MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain R2-502 plasmid

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021828	TTTCTT	2	12	3896	3907	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525901172
2	NC_021828	TTTTTG	2	12	7471	7482	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525901177
3	NC_021828	TGAAAT	2	12	13021	13032	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525901183
4	NC_021828	ATCGAC	2	12	13329	13340	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525901183
5	NC_021828	AGGAAA	2	12	13815	13826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021828	CTCGAT	2	12	17342	17353	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525901187
7	NC_021828	TGACGC	2	12	23775	23786	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525901159
8	NC_021828	ATTTCT	2	12	24514	24525	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525901191
9	NC_021828	GAAATT	2	12	25499	25510	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525901192
10	NC_021828	TTGATT	2	12	25902	25913	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525901192
11	NC_021828	CAAGAA	2	12	27659	27670	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525901161
12	NC_021828	AGTCAG	2	12	30546	30557	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525901195
13	NC_021828	TTTTCT	2	12	32152	32163	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525901197
14	NC_021828	ATATGT	2	12	32939	32950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021828	TTACAT	2	12	32975	32986	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021828	ACAACC	2	12	33759	33770	50 %	0 %	0 %	50 %	525901201
17	NC_021828	CTTTCA	2	12	34115	34126	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525901202
18	NC_021828	AATTTG	2	12	36923	36934	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525901164
19	NC_021828	ATTAGG	2	12	39247	39258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901204
20	NC_021828	AGTGCA	2	12	40136	40147	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525901204
21	NC_021828	CATCTT	2	12	40811	40822	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525901205
22	NC_021828	ATTAAA	2	12	43146	43157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901206
23	NC_021828	AACGAC	2	12	49299	49310	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525901166
24	NC_021828	GAAAAA	2	12	55866	55877	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525901213

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.