	10	31469	31478	40 %	0 %	20 %	40 %	525723680
30	NC_021829	TGATG	2	10	32481	32490	20 %	40 %	40 %	0 %	525723682
31	NC_021829	ACTGT	2	10	34235	34244	20 %	40 %	20 %	20 %	525721278
32	NC_021829	TTGCC	2	10	34727	34736	0 %	40 %	20 %	40 %	525721278
33	NC_021829	TAATA	2	10	37967	37976	60 %	40 %	0 %	0 %	525721279
34	NC_021829	AGTGT	2	10	41655	41664	20 %	40 %	40 %	0 %	525721281
35	NC_021829	TTTGT	2	10	41734	41743	0 %	80 %	20 %	0 %	525721281
36	NC_021829	AAAAC	2	10	45476	45485	80 %	0 %	0 %	20 %	525721284
37	NC_021829	TTTAT	2	10	49563	49572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021829	AACTT	2	10	49617	49626	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021829	TTGCA	2	10	50879	50888	20 %	40 %	20 %	20 %	525721288
40	NC_021829	GTTTA	2	10	51023	51032	20 %	60 %	20 %	0 %	525721288
41	NC_021829	CATTC	2	10	51885	51894	20 %	40 %	0 %	40 %	525721289
42	NC_021829	AAAAT	2	10	53317	53326	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021829	GCTTT	2	10	53362	53371	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_021829	AAAAG	2	10	59293	59302	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021829	GTTTA	2	10	59777	59786	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021829	TTTTA	2	10	60849	60858	20 %	80 %	0 %	0 %	525721298
47	NC_021829	TCAAA	2	10	61884	61893	60 %	20 %	0 %	20 %	525721299
48	NC_021829	ATACA	2	10	63696	63705	60 %	20 %	0 %	20 %	525721301
49	NC_021829	AAAAC	2	10	63788	63797	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021829	TCCTA	2	10	63798	63807	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_021829	CCACC	2	10	64565	64574	20 %	0 %	0 %	80 %	525721304
52	NC_021829	TTTCT	2	10	66563	66572	0 %	80 %	0 %	20 %	525721306
53	NC_021829	ACTCA	2	10	70128	70137	40 %	20 %	0 %	40 %	525721311
54	NC_021829	AGCAT	2	10	72611	72620	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021829	TTTTC	2	10	73534	73543	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021829	CCGCA	2	10	74597	74606	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_021829	TTTCC	2	10	75424	75433	0 %	60 %	0 %	40 %	525723685
58	NC_021829	GTTTA	2	10	78129	78138	20 %	60 %	20 %	0 %	525723687
59	NC_021829	TTTAT	2	10	78366	78375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021829	AAAGT	2	10	79340	79349	60 %	20 %	20 %	0 %	525723688
61	NC_021829	AAACT	2	10	80788	80797	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021829	AAGAT	2	10	81226	81235	60 %	20 %	20 %	0 %	525721314
63	NC_021829	GTAAA	2	10	82108	82117	60 %	20 %	20 %	0 %	525721314
64	NC_021829	AGAAA	2	10	83012	83021	80 %	0 %	20 %	0 %	525721315
65	NC_021829	GATTT	2	10	83689	83698	20 %	60 %	20 %	0 %	525721315
66	NC_021829	CAATC	2	10	84558	84567	40 %	20 %	0 %	40 %	525721316
67	NC_021829	AAAGT	2	10	85215	85224	60 %	20 %	20 %	0 %	525721317
68	NC_021829	GACTA	2	10	85951	85960	40 %	20 %	20 %	20 %	525721318
69	NC_021829	AAATA	2	10	88721	88730	80 %	20 %	0 %	0 %	525721321
70	NC_021829	GAAAA	2	10	90681	90690	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021829	TGTTT	2	10	91008	91017	0 %	80 %	20 %	0 %	525721324
72	NC_021829	ACCAT	2	10	91482	91491	40 %	20 %	0 %	40 %	525721325
73	NC_021829	TCAAA	2	10	91897	91906	60 %	20 %	0 %	20 %	525721325
74	NC_021829	AAAAT	2	10	94271	94280	80 %	20 %	0 %	0 %	525721327
75	NC_021829	GTTTG	2	10	94400	94409	0 %	60 %	40 %	0 %	525723689
76	NC_021829	TAGAA	2	10	94566	94575	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021829	CATTT	2	10	94581	94590	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021829	TTTAT	2	10	94741	94750	20 %	80 %	0 %	0 %	525721328
79	NC_021829	TTCAT	2	10	95128	95137	20 %	60 %	0 %	20 %	525721328
80	NC_021829	TGCAT	2	10	99189	99198	20 %	40 %	20 %	20 %	525721333
81	NC_021829	CTCTC	2	10	99239	99248	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_021829	AAATT	2	10	102595	102604	60 %	40 %	0 %	0 %	525721337
83	NC_021829	GACAA	2	10	103015	103024	60 %	0 %	20 %	20 %	525721337
84	NC_021829	CGCTA	2	10	104257	104266	20 %	20 %	20 %	40 %	525721338
85	NC_021829	GTTCT	2	10	104736	104745	0 %	60 %	20 %	20 %	525721338
86	NC_021829	ACTTA	2	10	105622	105631	40 %	40 %	0 %	20 %	525721340
87	NC_021829	AAAAT	2	10	106533	106542	80 %	20 %	0 %	0 %	525721341
88	NC_021829	AGAAA	2	10	107314	107323	80 %	0 %	20 %	0 %	525721341
