MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain R2-502 plasmid

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021828	A	7	7	214	220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021828	T	6	6	616	621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021828	A	6	6	823	828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021828	T	7	7	1278	1284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021828	T	6	6	1286	1291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021828	A	7	7	1441	1447	100 %	0 %	0 %	0 %	525901168
7	NC_021828	T	6	6	1804	1809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021828	A	7	7	1925	1931	100 %	0 %	0 %	0 %	525901169
9	NC_021828	A	6	6	2218	2223	100 %	0 %	0 %	0 %	525901169
10	NC_021828	C	7	7	2227	2233	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_021828	T	6	6	2279	2284	0 %	100 %	0 %	0 %	525901170
12	NC_021828	T	6	6	2381	2386	0 %	100 %	0 %	0 %	525901170
13	NC_021828	T	6	6	2492	2497	0 %	100 %	0 %	0 %	525901170
14	NC_021828	C	6	6	2627	2632	0 %	0 %	0 %	100 %	525901170
15	NC_021828	A	8	8	2818	2825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021828	A	7	7	2869	2875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021828	T	6	6	2925	2930	0 %	100 %	0 %	0 %	525901171
18	NC_021828	T	6	6	4046	4051	0 %	100 %	0 %	0 %	525901172
19	NC_021828	T	7	7	4318	4324	0 %	100 %	0 %	0 %	525901173
20	NC_021828	T	6	6	4526	4531	0 %	100 %	0 %	0 %	525901173
21	NC_021828	T	6	6	4986	4991	0 %	100 %	0 %	0 %	525901173
22	NC_021828	T	6	6	5116	5121	0 %	100 %	0 %	0 %	525901173
23	NC_021828	T	6	6	5172	5177	0 %	100 %	0 %	0 %	525901173
24	NC_021828	T	6	6	5203	5208	0 %	100 %	0 %	0 %	525901173
25	NC_021828	T	6	6	5438	5443	0 %	100 %	0 %	0 %	525901174
26	NC_021828	T	6	6	5614	5619	0 %	100 %	0 %	0 %	525901174
27	NC_021828	T	6	6	5916	5921	0 %	100 %	0 %	0 %	525901175
28	NC_021828	T	7	7	6017	6023	0 %	100 %	0 %	0 %	525901175
29	NC_021828	A	6	6	6184	6189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021828	T	8	8	6707	6714	0 %	100 %	0 %	0 %	525901176
31	NC_021828	T	6	6	6791	6796	0 %	100 %	0 %	0 %	525901176
32	NC_021828	T	6	6	6833	6838	0 %	100 %	0 %	0 %	525901176
33	NC_021828	T	6	6	6871	6876	0 %	100 %	0 %	0 %	525901176
34	NC_021828	T	6	6	6961	6966	0 %	100 %	0 %	0 %	525901176
35	NC_021828	T	7	7	7348	7354	0 %	100 %	0 %	0 %	525901176
36	NC_021828	T	6	6	7378	7383	0 %	100 %	0 %	0 %	525901176
37	NC_021828	A	6	6	7499	7504	100 %	0 %	0 %	0 %	525901177
38	NC_021828	A	6	6	7555	7560	100 %	0 %	0 %	0 %	525901177
39	NC_021828	A	6	6	7753	7758	100 %	0 %	0 %	0 %	525901177
40	NC_021828	A	7	7	7766	7772	100 %	0 %	0 %	0 %	525901177
41	NC_021828	T	7	7	7779	7785	0 %	100 %	0 %	0 %	525901177
42	NC_021828	T	7	7	7867	7873	0 %	100 %	0 %	0 %	525901178
43	NC_021828	A	6	6	7920	7925	100 %	0 %	0 %	0 %	525901178
44	NC_021828	A	6	6	8598	8603	100 %	0 %	0 %	0 %	525901179
45	NC_021828	A	6	6	9733	9738	100 %	0 %	0 %	0 %	525901180
46	NC_021828	A	7	7	9746	9752	100 %	0 %	0 %	0 %	525901180
47	NC_021828	A	6	6	9825	9830	100 %	0 %	0 %	0 %	525901180
48	NC_021828	A	7	7	10044	10050	100 %	0 %	0 %	0 %	525901180
49	NC_021828	A	7	7	10558	10564	100 %	0 %	0 %	0 %	525901155
50	NC_021828	T	6	6	11020	11025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021828	A	6	6	11093	11098	100 %	0 %	0 %	0 %	525901181
52	NC_021828	T	6	6	11777	11782	0 %	100 %	0 %	0 %	525901181
53	NC_021828	T	8	8	11788	11795	0 %	100 %	0 %	0 %	525901181
54	NC_021828	T	8	8	12288	12295	0 %	100 %	0 %	0 %	525901183
55	NC_021828	T	6	6	12414	12419	0 %	100 %	0 %	0 %	525901183
56	NC_021828	T	6	6	12570	12575	0 %	100 %	0 %	0 %	525901183
57	NC_021828	A	6	6	13754	13759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021828	T	7	7	13919	13925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021828	T	6	6	14023	14028	0 %	100 %	0 %	0 %	525901184
60	NC_021828	T	11	11	14059	14069	0 %	100 %	0 %	0 %	525901184
61	NC_021828	T	7	7	14216	14222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021828	T	6	6	14341	14346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021828	A	6	6	14482	14487	100 %	0 %	0 %	0 %	525901185
64	NC_021828	A	6	6	14608	14613	100 %	0 %	0 %	0 %	525901185
65	NC_021828	T	6	6	14802	14807	0 %	100 %	0 %	0 %	525901185
66	NC_021828	A	7	7	15097	15103	100 %	0 %	0 %	0 %	525901185
67	NC_021828	A	6	6	15116	15121	100 %	0 %	0 %	0 %	525901185
68	NC_021828	T	6	6	15344	15349	0 %	100 %	0 %	0 %	525901185
69	NC_021828	A	8	8	15495	15502	100 %	0 %	0 %	0 %	525901186
70	NC_021828	T	7	7	16052	16058	0 %	100 %	0 %	0 %	525901156
