MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 6332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021829	AAT	2	6	11	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021829	ACA	2	6	21	26	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021829	ATA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021829	CAT	2	6	62	67	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021829	TTA	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021829	CCA	2	6	88	93	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021829	CAT	2	6	166	171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021829	AAT	2	6	248	253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021829	TAA	2	6	320	325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021829	GCA	2	6	2041	2046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021829	GAT	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021829	ATT	2	6	2136	2141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021829	TGA	2	6	2154	2159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021829	CCT	2	6	2185	2190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_021829	ATT	2	6	2311	2316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021829	ATA	2	6	2342	2347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021829	ATA	2	6	2422	2427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021829	AAT	2	6	2469	2474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021829	TAA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021829	AAT	2	6	2615	2620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021829	CGA	2	6	2659	2664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021829	CGT	2	6	2675	2680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021829	TCA	2	6	2694	2699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021829	TCC	2	6	3081	3086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021829	ATT	2	6	3103	3108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021829	AGG	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021829	ATT	2	6	3205	3210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021829	AAT	2	6	3212	3217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021829	CAT	2	6	3247	3252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021829	TTA	2	6	3348	3353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021829	GAT	2	6	3381	3386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021829	ATT	2	6	3453	3458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021829	TTA	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021829	TAT	2	6	4242	4247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021829	CAT	2	6	4288	4293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021829	AAT	2	6	5057	5062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021829	GGT	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021829	TAT	2	6	5509	5514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021829	ATT	2	6	8845	8850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021829	ACA	2	6	8928	8933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021829	ATA	2	6	8949	8954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021829	TTC	2	6	10601	10606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021829	CAA	2	6	10650	10655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021829	ATA	2	6	10756	10761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021829	AGA	2	6	10765	10770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021829	TCC	2	6	12370	12375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021829	ATT	2	6	13071	13076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021829	TAC	2	6	13124	13129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021829	ATA	2	6	13131	13136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021829	TCA	2	6	13187	13192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021829	ACC	2	6	14777	14782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_021829	AAT	2	6	14824	14829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021829	TCT	2	6	14862	14867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021829	TTG	2	6	15356	15361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021829	TCT	2	6	18017	18022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021829	TTA	2	6	18049	18054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021829	ATA	3	9	18062	18070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021829	CAC	2	6	18085	18090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_021829	TAA	2	6	18092	18097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021829	AGT	2	6	18536	18541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021829	CAC	2	6	19739	19744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_021829	AAG	2	6	24239	24244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021829	CAT	2	6	24273	24278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021829	ATT	2	6	24366	24371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021829	ACA	2	6	31836	31841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021829	ATA	2	6	32036	32041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021829	ATT	2	6	34119	34124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021829	TAT	2	6	36551	36556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021829	AAC	2	6	36557	36562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021829	CTT	2	6	36619	36624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021829	TAC	2	6	36712	36717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021829	TGT	2	6	36730	36735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021829	TTC	2	6	36739	36744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021829	GAG	2	6	36888	36893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021829	GTT	2	6	36944	36949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021829	TCA	2	6	36970	36975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021829	CTT	2	6	36989	36994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021829	AAT	2	6	37035	37040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021829	TCA	2	6	37171	37176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021829	TAA	2	6	37265	37270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021829	ATA	2	6	37294	37299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021829	AAG	2	6	37412	37417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021829	GGA	2	6	37450	37455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021829	ATA	2	6	37468	37473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021829	CAT	2	6	37529	37534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021829	CTT	2	6	38509	38514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021829	ATA	2	6	38523	38528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021829	TAA	2	6	38535	38540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021829	CTC	2	6	38573	38578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_021829	ATT	2	6	38607	38612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021829	GTC	2	6	38614	38619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021829	TCT	2	6	38652	38657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021829	ATT	2	6	38687	38692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021829	TAA	2	6	39724	39729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021829	TTC	2	6	39779	39784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021829	CCT	2	6	43277	43282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_021829	ATT	2	6	43425	43430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021829	TTC	2	6	43537	43542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021829	TTC	2	6	44798	44803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021829	TAT	2	6	44805	44810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021829	AGA	2	6	44835	44840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021829	CCT	2	6	44845	44850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_021829	CAT	2	6	45707	45712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021829	GCT	2	6	45781	45786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021829	AAG	2	6	45822	45827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021829	TCC	2	6	45918	45923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_021829	CAA	2	6	46082	46087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021829	ATG	2	6	46145	46150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021829	GTT	3	9	46168	46176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021829	CCA	2	6	46183	46188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_021829	AGA	2	6	46194	46199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021829	ACT	2	6	46275	46280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021829	ATT	2	6	46281	46286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021829	ATC	2	6	46341	46346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021829	TGT	2	6	46362	46367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021829	CTT	2	6	46370	46375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021829	GTT	3	9	46378	46386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021829	TGT	2	6	46439	46444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021829	TTG	2	6	46455	46460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021829	CTC	2	6	46501	46506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_021829	AAG	2	6	46511	46516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021829	AAT	2	6	46535	46540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021829	CAT	2	6	46553	46558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021829	ACC	2	6	46563	46568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_021829	ATT	2	6	46629	46634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021829	TCC	2	6	48579	48584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_021829	TCC	2	6	48650	48655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_021829	TAT	2	6	48687	48692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021829	AGG	2	6	49654	49659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021829	AGC	2	6	50367	50372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021829	TCC	2	6	52024	52029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_021829	TCC	2	6	53269	53274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_021829	TCA	2	6	53275	53280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021829	AAT	2	6	53378	53383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021829	CCT	2	6	56940	56945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_021829	TTC	2	6	59179	59184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021829	GTA	2	6	59287	59292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021829	TTA	2	6	59377	59382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021829	TTA	2	6	59520	59525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021829	TCT	2	6	59535	59540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021829	ATT	2	6	59612	59617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021829	TTA	2	6	59939	59944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021829	ATG	2	6	61155	61160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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