MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain R2-502 plasmid

Total Repeats: 678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021828	CTT	2	6	1320	1325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901168
2	NC_021828	CTT	3	9	1331	1339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901168
3	NC_021828	ATA	2	6	1382	1387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901168
4	NC_021828	AAT	2	6	1486	1491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901168
5	NC_021828	CCA	2	6	1546	1551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525901168
6	NC_021828	AAG	2	6	1658	1663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901168
7	NC_021828	ATC	2	6	1948	1953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901169
8	NC_021828	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901169
9	NC_021828	TAC	2	6	1995	2000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901169
10	NC_021828	GTG	2	6	2005	2010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525901169
11	NC_021828	GAA	3	9	2157	2165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901169
12	NC_021828	GCT	2	6	2320	2325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901170
13	NC_021828	AGT	2	6	2414	2419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901170
14	NC_021828	GTC	2	6	2622	2627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901170
15	NC_021828	CTT	2	6	2744	2749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901170
16	NC_021828	AAT	2	6	2755	2760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901170
17	NC_021828	TCT	2	6	2770	2775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901170
18	NC_021828	ATC	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901171
19	NC_021828	TCT	2	6	3066	3071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901171
20	NC_021828	TGG	2	6	3086	3091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525901171
21	NC_021828	TCA	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901171
22	NC_021828	ATC	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901171
23	NC_021828	TTC	2	6	3239	3244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901171
24	NC_021828	TTG	2	6	3281	3286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901171
25	NC_021828	TTG	2	6	3415	3420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901171
26	NC_021828	TAT	2	6	3535	3540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901171
27	NC_021828	ATA	2	6	3546	3551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901171
28	NC_021828	ATT	2	6	3663	3668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901171
29	NC_021828	GCT	2	6	3729	3734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901172
30	NC_021828	AAT	2	6	3789	3794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901172
31	NC_021828	CTT	2	6	3830	3835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901172
32	NC_021828	CCT	2	6	3843	3848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525901172
33	NC_021828	GTC	2	6	3871	3876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901172
34	NC_021828	ACT	3	9	3922	3930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901172
35	NC_021828	TCT	2	6	3952	3957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901172
36	NC_021828	ATC	2	6	3984	3989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901172
37	NC_021828	TTC	2	6	4111	4116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901173
38	NC_021828	TTC	2	6	4130	4135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901173
39	NC_021828	CTG	2	6	4264	4269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901173
40	NC_021828	AAT	2	6	4275	4280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901173
41	NC_021828	GAA	2	6	4332	4337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901173
42	NC_021828	CTT	2	6	4422	4427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901173
43	NC_021828	TCT	2	6	4475	4480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901173
44	NC_021828	GAT	2	6	4482	4487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901173
45	NC_021828	AAT	2	6	4497	4502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901173
46	NC_021828	ACC	2	6	4520	4525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525901173
47	NC_021828	TCT	2	6	4619	4624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901173
48	NC_021828	CTT	2	6	4635	4640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901173
49	NC_021828	AAG	2	6	4660	4665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901173
50	NC_021828	TCA	2	6	4682	4687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901173
51	NC_021828	CAC	2	6	4704	4709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525901173
52	NC_021828	TTG	2	6	4752	4757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901173
53	NC_021828	TGC	2	6	4903	4908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901173
54	NC_021828	TCT	2	6	4934	4939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901173
55	NC_021828	TTG	2	6	4975	4980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901173
56	NC_021828	TAT	3	9	5079	5087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901173
57	NC_021828	GCT	2	6	5129	5134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901173
58	NC_021828	TCT	3	9	5222	5230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901173
59	NC_021828	TTC	3	9	5236	5244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901173
60	NC_021828	TCA	2	6	5291	5296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901173
61	NC_021828	CTG	2	6	5388	5393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901173
62	NC_021828	CTT	2	6	5452	5457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901174
63	NC_021828	TCG	2	6	5483	5488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901174
64	NC_021828	CTT	3	9	5494	5502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901174
65	NC_021828	TGT	2	6	5609	5614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901174
66	NC_021828	TTC	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901174
67	NC_021828	GTT	2	6	5710	5715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901174
68	NC_021828	AAT	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901174
69	NC_021828	TAA	2	6	5869	5874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901175
70	NC_021828	GAT	2	6	5899	5904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901175
71	NC_021828	CTT	2	6	5931	5936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901175
72	NC_021828	GAT	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901175
73	NC_021828	TCC	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525901175
74	NC_021828	GCA	2	6	5969	5974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525901175
75	NC_021828	AAT	2	6	6090	6095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901175
