MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain R2-502 plasmid

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021828	GTTT	2	8	160	167	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021828	AAAT	2	8	175	182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021828	TCGG	2	8	334	341	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021828	CTTT	2	8	346	353	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021828	TTTC	2	8	467	474	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021828	CTTT	2	8	1027	1034	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021828	TAAA	2	8	1864	1871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021828	GGAG	2	8	1872	1879	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021828	CTTA	2	8	6394	6401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021828	TAAT	2	8	8082	8089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021828	CTTG	2	8	8100	8107	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021828	AATT	2	8	12001	12008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021828	CAAA	2	8	13749	13756	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021828	TCCC	2	8	13768	13775	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_021828	AATT	2	8	14273	14280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021828	ACAA	2	8	17413	17420	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021828	CAAA	2	8	17503	17510	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021828	TCAG	2	8	17536	17543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021828	ATTT	2	8	18367	18374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021828	GAAA	2	8	18419	18426	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021828	TTAT	2	8	20067	20074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021828	TTCG	2	8	24149	24156	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021828	AAGG	2	8	27368	27375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021828	GCAA	2	8	31170	31177	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021828	AAAG	2	8	31205	31212	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021828	TATC	2	8	43848	43855	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021828	AAAT	2	8	43887	43894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021828	CTTC	2	8	44625	44632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021828	CTTT	2	8	49006	49013	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021828	AGTT	2	8	51217	51224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021828	TTAC	2	8	51260	51267	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021828	AAAT	2	8	51319	51326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021828	ATTT	2	8	55529	55536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.