MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 35941

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021829	CAA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723660
2	NC_021829	TAA	2	6	608	613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723660
3	NC_021829	ATT	2	6	793	798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723660
4	NC_021829	AAG	2	6	971	976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723660
5	NC_021829	CAT	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723660
6	NC_021829	ATA	2	6	1007	1012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723660
7	NC_021829	CCT	2	6	1087	1092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723661
8	NC_021829	TGT	2	6	1159	1164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723661
9	NC_021829	TAA	2	6	1315	1320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723661
10	NC_021829	AAT	2	6	1324	1329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723661
11	NC_021829	GAA	2	6	1387	1392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723661
12	NC_021829	TCA	2	6	1474	1479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723661
13	NC_021829	TCT	2	6	1498	1503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723661
14	NC_021829	TCA	2	6	1527	1532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723661
15	NC_021829	GTT	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723661
16	NC_021829	CCA	2	6	1593	1598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525723661
17	NC_021829	TCA	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723661
18	NC_021829	AGA	2	6	1790	1795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723661
19	NC_021829	CTT	2	6	1888	1893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723661
20	NC_021829	TAT	2	6	1915	1920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723661
21	NC_021829	ATT	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723661
22	NC_021829	TTA	2	6	2751	2756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723662
23	NC_021829	TCA	2	6	2979	2984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723662
24	NC_021829	ATA	2	6	3550	3555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723663
25	NC_021829	ATC	2	6	3641	3646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723663
26	NC_021829	GAT	2	6	3649	3654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723663
27	NC_021829	TCT	2	6	3672	3677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723663
28	NC_021829	ATT	2	6	3689	3694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
29	NC_021829	ATC	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723663
30	NC_021829	TTA	2	6	3723	3728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
31	NC_021829	TGT	2	6	3739	3744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723663
32	NC_021829	ATT	3	9	3884	3892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
33	NC_021829	ATA	2	6	3911	3916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723663
34	NC_021829	TTA	2	6	3925	3930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
35	NC_021829	AAT	2	6	3985	3990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723663
36	NC_021829	CTT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723663
37	NC_021829	TGT	2	6	4017	4022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723663
38	NC_021829	TTA	2	6	4071	4076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
39	NC_021829	TCC	2	6	4082	4087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723663
40	NC_021829	TCT	2	6	4092	4097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723663
41	NC_021829	GAT	2	6	4144	4149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723663
42	NC_021829	CAA	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723663
43	NC_021829	CTT	2	6	4325	4330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723664
44	NC_021829	ATT	2	6	4399	4404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723664
45	NC_021829	TTC	2	6	4419	4424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723664
46	NC_021829	TAA	2	6	4444	4449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723664
47	NC_021829	CAT	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723664
48	NC_021829	TAG	2	6	4576	4581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723665
49	NC_021829	TAT	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723665
50	NC_021829	TTA	2	6	4627	4632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723665
51	NC_021829	TAA	2	6	4685	4690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723665
52	NC_021829	AAC	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723665
53	NC_021829	TGT	2	6	4928	4933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723666
54	NC_021829	TTC	2	6	4952	4957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723666
55	NC_021829	TTC	2	6	4998	5003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723666
56	NC_021829	AAT	2	6	5209	5214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723667
57	NC_021829	GTT	2	6	5236	5241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723667
58	NC_021829	CAT	2	6	5253	5258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723667
59	NC_021829	TTG	2	6	5330	5335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723667
60	NC_021829	AAT	2	6	5343	5348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723667
61	NC_021829	ATA	3	9	5394	5402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723667
62	NC_021829	ATC	2	6	5621	5626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
63	NC_021829	AAC	2	6	5660	5665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723668
64	NC_021829	TCT	2	6	5832	5837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723668
65	NC_021829	TCT	3	9	5856	5864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723668
66	NC_021829	CAA	2	6	6004	6009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723668
67	NC_021829	TAT	3	9	6019	6027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723668
68	NC_021829	TAC	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
69	NC_021829	TCA	2	6	6099	6104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