76	NC_021828	TTC	2	6	6522	6527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901176
77	NC_021828	TTC	2	6	6542	6547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901176
78	NC_021828	AGC	2	6	6551	6556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525901176
79	NC_021828	CTT	2	6	6565	6570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901176
80	NC_021828	TAT	2	6	6589	6594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901176
81	NC_021828	TTC	2	6	6644	6649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901176
82	NC_021828	TTG	2	6	6683	6688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901176
83	NC_021828	AAT	2	6	6698	6703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901176
84	NC_021828	TGT	2	6	6751	6756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901176
85	NC_021828	ATT	2	6	6768	6773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901176
86	NC_021828	CTT	2	6	6787	6792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901176
87	NC_021828	GTT	2	6	6807	6812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901176
88	NC_021828	ATC	2	6	6881	6886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901176
89	NC_021828	TTC	2	6	6929	6934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901176
90	NC_021828	CAT	2	6	6940	6945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901176
91	NC_021828	CTA	2	6	6994	6999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901176
92	NC_021828	ATC	2	6	7010	7015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901176
93	NC_021828	AAT	2	6	7246	7251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901176
94	NC_021828	AAT	2	6	7261	7266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901176
95	NC_021828	GAT	2	6	7269	7274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901176
96	NC_021828	GAA	2	6	7324	7329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901176
97	NC_021828	GTT	2	6	7418	7423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901177
98	NC_021828	GAA	2	6	7671	7676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901177
99	NC_021828	ATC	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901177
100	NC_021828	CTT	2	6	7812	7817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901178
101	NC_021828	TTC	2	6	7835	7840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901178
102	NC_021828	AAT	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901178
103	NC_021828	TTG	2	6	7987	7992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901178
104	NC_021828	TAC	2	6	8368	8373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901179
105	NC_021828	TAT	2	6	8451	8456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901179
106	NC_021828	CCT	2	6	8511	8516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525901179
107	NC_021828	GAA	2	6	8532	8537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901179
108	NC_021828	ATT	2	6	8538	8543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901179
109	NC_021828	GAA	2	6	8655	8660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901179
110	NC_021828	GTA	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901179
111	NC_021828	GTC	2	6	9022	9027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901179
112	NC_021828	CAA	2	6	9185	9190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525901179
113	NC_021828	AAG	2	6	9358	9363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901179
114	NC_021828	AGA	2	6	9506	9511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901179
115	NC_021828	GAA	2	6	9513	9518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901179
116	NC_021828	GAT	2	6	9534	9539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901179
117	NC_021828	AGG	2	6	9566	9571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525901179
118	NC_021828	ATG	2	6	9574	9579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901180
119	NC_021828	CAA	2	6	9712	9717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525901180
120	NC_021828	TTA	2	6	9847	9852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901180
121	NC_021828	GTG	2	6	9902	9907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525901180
122	NC_021828	GTT	2	6	9965	9970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901180
123	NC_021828	CGA	2	6	10077	10082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525901180
124	NC_021828	AAG	2	6	10106	10111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901180
125	NC_021828	AAG	2	6	10216	10221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901180
126	NC_021828	TCT	2	6	10469	10474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901155
127	NC_021828	TCT	2	6	10596	10601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901155
128	NC_021828	GAA	2	6	10846	10851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901155
129	NC_021828	AGA	2	6	10852	10857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901155
130	NC_021828	TCG	2	6	10864	10869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901155
131	NC_021828	GAA	2	6	10886	10891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901155
132	NC_021828	CTT	2	6	10960	10965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901155
133	NC_021828	TTC	2	6	11002	11007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901155
134	NC_021828	CAA	2	6	11075	11080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525901181
135	NC_021828	CTT	2	6	11122	11127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901181
136	NC_021828	ACA	2	6	11142	11147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525901181
137	NC_021828	AAT	2	6	11190	11195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901181
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142	NC_021828	ACT	2	6	11367	11372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901181
143	NC_021828	TAA	2	6	11529	11534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901181
144	NC_021828	TGA	2	6	11757	11762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901181
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147	NC_021828	ACT	2	6	12078	12083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901183
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151	NC_021828	TTC	2	6	12444	12449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901183
152	NC_021828	TGC	2	6	12922	12927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901183
153	NC_021828	TGC	2	6	12942	12947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901183
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158	NC_021828	GTA	2	6	13246	13251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901183
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163	NC_021828	TGC	2	6	13572	13577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901183
164	NC_021828	GCT	2	6	13674	13679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901183
