MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 2177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021827	AATTA	2	10	535	544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021827	CTATT	2	10	2420	2429	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021827	AAGAA	2	10	6068	6077	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021827	GCCAT	2	10	8054	8063	20 %	20 %	20 %	40 %	525896804
5	NC_021827	ACAGT	2	10	8852	8861	40 %	20 %	20 %	20 %	525896805
6	NC_021827	TGTTT	2	10	10711	10720	0 %	80 %	20 %	0 %	525896806
7	NC_021827	AAGTA	2	10	11586	11595	60 %	20 %	20 %	0 %	525899282
8	NC_021827	CGGCT	2	10	14047	14056	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_021827	CTTTT	2	10	14245	14254	0 %	80 %	0 %	20 %	525896808
10	NC_021827	ATTTT	2	10	16825	16834	20 %	80 %	0 %	0 %	525896811
11	NC_021827	TGTAA	2	10	17025	17034	40 %	40 %	20 %	0 %	525896811
12	NC_021827	TTTTC	2	10	19400	19409	0 %	80 %	0 %	20 %	525896811
13	NC_021827	TTCTA	2	10	19554	19563	20 %	60 %	0 %	20 %	525896811
14	NC_021827	ACTCA	2	10	19860	19869	40 %	20 %	0 %	40 %	525896811
15	NC_021827	TAATC	2	10	20507	20516	40 %	40 %	0 %	20 %	525896812
16	NC_021827	ATTTT	2	10	20938	20947	20 %	80 %	0 %	0 %	525896813
17	NC_021827	CACTC	2	10	22224	22233	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_021827	TCTTT	2	10	24834	24843	0 %	80 %	0 %	20 %	525896818
19	NC_021827	TTAAA	2	10	25455	25464	60 %	40 %	0 %	0 %	525899283
20	NC_021827	CTGTT	2	10	28818	28827	0 %	60 %	20 %	20 %	525896820
21	NC_021827	TTTTC	2	10	28828	28837	0 %	80 %	0 %	20 %	525896820
22	NC_021827	AATAA	2	10	29052	29061	80 %	20 %	0 %	0 %	525896820
23	NC_021827	TTATA	2	10	30353	30362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021827	AATCC	2	10	31917	31926	40 %	20 %	0 %	40 %	525896821
25	NC_021827	AAATT	2	10	32016	32025	60 %	40 %	0 %	0 %	525896821
26	NC_021827	TTTTA	2	10	32411	32420	20 %	80 %	0 %	0 %	525896822
27	NC_021827	AACCA	2	10	32606	32615	60 %	0 %	0 %	40 %	525896822
28	NC_021827	ATTAA	2	10	34297	34306	60 %	40 %	0 %	0 %	525896823
29	NC_021827	AAATG	2	10	35635	35644	60 %	20 %	20 %	0 %	525896825
30	NC_021827	ACTTT	2	10	35772	35781	20 %	60 %	0 %	20 %	525896825
31	NC_021827	TTTTG	2	10	38099	38108	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021827	GACAA	2	10	38465	38474	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021827	CAAAT	2	10	42925	42934	60 %	20 %	0 %	20 %	525896832
34	NC_021827	TAAAT	2	10	43751	43760	60 %	40 %	0 %	0 %	525896833
35	NC_021827	TCTAT	2	10	43989	43998	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021827	CGTCC	2	10	45876	45885	0 %	20 %	20 %	60 %	525896836
37	NC_021827	TTTTC	2	10	46589	46598	0 %	80 %	0 %	20 %	525896837
38	NC_021827	TTTTA	2	10	47541	47550	20 %	80 %	0 %	0 %	525896838
39	NC_021827	ATTTC	2	10	47597	47606	20 %	60 %	0 %	20 %	525896838
40	NC_021827	TTGAT	2	10	48409	48418	20 %	60 %	20 %	0 %	525896839
41	NC_021827	AACGC	2	10	50848	50857	40 %	0 %	20 %	40 %	525896840
42	NC_021827	ATGTA	2	10	51472	51481	40 %	40 %	20 %	0 %	525896840
43	NC_021827	AACTG	2	10	52220	52229	40 %	20 %	20 %	20 %	525896840
44	NC_021827	TTCCA	2	10	52705	52714	20 %	40 %	0 %	40 %	525896841
45	NC_021827	AAACA	2	10	54190	54199	80 %	0 %	0 %	20 %	525896841
46	NC_021827	TCACT	2	10	54943	54952	20 %	40 %	0 %	40 %	525896841
