MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain R2-502 plasmid

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021828	GCTT	2	8	1570	1577	0 %	50 %	25 %	25 %	525901168
2	NC_021828	ACTA	2	8	1642	1649	50 %	25 %	0 %	25 %	525901168
3	NC_021828	ACTT	2	8	2049	2056	25 %	50 %	0 %	25 %	525901169
4	NC_021828	AATA	2	8	3108	3115	75 %	25 %	0 %	0 %	525901171
5	NC_021828	ATGG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	525901171
6	NC_021828	TTCT	2	8	3224	3231	0 %	75 %	0 %	25 %	525901171
7	NC_021828	CTTT	2	8	3516	3523	0 %	75 %	0 %	25 %	525901171
8	NC_021828	GCGA	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	525901171
9	NC_021828	TCTT	2	8	4028	4035	0 %	75 %	0 %	25 %	525901172
10	NC_021828	ATTG	2	8	5741	5748	25 %	50 %	25 %	0 %	525901174
11	NC_021828	TTCT	2	8	5774	5781	0 %	75 %	0 %	25 %	525901174
12	NC_021828	TTTA	2	8	6487	6494	25 %	75 %	0 %	0 %	525901176
13	NC_021828	TCTT	2	8	6738	6745	0 %	75 %	0 %	25 %	525901176
14	NC_021828	ACTT	2	8	7085	7092	25 %	50 %	0 %	25 %	525901176
15	NC_021828	TGTT	2	8	7333	7340	0 %	75 %	25 %	0 %	525901176
16	NC_021828	TCTT	2	8	7356	7363	0 %	75 %	0 %	25 %	525901176
17	NC_021828	CTTC	2	8	7392	7399	0 %	50 %	0 %	50 %	525901176
18	NC_021828	ATGA	2	8	8379	8386	50 %	25 %	25 %	0 %	525901179
19	NC_021828	GAAA	2	8	8723	8730	75 %	0 %	25 %	0 %	525901179
20	NC_021828	CAAA	2	8	9039	9046	75 %	0 %	0 %	25 %	525901179
21	NC_021828	CATC	2	8	9233	9240	25 %	25 %	0 %	50 %	525901179
22	NC_021828	TTTG	2	8	9393	9400	0 %	75 %	25 %	0 %	525901179
23	NC_021828	GAAA	2	8	9633	9640	75 %	0 %	25 %	0 %	525901180
24	NC_021828	ATCG	2	8	9949	9956	25 %	25 %	25 %	25 %	525901180
25	NC_021828	ACTT	2	8	10118	10125	25 %	50 %	0 %	25 %	525901180
26	NC_021828	GAAA	2	8	10150	10157	75 %	0 %	25 %	0 %	525901180
27	NC_021828	TCTT	2	8	10829	10836	0 %	75 %	0 %	25 %	525901155
28	NC_021828	TCCA	2	8	11411	11418	25 %	25 %	0 %	50 %	525901181
29	NC_021828	CAAG	2	8	12826	12833	50 %	0 %	25 %	25 %	525901183
30	NC_021828	GTTC	2	8	13121	13128	0 %	50 %	25 %	25 %	525901183
31	NC_021828	ATTG	2	8	14619	14626	25 %	50 %	25 %	0 %	525901185
32	NC_021828	ATCA	2	8	15799	15806	50 %	25 %	0 %	25 %	525901156
33	NC_021828	GCAT	2	8	15815	15822	25 %	25 %	25 %	25 %	525901156
34	NC_021828	ATGA	2	8	16108	16115	50 %	25 %	25 %	0 %	525901156
35	NC_021828	GAAG	2	8	16713	16720	50 %	0 %	50 %	0 %	525901156
36	NC_021828	CTAC	2	8	17137	17144	25 %	25 %	0 %	50 %	525901187
37	NC_021828	ATTC	2	8	18320	18327	25 %	50 %	0 %	25 %	525901188
38	NC_021828	CATT	2	8	19231	19238	25 %	50 %	0 %	25 %	525901189
39	NC_021828	TTAA	2	8	19348	19355	50 %	50 %	0 %	0 %	525901189
40	NC_021828	AATT	2	8	20711	20718	50 %	50 %	0 %	0 %	525901157
41	NC_021828	TCGA	2	8	21111	21118	25 %	25 %	25 %	25 %	525901157
42	NC_021828	AATC	2	8	21724	21731	50 %	25 %	0 %	25 %	525901157
43	NC_021828	ATTG	2	8	22141	22148	25 %	50 %	25 %	0 %	525901157
44	NC_021828	AAAT	2	8	23439	23446	75 %	25 %	0 %	0 %	525901190
45	NC_021828	TTTC	2	8	23614	23621	0 %	75 %	0 %	25 %	525901159
46	NC_021828	AATA	2	8	23944	23951	75 %	25 %	0 %	0 %	525901159