70	NC_021829	ATA	2	6	6246	6251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
71	NC_021829	ATG	2	6	6295	6300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723668
72	NC_021829	TAC	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
73	NC_021829	CAG	2	6	6352	6357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525723668
74	NC_021829	TCC	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723668
75	NC_021829	TAG	2	6	6366	6371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723668
76	NC_021829	AAT	2	6	6418	6423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
77	NC_021829	ATA	2	6	6543	6548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
78	NC_021829	CAG	2	6	6586	6591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525723668
79	NC_021829	CTA	2	6	6664	6669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
80	NC_021829	CAT	2	6	6757	6762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
81	NC_021829	TAT	2	6	6862	6867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723668
82	NC_021829	TCA	2	6	6900	6905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
83	NC_021829	TCA	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
84	NC_021829	TAA	2	6	7079	7084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
85	NC_021829	TAA	2	6	7099	7104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
86	NC_021829	CTA	2	6	7134	7139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
87	NC_021829	ATA	2	6	7283	7288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
88	NC_021829	TTC	2	6	7328	7333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723668
89	NC_021829	TAA	2	6	7432	7437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
90	NC_021829	TGA	2	6	7490	7495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723668
91	NC_021829	TGC	2	6	7538	7543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525723668
92	NC_021829	CAA	2	6	7616	7621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723668
93	NC_021829	ATC	2	6	7622	7627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
94	NC_021829	TTC	2	6	7634	7639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723668
95	NC_021829	TTG	2	6	7913	7918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723669
96	NC_021829	AAT	2	6	8044	8049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723669
97	NC_021829	CTA	2	6	8075	8080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723669
98	NC_021829	TCT	2	6	8124	8129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723669
99	NC_021829	TAG	2	6	8162	8167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723669
100	NC_021829	AAC	2	6	8178	8183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723669
101	NC_021829	TTC	2	6	8184	8189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723669
102	NC_021829	TAA	2	6	8301	8306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723669
103	NC_021829	TAA	2	6	8424	8429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723669
104	NC_021829	ATG	2	6	8505	8510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723669
105	NC_021829	ATG	2	6	8659	8664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723669
106	NC_021829	TTC	2	6	8785	8790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723669
107	NC_021829	AAT	2	6	9031	9036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723670
108	NC_021829	TTG	2	6	9088	9093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723670
109	NC_021829	CAG	2	6	9180	9185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525723670
110	NC_021829	GCT	2	6	9231	9236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525723670
111	NC_021829	TTA	2	6	9302	9307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723670
112	NC_021829	CTC	2	6	9388	9393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723670
113	NC_021829	AGA	2	6	9397	9402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723670
114	NC_021829	TTA	2	6	9500	9505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723670
115	NC_021829	TCT	2	6	9611	9616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723670
116	NC_021829	ATC	2	6	9733	9738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723670
117	NC_021829	ATA	2	6	9913	9918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723670
118	NC_021829	GTT	2	6	10044	10049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723670
119	NC_021829	AAT	2	6	10114	10119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723670
120	NC_021829	TTA	2	6	10130	10135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723670
121	NC_021829	CCT	2	6	10139	10144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723670
122	NC_021829	CAT	2	6	10311	10316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723671
123	NC_021829	CTC	2	6	10317	10322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723671
124	NC_021829	TAT	2	6	10352	10357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723671
125	NC_021829	TCA	2	6	10432	10437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723671
126	NC_021829	AAT	2	6	10449	10454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723671
127	NC_021829	CTT	2	6	10508	10513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723671
128	NC_021829	TTC	2	6	10539	10544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723671
129	NC_021829	TAG	2	6	10862	10867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723672
130	NC_021829	TCC	2	6	10935	10940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723672
131	NC_021829	TCT	2	6	11016	11021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723672
132	NC_021829	CTG	2	6	11213	11218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721266
133	NC_021829	CTC	2	6	11300	11305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525721266
134	NC_021829	TCT	2	6	11398	11403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721266
135	NC_021829	CAT	2	6	11616	11621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721266
136	NC_021829	TTC	2	6	11643	11648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721266
137	NC_021829	ATA	2	6	11848	11853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721266