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170	NC_021828	TAA	2	6	14604	14609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901185
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247	NC_021828	GGC	2	6	21161	21166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525901157
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249	NC_021828	GCC	2	6	21324	21329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525901157
250	NC_021828	CAT	2	6	21337	21342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901157
251	NC_021828	ACA	2	6	21351	21356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525901157
252	NC_021828	TGA	2	6	21357	21362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901157
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254	NC_021828	CCA	2	6	21567	21572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525901157
255	NC_021828	CAC	2	6	21577	21582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525901157
256	NC_021828	TGA	2	6	21606	21611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901157
257	NC_021828	GAA	2	6	21620	21625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901157
258	NC_021828	AAT	2	6	21629	21634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901157
259	NC_021828	GCT	2	6	21642	21647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901157
260	NC_021828	TTC	2	6	21677	21682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901157
261	NC_021828	CGA	2	6	21799	21804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525901157
262	NC_021828	ATT	2	6	21845	21850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901157
263	NC_021828	TAT	2	6	22021	22026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901157
264	NC_021828	CAT	2	6	22153	22158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901157
265	NC_021828	TTG	2	6	22167	22172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901157
266	NC_021828	TAT	2	6	22655	22660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901158
267	NC_021828	CAG	2	6	22805	22810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525901158
268	NC_021828	CTT	2	6	22820	22825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901158
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272	NC_021828	TCT	2	6	23513	23518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901159
273	NC_021828	TTC	2	6	23555	23560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901159
274	NC_021828	ATT	2	6	23728	23733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901159
275	NC_021828	TTA	2	6	23759	23764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901159
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281	NC_021828	ATC	2	6	24648	24653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901191
282	NC_021828	GTT	2	6	24705	24710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901191
283	NC_021828	TTC	2	6	24741	24746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901191
284	NC_021828	TAT	2	6	24782	24787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901191
285	NC_021828	GAA	2	6	24811	24816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901191
286	NC_021828	TTC	2	6	24831	24836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901191
287	NC_021828	GTT	2	6	24886	24891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901191
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294	NC_021828	GCT	2	6	25368	25373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901192
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321	NC_021828	CTA	2	6	27727	27732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901161
322	NC_021828	GTT	2	6	27778	27783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901161
323	NC_021828	CGA	2	6	27966	27971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525901161
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329	NC_021828	GCT	2	6	28514	28519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901161
330	NC_021828	TTC	2	6	28675	28680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901162
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332	NC_021828	CTT	2	6	28959	28964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901162
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350	NC_021828	GTA	2	6	30173	30178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901194
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360	NC_021828	AAT	2	6	32335	32340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901197
361	NC_021828	CTT	2	6	32400	32405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901197
362	NC_021828	GGT	2	6	32424	32429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525901197
363	NC_021828	TCA	2	6	32463	32468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901197
364	NC_021828	TTC	2	6	32500	32505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901197
365	NC_021828	GCT	2	6	32519	32524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901197
366	NC_021828	AGT	2	6	32531	32536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901197
367	NC_021828	TCC	2	6	32578	32583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525901198
368	NC_021828	CAA	2	6	32595	32600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525901198
369	NC_021828	CAT	2	6	32699	32704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901198
370	NC_021828	TAA	2	6	32714	32719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901198
371	NC_021828	CTT	2	6	32741	32746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901198
372	NC_021828	CTT	2	6	32801	32806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901198
373	NC_021828	CTT	2	6	32810	32815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901198
374	NC_021828	CTT	2	6	32831	32836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901198
375	NC_021828	TAT	2	6	33039	33044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901199
376	NC_021828	TCT	2	6	33088	33093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901199
377	NC_021828	AGC	2	6	33126	33131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525901199
378	NC_021828	AGC	2	6	33261	33266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525901199
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380	NC_021828	AAT	2	6	33394	33399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901200
381	NC_021828	GAT	2	6	33430	33435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901200
382	NC_021828	AAT	2	6	33454	33459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901200
383	NC_021828	GAT	2	6	33462	33467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901200
384	NC_021828	AGC	2	6	33631	33636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525901201
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409	NC_021828	TCT	2	6	35392	35397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901202
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