MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain R2-502 plasmid

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021828	AT	3	6	1680	1685	50 %	50 %	0 %	0 %	525901168
2	NC_021828	AC	3	6	2439	2444	50 %	0 %	0 %	50 %	525901170
3	NC_021828	TC	3	6	4213	4218	0 %	50 %	0 %	50 %	525901173
4	NC_021828	TA	3	6	4356	4361	50 %	50 %	0 %	0 %	525901173
5	NC_021828	CT	3	6	4376	4381	0 %	50 %	0 %	50 %	525901173
6	NC_021828	GT	3	6	4388	4393	0 %	50 %	50 %	0 %	525901173
7	NC_021828	TC	3	6	4410	4415	0 %	50 %	0 %	50 %	525901173
8	NC_021828	AT	3	6	5198	5203	50 %	50 %	0 %	0 %	525901173
9	NC_021828	AT	3	6	5303	5308	50 %	50 %	0 %	0 %	525901173
10	NC_021828	TG	3	6	5511	5516	0 %	50 %	50 %	0 %	525901174
11	NC_021828	TG	3	6	5644	5649	0 %	50 %	50 %	0 %	525901174
12	NC_021828	CG	3	6	6006	6011	0 %	0 %	50 %	50 %	525901175
13	NC_021828	TC	3	6	7216	7221	0 %	50 %	0 %	50 %	525901176
14	NC_021828	TC	4	8	7879	7886	0 %	50 %	0 %	50 %	525901178
15	NC_021828	AG	4	8	8490	8497	50 %	0 %	50 %	0 %	525901179
16	NC_021828	CA	3	6	8954	8959	50 %	0 %	0 %	50 %	525901179
17	NC_021828	AT	3	6	9135	9140	50 %	50 %	0 %	0 %	525901179
18	NC_021828	AT	3	6	9347	9352	50 %	50 %	0 %	0 %	525901179
19	NC_021828	CT	3	6	12193	12198	0 %	50 %	0 %	50 %	525901183
20	NC_021828	AC	3	6	12587	12592	50 %	0 %	0 %	50 %	525901183
21	NC_021828	TA	3	6	14467	14472	50 %	50 %	0 %	0 %	525901185
22	NC_021828	TC	3	6	14847	14852	0 %	50 %	0 %	50 %	525901185
23	NC_021828	AT	3	6	15158	15163	50 %	50 %	0 %	0 %	525901185
24	NC_021828	TC	3	6	17084	17089	0 %	50 %	0 %	50 %	525901187
25	NC_021828	AT	3	6	17576	17581	50 %	50 %	0 %	0 %	525901188
26	NC_021828	CT	3	6	17935	17940	0 %	50 %	0 %	50 %	525901188
27	NC_021828	TA	3	6	17999	18004	50 %	50 %	0 %	0 %	525901188
28	NC_021828	TA	3	6	18221	18226	50 %	50 %	0 %	0 %	525901188
29	NC_021828	AT	3	6	18766	18771	50 %	50 %	0 %	0 %	525901189
30	NC_021828	TA	3	6	19193	19198	50 %	50 %	0 %	0 %	525901189
31	NC_021828	AT	3	6	19559	19564	50 %	50 %	0 %	0 %	525901189
32	NC_021828	TA	3	6	19580	19585	50 %	50 %	0 %	0 %	525901189
33	NC_021828	TC	3	6	19737	19742	0 %	50 %	0 %	50 %	525901189
34	NC_021828	TA	3	6	21299	21304	50 %	50 %	0 %	0 %	525901157
35	NC_021828	CG	3	6	22847	22852	0 %	0 %	50 %	50 %	525901158
36	NC_021828	TA	3	6	24354	24359	50 %	50 %	0 %	0 %	525901191
37	NC_021828	CT	3	6	25384	25389	0 %	50 %	0 %	50 %	525901192
38	NC_021828	AT	3	6	25765	25770	50 %	50 %	0 %	0 %	525901192
39	NC_021828	GC	3	6	25952	25957	0 %	0 %	50 %	50 %	525901192
40	NC_021828	AT	3	6	26037	26042	50 %	50 %	0 %	0 %	525901192
41	NC_021828	TC	3	6	29266	29271	0 %	50 %	0 %	50 %	525901162
42	NC_021828	AT	3	6	30163	30168	50 %	50 %	0 %	0 %	525901194
43	NC_021828	TA	3	6	30511	30516	50 %	50 %	0 %	0 %	525901195
