MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain R2-502 plasmid

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021828	TCTTG	2	10	383	392	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021828	CGATC	2	10	1668	1677	20 %	20 %	20 %	40 %	525901168
3	NC_021828	TCTTT	2	10	1826	1835	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021828	AATAC	2	10	5378	5387	60 %	20 %	0 %	20 %	525901173
5	NC_021828	GATAA	2	10	7299	7308	60 %	20 %	20 %	0 %	525901176
6	NC_021828	GAATT	2	10	9613	9622	40 %	40 %	20 %	0 %	525901180
7	NC_021828	TTCAG	2	10	12748	12757	20 %	40 %	20 %	20 %	525901183
8	NC_021828	AACAT	2	10	12844	12853	60 %	20 %	0 %	20 %	525901183
9	NC_021828	TAAAA	2	10	13254	13263	80 %	20 %	0 %	0 %	525901183
10	NC_021828	ATTTT	2	10	14885	14894	20 %	80 %	0 %	0 %	525901185
11	NC_021828	ATAGA	2	10	16676	16685	60 %	20 %	20 %	0 %	525901156
12	NC_021828	ATTCC	2	10	18140	18149	20 %	40 %	0 %	40 %	525901188
13	NC_021828	TAAGC	2	10	20086	20095	40 %	20 %	20 %	20 %	525901157
14	NC_021828	TTTAA	2	10	22460	22469	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021828	AGAGA	2	10	23026	23035	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021828	TAATT	2	10	23181	23190	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021828	TATTT	2	10	23213	23222	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021828	ACTTG	2	10	23276	23285	20 %	40 %	20 %	20 %	525901190
19	NC_021828	AATAA	2	10	24654	24663	80 %	20 %	0 %	0 %	525901191
20	NC_021828	TTTCA	2	10	26315	26324	20 %	60 %	0 %	20 %	525901192
21	NC_021828	CTTCC	2	10	31731	31740	0 %	40 %	0 %	60 %	525901163
22	NC_021828	AAAGA	2	10	33238	33247	80 %	0 %	20 %	0 %	525901199
23	NC_021828	TCCAG	2	10	36534	36543	20 %	20 %	20 %	40 %	525901203
24	NC_021828	GAAAA	2	10	39221	39230	80 %	0 %	20 %	0 %	525901204
25	NC_021828	ATTTG	2	10	40303	40312	20 %	60 %	20 %	0 %	525901204
26	NC_021828	TTTCT	2	10	40586	40595	0 %	80 %	0 %	20 %	525901205
27	NC_021828	TAATT	2	10	40834	40843	40 %	60 %	0 %	0 %	525901205
28	NC_021828	CTTTC	2	10	41253	41262	0 %	60 %	0 %	40 %	525901205
29	NC_021828	TTTTA	2	10	41538	41547	20 %	80 %	0 %	0 %	525901206
30	NC_021828	TGTAC	2	10	42828	42837	20 %	40 %	20 %	20 %	525901206
31	NC_021828	CAATC	2	10	43369	43378	40 %	20 %	0 %	40 %	525901206
32	NC_021828	TGAAT	2	10	45259	45268	40 %	40 %	20 %	0 %	525901207
33	NC_021828	AAGAT	2	10	45438	45447	60 %	20 %	20 %	0 %	525901207
34	NC_021828	TTTTC	2	10	46741	46750	0 %	80 %	0 %	20 %	525901208
35	NC_021828	TTTTA	2	10	48127	48136	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021828	TGTCT	2	10	49950	49959	0 %	60 %	20 %	20 %	525901166
37	NC_021828	CTTGT	2	10	51205	51214	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021828	ATTAA	2	10	52469	52478	60 %	40 %	0 %	0 %	525901211
39	NC_021828	AGAAA	2	10	52597	52606	80 %	0 %	20 %	0 %	525901211
40	NC_021828	GAACA	2	10	56570	56579	60 %	0 %	20 %	20 %	525901214

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.