47	NC_021827	TTGTT	2	10	55763	55772	0 %	80 %	20 %	0 %	525896842
48	NC_021827	AAGTA	2	10	57526	57535	60 %	20 %	20 %	0 %	525896843
49	NC_021827	TTTCA	2	10	60554	60563	20 %	60 %	0 %	20 %	525896846
50	NC_021827	TCATT	2	10	61558	61567	20 %	60 %	0 %	20 %	525896846
51	NC_021827	TTTTC	2	10	62325	62334	0 %	80 %	0 %	20 %	525896847
52	NC_021827	AAAGT	2	10	63758	63767	60 %	20 %	20 %	0 %	525896848
53	NC_021827	TACAA	2	10	64666	64675	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021827	TTTAT	2	10	64762	64771	20 %	80 %	0 %	0 %	525896849
55	NC_021827	ATTTT	2	10	67390	67399	20 %	80 %	0 %	0 %	525896852
56	NC_021827	AATTC	2	10	70446	70455	40 %	40 %	0 %	20 %	525896856
57	NC_021827	ATCTT	2	10	70817	70826	20 %	60 %	0 %	20 %	525896857
58	NC_021827	ATTCC	2	10	71238	71247	20 %	40 %	0 %	40 %	525896857
59	NC_021827	TGTTT	2	10	73758	73767	0 %	80 %	20 %	0 %	525896859
60	NC_021827	TTAGA	2	10	74370	74379	40 %	40 %	20 %	0 %	525896859
61	NC_021827	TTGGC	2	10	76466	76475	0 %	40 %	40 %	20 %	525896860
62	NC_021827	CATAT	2	10	76779	76788	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021827	TTCTA	2	10	77862	77871	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021827	CATCT	2	10	79446	79455	20 %	40 %	0 %	40 %	525896862
65	NC_021827	AGTAA	2	10	79494	79503	60 %	20 %	20 %	0 %	525896862
66	NC_021827	TCTAT	2	10	80690	80699	20 %	60 %	0 %	20 %	525896863
67	NC_021827	TAATA	2	10	81379	81388	60 %	40 %	0 %	0 %	525896864
68	NC_021827	TTATT	2	10	82653	82662	20 %	80 %	0 %	0 %	525896865
69	NC_021827	CGTTT	2	10	82776	82785	0 %	60 %	20 %	20 %	525896865
70	NC_021827	CTTAT	2	10	83758	83767	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021827	AAATT	2	10	83926	83935	60 %	40 %	0 %	0 %	525896866
72	NC_021827	ATTAA	2	10	84111	84120	60 %	40 %	0 %	0 %	525896866
73	NC_021827	GCCGT	2	10	84184	84193	0 %	20 %	40 %	40 %	525896866
74	NC_021827	CGGAT	2	10	84805	84814	20 %	20 %	40 %	20 %	525896866
75	NC_021827	TTTTA	2	10	86412	86421	20 %	80 %	0 %	0 %	525899288
76	NC_021827	CGTTA	2	10	87789	87798	20 %	40 %	20 %	20 %	525899291
77	NC_021827	CTTCT	2	10	88325	88334	0 %	60 %	0 %	40 %	525899292
78	NC_021827	TCATA	2	10	89638	89647	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_021827	CCAAA	2	10	92478	92487	60 %	0 %	0 %	40 %	525896870
80	NC_021827	ACCAA	2	10	92616	92625	60 %	0 %	0 %	40 %	525896870
81	NC_021827	TGTGG	2	10	93071	93080	0 %	40 %	60 %	0 %	525896871
82	NC_021827	TCAAG	2	10	93411	93420	40 %	20 %	20 %	20 %	525896871
83	NC_021827	TGTTT	2	10	94203	94212	0 %	80 %	20 %	0 %	525896871
84	NC_021827	TAAGT	2	10	94307	94316	40 %	40 %	20 %	0 %	525896871
85	NC_021827	ATTTT	2	10	95617	95626	20 %	80 %	0 %	0 %	525896874
86	NC_021827	ACGTT	2	10	96301	96310	20 %	40 %	20 %	20 %	525896874
87	NC_021827	AAATA	2	10	97115	97124	80 %	20 %	0 %	0 %	525896874
88	NC_021827	AACAA	2	10	98921	98930	80 %	0 %	0 %	20 %	525896876
89	NC_021827	AAATT	2	10	101287	101296	60 %	40 %	0 %	0 %	525896878
90	NC_021827	TTACA	2	10	101669	101678	40 %	40 %	0 %	20 %	525896879
91	NC_021827	AGACT	2	10	102749	102758	40 %	20 %	20 %	20 %	525896881
92	NC_021827	CACTT	2	10	103029	103038	20 %	40 %	0 %	40 %	525896881
93	NC_021827	ATAAA	2	10	105051	105060	80 %	20 %	0 %	0 %	525899296
94	NC_021827	CATCT	2	10	107327	107336	20 %	40 %	0 %	40 %	525899297
95	NC_021827	GTTCA	2	10	107369	107378	20 %	40 %	20 %	20 %	525899297