47	NC_021828	GACC	2	8	24009	24016	25 %	0 %	25 %	50 %	525901159
48	NC_021828	TTTA	2	8	24618	24625	25 %	75 %	0 %	0 %	525901191
49	NC_021828	GTTT	2	8	24757	24764	0 %	75 %	25 %	0 %	525901191
50	NC_021828	ATTA	2	8	25187	25194	50 %	50 %	0 %	0 %	525901192
51	NC_021828	ATTT	2	8	25475	25482	25 %	75 %	0 %	0 %	525901192
52	NC_021828	CATA	2	8	25729	25736	50 %	25 %	0 %	25 %	525901192
53	NC_021828	AATT	2	8	25879	25886	50 %	50 %	0 %	0 %	525901192
54	NC_021828	TTGA	2	8	26098	26105	25 %	50 %	25 %	0 %	525901192
55	NC_021828	ACAA	2	8	26554	26561	75 %	0 %	0 %	25 %	525901192
56	NC_021828	AAAC	2	8	27411	27418	75 %	0 %	0 %	25 %	525901160
57	NC_021828	GAAA	2	8	27575	27582	75 %	0 %	25 %	0 %	525901160
58	NC_021828	AAAG	2	8	27759	27766	75 %	0 %	25 %	0 %	525901161
59	NC_021828	TCAA	2	8	28029	28036	50 %	25 %	0 %	25 %	525901161
60	NC_021828	AAAG	2	8	28360	28367	75 %	0 %	25 %	0 %	525901161
61	NC_021828	TTAT	2	8	28477	28484	25 %	75 %	0 %	0 %	525901161
62	NC_021828	AAAT	2	8	28667	28674	75 %	25 %	0 %	0 %	525901162
63	NC_021828	ACCT	2	8	28722	28729	25 %	25 %	0 %	50 %	525901162
64	NC_021828	AACA	2	8	28791	28798	75 %	0 %	0 %	25 %	525901162
65	NC_021828	ATTT	2	8	28852	28859	25 %	75 %	0 %	0 %	525901162
66	NC_021828	TTTC	2	8	29110	29117	0 %	75 %	0 %	25 %	525901162
67	NC_021828	CATT	2	8	30198	30205	25 %	50 %	0 %	25 %	525901194
68	NC_021828	ATGT	2	8	31016	31023	25 %	50 %	25 %	0 %	525901196
69	NC_021828	TCTT	2	8	31824	31831	0 %	75 %	0 %	25 %	525901163
70	NC_021828	AAAT	2	8	31850	31857	75 %	25 %	0 %	0 %	525901163
71	NC_021828	TAAT	2	8	31910	31917	50 %	50 %	0 %	0 %	525901197
72	NC_021828	TTTC	2	8	31936	31943	0 %	75 %	0 %	25 %	525901197
73	NC_021828	CAAA	2	8	32094	32101	75 %	0 %	0 %	25 %	525901197
74	NC_021828	ATTC	2	8	32292	32299	25 %	50 %	0 %	25 %	525901197
75	NC_021828	GTTT	2	8	32839	32846	0 %	75 %	25 %	0 %	525901198
76	NC_021828	CAAG	2	8	33097	33104	50 %	0 %	25 %	25 %	525901199
77	NC_021828	AATC	2	8	33136	33143	50 %	25 %	0 %	25 %	525901199
78	NC_021828	CGAT	2	8	33799	33806	25 %	25 %	25 %	25 %	525901201
79	NC_021828	CAAC	2	8	33907	33914	50 %	0 %	0 %	50 %	525901201
80	NC_021828	TAAT	2	8	34107	34114	50 %	50 %	0 %	0 %	525901202
81	NC_021828	TTGC	2	8	34544	34551	0 %	50 %	25 %	25 %	525901202
82	NC_021828	TCAC	2	8	34723	34730	25 %	25 %	0 %	50 %	525901202
83	NC_021828	GATG	2	8	34842	34849	25 %	25 %	50 %	0 %	525901202
84	NC_021828	CCAT	2	8	35542	35549	25 %	25 %	0 %	50 %	525901202
85	NC_021828	TCCT	2	8	35844	35851	0 %	50 %	0 %	50 %	525901202
86	NC_021828	AAAT	2	8	35885	35892	75 %	25 %	0 %	0 %	525901202
87	NC_021828	AATA	2	8	35952	35959	75 %	25 %	0 %	0 %	525901202
88	NC_021828	TTCT	2	8	36036	36043	0 %	75 %	0 %	25 %	525901202
89	NC_021828	GAGT	2	8	36903	36910	25 %	25 %	50 %	0 %	525901164
90	NC_021828	TTAT	2	8	37059	37066	25 %	75 %	0 %	0 %	525901164
91	NC_021828	TTGA	2	8	37100	37107	25 %	50 %	25 %	0 %	525901164
92	NC_021828	TCAA	2	8	37315	37322	50 %	25 %	0 %	25 %	525901164
93	NC_021828	GGAA	2	8	37424	37431	50 %	0 %	50 %	0 %	525901164
94	NC_021828	AACT	2	8	37433	37440	50 %	25 %	0 %	25 %	525901164