89	NC_021829	TATCT	2	10	108180	108189	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_021829	TCGCT	2	10	108769	108778	0 %	40 %	20 %	40 %	525721343
91	NC_021829	TAACT	2	10	110309	110318	40 %	40 %	0 %	20 %	525721344
92	NC_021829	TCAAA	2	10	110389	110398	60 %	20 %	0 %	20 %	525721344
93	NC_021829	AAATG	2	10	110975	110984	60 %	20 %	20 %	0 %	525721344
94	NC_021829	ATAGA	2	10	111869	111878	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021829	AATCA	2	10	113163	113172	60 %	20 %	0 %	20 %	525721347
96	NC_021829	AATAA	2	10	114688	114697	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021829	CCAAC	2	10	114948	114957	40 %	0 %	0 %	60 %	525721348
98	NC_021829	CGTTT	2	10	122278	122287	0 %	60 %	20 %	20 %	525721354
99	NC_021829	TACCT	2	10	123466	123475	20 %	40 %	0 %	40 %	525721356
100	NC_021829	ATTAT	2	10	124636	124645	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021829	TTTTA	2	10	126248	126257	20 %	80 %	0 %	0 %	525721359
102	NC_021829	CGTAT	2	10	126373	126382	20 %	40 %	20 %	20 %	525721359
103	NC_021829	GCCTG	2	10	128396	128405	0 %	20 %	40 %	40 %	525721361
104	NC_021829	AATAA	2	10	131334	131343	80 %	20 %	0 %	0 %	525723690
105	NC_021829	AGTCC	2	10	133190	133199	20 %	20 %	20 %	40 %	525721366
106	NC_021829	TTTTC	2	10	138658	138667	0 %	80 %	0 %	20 %	525721372
107	NC_021829	TTTTA	2	10	139107	139116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021829	TAAAA	2	10	139172	139181	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021829	CAATT	2	10	139643	139652	40 %	40 %	0 %	20 %	525721373
110	NC_021829	TCTTG	2	10	140786	140795	0 %	60 %	20 %	20 %	525721375
111	NC_021829	AAATC	2	10	142730	142739	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_021829	GCGAT	2	10	144340	144349	20 %	20 %	40 %	20 %	525721378
113	NC_021829	GTCCA	2	10	145816	145825	20 %	20 %	20 %	40 %	525721379
114	NC_021829	CTCAT	2	10	146304	146313	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_021829	ATACG	2	10	146802	146811	40 %	20 %	20 %	20 %	525721380
116	NC_021829	TTAAA	2	10	147958	147967	60 %	40 %	0 %	0 %	525721381
117	NC_021829	TAATT	2	10	148487	148496	40 %	60 %	0 %	0 %	525721381
118	NC_021829	TTTTC	2	10	149406	149415	0 %	80 %	0 %	20 %	525721382
119	NC_021829	TCATG	2	10	149541	149550	20 %	40 %	20 %	20 %	525721382
120	NC_021829	TTGTT	2	10	149905	149914	0 %	80 %	20 %	0 %	525721382
121	NC_021829	ACAAA	2	10	150940	150949	80 %	0 %	0 %	20 %	525721385
122	NC_021829	TTTTA	2	10	151581	151590	20 %	80 %	0 %	0 %	525721386
123	NC_021829	GTGAA	2	10	152183	152192	40 %	20 %	40 %	0 %	525721386
124	NC_021829	TGAAA	2	10	152360	152369	60 %	20 %	20 %	0 %	525721387
125	NC_021829	ATCAA	2	10	154210	154219	60 %	20 %	0 %	20 %	525721388
126	NC_021829	CTAAG	2	10	155344	155353	40 %	20 %	20 %	20 %	525721390
127	NC_021829	TTCGG	2	10	159674	159683	0 %	40 %	40 %	20 %	525721395
128	NC_021829	TAATA	2	10	159821	159830	60 %	40 %	0 %	0 %	525721395
129	NC_021829	CCACG	2	10	165143	165152	20 %	0 %	20 %	60 %	525721402
130	NC_021829	AATAA	2	10	166074	166083	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021829	TAAAA	2	10	166367	166376	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021829	AAATA	2	10	168250	168259	80 %	20 %	0 %	0 %	525723691
133	NC_021829	TTTCT	2	10	168617	168626	0 %	80 %	0 %	20 %	525721403
134	NC_021829	AATGG	2	10	168896	168905	40 %	20 %	40 %	0 %	525721403
135	NC_021829	TAAAA	2	10	168995	169004	80 %	20 %	0 %	0 %	525721403
136	NC_021829	CATAG	2	10	170567	170576	40 %	20 %	20 %	20 %	525721405
137	NC_021829	TTCGT	2	10	172307	172316	0 %	60 %	20 %	20 %	525721407
138	NC_021829	TGCCA	2	10	175612	175621	20 %	20 %	20 %	40 %	525721410
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263	NC_021829	ATCAT	2	10	329730	329739	40 %	40 %	0 %	20 %	525721535
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267	NC_021829	CTGGT	2	10	339047	339056	0 %	40 %	40 %	20 %	525721542
268	NC_021829	TTCTG	2	10	339498	339507	0 %	60 %	20 %	20 %	525721543
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399	NC_021829	ATTCT	2	10	521276	521285	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
400	NC_021829	TTTTA	2	10	522145	522154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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