96	NC_021827	AACTA	2	10	108050	108059	60 %	20 %	0 %	20 %	525896883
97	NC_021827	ACTTT	2	10	109173	109182	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_021827	CTTTT	2	10	110211	110220	0 %	80 %	0 %	20 %	525896886
99	NC_021827	AAATA	2	10	110477	110486	80 %	20 %	0 %	0 %	525896887
100	NC_021827	AGTAA	2	10	111414	111423	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021827	TGGAA	2	10	111678	111687	40 %	20 %	40 %	0 %	525896889
102	NC_021827	TCGAG	2	10	112012	112021	20 %	20 %	40 %	20 %	525896889
103	NC_021827	TCTCT	2	10	112853	112862	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_021827	GTAAA	2	10	113362	113371	60 %	20 %	20 %	0 %	525896891
105	NC_021827	AATTC	2	10	117567	117576	40 %	40 %	0 %	20 %	525896894
106	NC_021827	TATAA	2	10	118006	118015	60 %	40 %	0 %	0 %	525896894
107	NC_021827	ATTTC	2	10	118208	118217	20 %	60 %	0 %	20 %	525896894
108	NC_021827	ACCGT	2	10	119447	119456	20 %	20 %	20 %	40 %	525896895
109	NC_021827	CTTTT	2	10	120991	121000	0 %	80 %	0 %	20 %	525896896
110	NC_021827	GTTGT	2	10	123384	123393	0 %	60 %	40 %	0 %	525896899
111	NC_021827	TATGA	2	10	123676	123685	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021827	AACAA	2	10	125386	125395	80 %	0 %	0 %	20 %	525899299
113	NC_021827	TTGTT	2	10	126546	126555	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021827	ATTCT	2	10	127557	127566	20 %	60 %	0 %	20 %	525896903
115	NC_021827	TGTAA	2	10	130805	130814	40 %	40 %	20 %	0 %	525896907
116	NC_021827	TCCGC	2	10	131089	131098	0 %	20 %	20 %	60 %	525896908
117	NC_021827	AGCCA	2	10	132539	132548	40 %	0 %	20 %	40 %	525896909
118	NC_021827	AAAAC	2	10	132690	132699	80 %	0 %	0 %	20 %	525896909
119	NC_021827	AGTAA	2	10	134288	134297	60 %	20 %	20 %	0 %	525896911
120	NC_021827	ATGCA	2	10	134534	134543	40 %	20 %	20 %	20 %	525896911
121	NC_021827	CTTTT	2	10	138194	138203	0 %	80 %	0 %	20 %	525896914
122	NC_021827	TTTCG	2	10	138507	138516	0 %	60 %	20 %	20 %	525896914
123	NC_021827	TTTCC	2	10	139823	139832	0 %	60 %	0 %	40 %	525896915
124	NC_021827	CCGCT	2	10	141002	141011	0 %	20 %	20 %	60 %	525896915
125	NC_021827	ATTTA	2	10	141582	141591	40 %	60 %	0 %	0 %	525896915
126	NC_021827	ATTTC	2	10	141929	141938	20 %	60 %	0 %	20 %	525896915
127	NC_021827	TTTTC	2	10	142172	142181	0 %	80 %	0 %	20 %	525896915
128	NC_021827	TTTAG	2	10	143515	143524	20 %	60 %	20 %	0 %	525896915
129	NC_021827	ATTTT	2	10	144977	144986	20 %	80 %	0 %	0 %	525899300
130	NC_021827	AATAA	2	10	145624	145633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021827	AGAAA	2	10	145876	145885	80 %	0 %	20 %	0 %	525899301
132	NC_021827	TCAAA	2	10	148962	148971	60 %	20 %	0 %	20 %	525899305
133	NC_021827	CAGCG	2	10	150939	150948	20 %	0 %	40 %	40 %	525896917
134	NC_021827	AGTTT	2	10	152984	152993	20 %	60 %	20 %	0 %	525896919
135	NC_021827	CAAGC	2	10	152994	153003	40 %	0 %	20 %	40 %	525896919
136	NC_021827	CATCC	2	10	153687	153696	20 %	20 %	0 %	60 %	525896920
137	NC_021827	GTGGG	2	10	154280	154289	0 %	20 %	80 %	0 %	525896920
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139	NC_021827	TTTTA	2	10	155182	155191	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_021827	GGTTT	2	10	306369	306378	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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