71	NC_021828	T	6	6	16331	16336	0 %	100 %	0 %	0 %	525901156
72	NC_021828	T	6	6	16607	16612	0 %	100 %	0 %	0 %	525901156
73	NC_021828	T	6	6	16639	16644	0 %	100 %	0 %	0 %	525901156
74	NC_021828	A	6	6	16907	16912	100 %	0 %	0 %	0 %	525901156
75	NC_021828	A	6	6	16957	16962	100 %	0 %	0 %	0 %	525901156
76	NC_021828	A	6	6	17508	17513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021828	T	6	6	17591	17596	0 %	100 %	0 %	0 %	525901188
78	NC_021828	T	6	6	18106	18111	0 %	100 %	0 %	0 %	525901188
79	NC_021828	T	7	7	18398	18404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021828	A	6	6	18413	18418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021828	A	6	6	18463	18468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021828	T	6	6	18520	18525	0 %	100 %	0 %	0 %	525901189
83	NC_021828	T	6	6	18528	18533	0 %	100 %	0 %	0 %	525901189
84	NC_021828	T	7	7	19103	19109	0 %	100 %	0 %	0 %	525901189
85	NC_021828	T	6	6	19384	19389	0 %	100 %	0 %	0 %	525901189
86	NC_021828	T	7	7	19425	19431	0 %	100 %	0 %	0 %	525901189
87	NC_021828	T	6	6	19587	19592	0 %	100 %	0 %	0 %	525901189
88	NC_021828	T	8	8	19872	19879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021828	A	6	6	20011	20016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021828	T	6	6	20294	20299	0 %	100 %	0 %	0 %	525901157
91	NC_021828	T	6	6	20308	20313	0 %	100 %	0 %	0 %	525901157
92	NC_021828	T	6	6	21067	21072	0 %	100 %	0 %	0 %	525901157
93	NC_021828	T	6	6	21094	21099	0 %	100 %	0 %	0 %	525901157
94	NC_021828	T	6	6	21185	21190	0 %	100 %	0 %	0 %	525901157
95	NC_021828	T	6	6	21977	21982	0 %	100 %	0 %	0 %	525901157
96	NC_021828	A	6	6	22173	22178	100 %	0 %	0 %	0 %	525901157
97	NC_021828	A	6	6	22514	22519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021828	A	7	7	22693	22699	100 %	0 %	0 %	0 %	525901158
99	NC_021828	T	8	8	23081	23088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021828	T	7	7	23478	23484	0 %	100 %	0 %	0 %	525901159
101	NC_021828	T	6	6	23583	23588	0 %	100 %	0 %	0 %	525901159
102	NC_021828	A	6	6	23768	23773	100 %	0 %	0 %	0 %	525901159
103	NC_021828	T	8	8	23935	23942	0 %	100 %	0 %	0 %	525901159
104	NC_021828	A	7	7	24164	24170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_021828	T	6	6	25315	25320	0 %	100 %	0 %	0 %	525901192
107	NC_021828	A	7	7	26488	26494	100 %	0 %	0 %	0 %	525901192
108	NC_021828	A	6	6	26665	26670	100 %	0 %	0 %	0 %	525901192
109	NC_021828	T	7	7	26687	26693	0 %	100 %	0 %	0 %	525901192
110	NC_021828	A	7	7	27563	27569	100 %	0 %	0 %	0 %	525901160
111	NC_021828	A	7	7	27605	27611	100 %	0 %	0 %	0 %	525901160
112	NC_021828	T	6	6	28622	28627	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
113	NC_021828	T	7	7	28648	28654	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
114	NC_021828	T	6	6	28685	28690	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
115	NC_021828	T	6	6	28771	28776	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
116	NC_021828	T	7	7	28830	28836	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
117	NC_021828	T	6	6	28863	28868	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
118	NC_021828	T	7	7	28885	28891	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
119	NC_021828	T	7	7	29134	29140	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
120	NC_021828	T	7	7	29278	29284	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
121	NC_021828	A	7	7	29418	29424	100 %	0 %	0 %	0 %	525901193
122	NC_021828	T	8	8	29464	29471	0 %	100 %	0 %	0 %	525901193
123	NC_021828	T	7	7	29596	29602	0 %	100 %	0 %	0 %	525901193
124	NC_021828	A	6	6	29666	29671	100 %	0 %	0 %	0 %	525901193
125	NC_021828	T	7	7	29722	29728	0 %	100 %	0 %	0 %	525901193
126	NC_021828	T	6	6	29836	29841	0 %	100 %	0 %	0 %	525901193
127	NC_021828	T	6	6	30212	30217	0 %	100 %	0 %	0 %	525901194
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130	NC_021828	T	7	7	31133	31139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021828	T	7	7	31228	31234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021828	A	9	9	31337	31345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021828	A	6	6	31791	31796	100 %	0 %	0 %	0 %	525901163
134	NC_021828	T	7	7	32536	32542	0 %	100 %	0 %	0 %	525901197
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137	NC_021828	A	6	6	33271	33276	100 %	0 %	0 %	0 %	525901199
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143	NC_021828	T	6	6	36808	36813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.