95	NC_021828	TCCA	2	8	37649	37656	25 %	25 %	0 %	50 %	525901204
96	NC_021828	CAAT	2	8	37807	37814	50 %	25 %	0 %	25 %	525901204
97	NC_021828	CAAT	2	8	38163	38170	50 %	25 %	0 %	25 %	525901204
98	NC_021828	GATC	2	8	38311	38318	25 %	25 %	25 %	25 %	525901204
99	NC_021828	TGAT	2	8	38442	38449	25 %	50 %	25 %	0 %	525901204
100	NC_021828	AAAT	2	8	38694	38701	75 %	25 %	0 %	0 %	525901204
101	NC_021828	GAAG	2	8	38876	38883	50 %	0 %	50 %	0 %	525901204
102	NC_021828	ACTC	2	8	38937	38944	25 %	25 %	0 %	50 %	525901204
103	NC_021828	TCAA	2	8	39536	39543	50 %	25 %	0 %	25 %	525901204
104	NC_021828	GCTT	2	8	39615	39622	0 %	50 %	25 %	25 %	525901204
105	NC_021828	AATT	2	8	40610	40617	50 %	50 %	0 %	0 %	525901205
106	NC_021828	TCCA	2	8	41079	41086	25 %	25 %	0 %	50 %	525901205
107	NC_021828	TTTC	2	8	41417	41424	0 %	75 %	0 %	25 %	525901205
108	NC_021828	ACCA	2	8	41873	41880	50 %	0 %	0 %	50 %	525901206
109	NC_021828	CTTT	2	8	41922	41929	0 %	75 %	0 %	25 %	525901206
110	NC_021828	CTTT	2	8	42069	42076	0 %	75 %	0 %	25 %	525901206
111	NC_021828	TACT	2	8	42688	42695	25 %	50 %	0 %	25 %	525901206
112	NC_021828	ATCA	2	8	43040	43047	50 %	25 %	0 %	25 %	525901206
113	NC_021828	GATT	2	8	44055	44062	25 %	50 %	25 %	0 %	525901165
114	NC_021828	TAGG	2	8	44108	44115	25 %	25 %	50 %	0 %	525901165
115	NC_021828	TCAA	2	8	44141	44148	50 %	25 %	0 %	25 %	525901165
116	NC_021828	CCGG	2	8	44331	44338	0 %	0 %	50 %	50 %	525901165
117	NC_021828	AATA	2	8	44471	44478	75 %	25 %	0 %	0 %	525901165
118	NC_021828	ATTA	2	8	44765	44772	50 %	50 %	0 %	0 %	525901207
119	NC_021828	TTTA	2	8	45171	45178	25 %	75 %	0 %	0 %	525901207
120	NC_021828	TTTA	2	8	45269	45276	25 %	75 %	0 %	0 %	525901207
121	NC_021828	GAAA	2	8	45463	45470	75 %	0 %	25 %	0 %	525901207
122	NC_021828	ATTA	2	8	45598	45605	50 %	50 %	0 %	0 %	525901207
123	NC_021828	TGAT	2	8	46528	46535	25 %	50 %	25 %	0 %	525901208
124	NC_021828	GAAG	2	8	47094	47101	50 %	0 %	50 %	0 %	525901208
125	NC_021828	ATGA	2	8	47274	47281	50 %	25 %	25 %	0 %	525901208
126	NC_021828	GCTA	2	8	47309	47316	25 %	25 %	25 %	25 %	525901208
127	NC_021828	TTAT	2	8	47373	47380	25 %	75 %	0 %	0 %	525901208
128	NC_021828	GAAA	2	8	48542	48549	75 %	0 %	25 %	0 %	525901209
129	NC_021828	AAAT	2	8	48756	48763	75 %	25 %	0 %	0 %	525901209
130	NC_021828	CGAT	2	8	50420	50427	25 %	25 %	25 %	25 %	525901166
131	NC_021828	TTTC	2	8	50531	50538	0 %	75 %	0 %	25 %	525901166
132	NC_021828	CAAA	2	8	50852	50859	75 %	0 %	0 %	25 %	525901166
133	NC_021828	CTGT	2	8	51524	51531	0 %	50 %	25 %	25 %	525901210
134	NC_021828	ATCA	2	8	51777	51784	50 %	25 %	0 %	25 %	525901210
135	NC_021828	GATA	2	8	51836	51843	50 %	25 %	25 %	0 %	525901210
136	NC_021828	CCAT	2	8	51949	51956	25 %	25 %	0 %	50 %	525901210
137	NC_021828	GCTT	2	8	52054	52061	0 %	50 %	25 %	25 %	525901210
138	NC_021828	TATT	2	8	52343	52350	25 %	75 %	0 %	0 %	525901211
139	NC_021828	AAAG	2	8	52436	52443	75 %	0 %	25 %	0 %	525901211
140	NC_021828	TTGT	2	8	52580	52587	0 %	75 %	25 %	0 %	525901211
141	NC_021828	TGGT	2	8	53599	53606	0 %	50 %	50 %	0 %	525901167
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.