44	NC_021828	TC	3	6	30519	30524	0 %	50 %	0 %	50 %	525901195
45	NC_021828	TC	4	8	31094	31101	0 %	50 %	0 %	50 %	525901196
46	NC_021828	CA	3	6	31786	31791	50 %	0 %	0 %	50 %	525901163
47	NC_021828	GC	3	6	32109	32114	0 %	0 %	50 %	50 %	525901197
48	NC_021828	TA	3	6	32302	32307	50 %	50 %	0 %	0 %	525901197
49	NC_021828	GA	3	6	33900	33905	50 %	0 %	50 %	0 %	525901201
50	NC_021828	TC	3	6	34885	34890	0 %	50 %	0 %	50 %	525901202
51	NC_021828	AC	3	6	35093	35098	50 %	0 %	0 %	50 %	525901202
52	NC_021828	AG	3	6	35855	35860	50 %	0 %	50 %	0 %	525901202
53	NC_021828	AC	3	6	37734	37739	50 %	0 %	0 %	50 %	525901204
54	NC_021828	AC	3	6	37800	37805	50 %	0 %	0 %	50 %	525901204
55	NC_021828	TA	3	6	38040	38045	50 %	50 %	0 %	0 %	525901204
56	NC_021828	AG	3	6	38104	38109	50 %	0 %	50 %	0 %	525901204
57	NC_021828	GA	3	6	39589	39594	50 %	0 %	50 %	0 %	525901204
58	NC_021828	AG	3	6	40356	40361	50 %	0 %	50 %	0 %	525901204
59	NC_021828	AT	3	6	40663	40668	50 %	50 %	0 %	0 %	525901205
60	NC_021828	TA	4	8	40932	40939	50 %	50 %	0 %	0 %	525901205
61	NC_021828	AG	3	6	42728	42733	50 %	0 %	50 %	0 %	525901206
62	NC_021828	TG	3	6	43188	43193	0 %	50 %	50 %	0 %	525901206
63	NC_021828	AT	3	6	45298	45303	50 %	50 %	0 %	0 %	525901207
64	NC_021828	AT	3	6	45331	45336	50 %	50 %	0 %	0 %	525901207
65	NC_021828	AT	3	6	45446	45451	50 %	50 %	0 %	0 %	525901207
66	NC_021828	TA	3	6	46011	46016	50 %	50 %	0 %	0 %	525901208
67	NC_021828	GA	3	6	46045	46050	50 %	0 %	50 %	0 %	525901208
68	NC_021828	AT	4	8	46480	46487	50 %	50 %	0 %	0 %	525901208
69	NC_021828	TA	3	6	47397	47402	50 %	50 %	0 %	0 %	525901208
70	NC_021828	AT	3	6	47440	47445	50 %	50 %	0 %	0 %	525901208
71	NC_021828	TG	3	6	47488	47493	0 %	50 %	50 %	0 %	525901208
72	NC_021828	TA	3	6	47589	47594	50 %	50 %	0 %	0 %	525901208
73	NC_021828	AT	3	6	47609	47614	50 %	50 %	0 %	0 %	525901208
74	NC_021828	TA	3	6	47763	47768	50 %	50 %	0 %	0 %	525901208
75	NC_021828	TA	3	6	48677	48682	50 %	50 %	0 %	0 %	525901209
76	NC_021828	AT	3	6	48823	48828	50 %	50 %	0 %	0 %	525901209
77	NC_021828	CT	4	8	49064	49071	0 %	50 %	0 %	50 %	525901166
78	NC_021828	CT	3	6	50209	50214	0 %	50 %	0 %	50 %	525901166
79	NC_021828	TC	3	6	51641	51646	0 %	50 %	0 %	50 %	525901210
80	NC_021828	CT	3	6	52504	52509	0 %	50 %	0 %	50 %	525901211
81	NC_021828	AT	3	6	52623	52628	50 %	50 %	0 %	0 %	525901211
82	NC_021828	AT	3	6	53387	53392	50 %	50 %	0 %	0 %	525901167
83	NC_021828	TG	3	6	54747	54752	0 %	50 %	50 %	0 %	525901212
84	NC_021828	AT	3	6	56414	56419	50 %	50 %	0 %	0 %	525901214
85	NC_021828	TA	3	6	56708	56713	50 %	50 %	0 %	0 %	525901214
86	NC_021828	CT	3	6	56735	56740	0 %	50 %	0 %	50 %	525901214
87	NC_021828	TC	4	8	57116	57123	0 %	50 %	0 %	50 %	525901215

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.