138	NC_021829	CTT	2	6	11967	11972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721266
139	NC_021829	CTG	2	6	12011	12016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721266
140	NC_021829	CTT	2	6	12053	12058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721266
141	NC_021829	TGC	2	6	12156	12161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721266
142	NC_021829	TCC	2	6	12173	12178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525721267
143	NC_021829	ATA	2	6	12212	12217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721267
144	NC_021829	TGA	2	6	12343	12348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721267
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150	NC_021829	GAA	2	6	12940	12945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723673
151	NC_021829	TGG	2	6	13240	13245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525721268
152	NC_021829	ACA	2	6	13265	13270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721268
153	NC_021829	AAC	2	6	13381	13386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721268
154	NC_021829	TTC	2	6	13495	13500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721268
155	NC_021829	TCT	2	6	13697	13702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721268
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159	NC_021829	GAT	2	6	13855	13860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721268
160	NC_021829	TGA	2	6	13929	13934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721268
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163	NC_021829	CGC	2	6	14076	14081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721268
164	NC_021829	TTC	2	6	14201	14206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721268
165	NC_021829	TTC	2	6	14272	14277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721268
166	NC_021829	CAG	2	6	14331	14336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721268
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170	NC_021829	TTC	2	6	14629	14634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721268
171	NC_021829	GCG	2	6	14686	14691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525721268
172	NC_021829	TCC	2	6	15025	15030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525721269
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189	NC_021829	CTG	2	6	15877	15882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721271
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235	NC_021829	TCT	2	6	19206	19211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721274
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237	NC_021829	CTT	2	6	19285	19290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721274
238	NC_021829	CTT	2	6	19314	19319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721274
239	NC_021829	GCT	2	6	19326	19331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721274
240	NC_021829	AAT	2	6	19429	19434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721274
241	NC_021829	AAC	2	6	19562	19567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721274
242	NC_021829	CTT	2	6	19723	19728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721274
243	NC_021829	CTG	2	6	19780	19785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525723674
244	NC_021829	TCT	2	6	19827	19832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723674
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246	NC_021829	AAT	2	6	20023	20028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723674
247	NC_021829	CAA	2	6	20036	20041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723674
248	NC_021829	ATC	2	6	20376	20381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723674
249	NC_021829	AGT	2	6	20443	20448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723674
250	NC_021829	CTT	2	6	20461	20466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723674
251	NC_021829	GTT	2	6	20493	20498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723674
252	NC_021829	TCA	2	6	20517	20522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723674
253	NC_021829	CTA	2	6	20610	20615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723674
254	NC_021829	ATA	2	6	20731	20736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723674
255	NC_021829	CTC	2	6	20756	20761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723674
256	NC_021829	ACA	2	6	20866	20871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723674
257	NC_021829	AAT	2	6	20872	20877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723674
258	NC_021829	TCA	2	6	20896	20901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723674
259	NC_021829	CTT	2	6	21192	21197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723675
260	NC_021829	CAT	2	6	21322	21327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723675
261	NC_021829	TAC	2	6	21334	21339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723675
262	NC_021829	TAA	2	6	21644	21649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723675
263	NC_021829	TCC	2	6	21716	21721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723675
264	NC_021829	TCA	2	6	21737	21742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723675
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271	NC_021829	TAA	2	6	22161	22166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723675
272	NC_021829	TAT	2	6	22419	22424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721275
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276	NC_021829	TCC	2	6	22751	22756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525721275
277	NC_021829	CAT	2	6	22798	22803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721275
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284	NC_021829	CAT	2	6	23104	23109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721275
285	NC_021829	CAT	2	6	23227	23232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721275
286	NC_021829	AAC	2	6	23234	23239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721275
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