MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 1182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021827	CAGG	2	8	327	334	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021827	GTTC	2	8	393	400	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021827	GTTT	2	8	548	555	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021827	GTTT	2	8	763	770	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021827	ATTT	2	8	6119	6126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021827	CTAT	2	8	7111	7118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021827	TAAT	2	8	7139	7146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021827	CTAT	2	8	11383	11390	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021827	TGTT	2	8	11414	11421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021827	AATT	2	8	11422	11429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021827	CCTT	2	8	13386	13393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021827	AATT	2	8	13467	13474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021827	TCCC	2	8	14455	14462	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_021827	ATTC	2	8	20166	20173	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021827	CAAA	2	8	21555	21562	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021827	TTAT	2	8	21579	21586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021827	CTCC	2	8	28474	28481	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_021827	AAGT	2	8	30226	30233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021827	TGCT	2	8	32247	32254	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021827	TAAA	2	8	33407	33414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021827	CTTT	2	8	33502	33509	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021827	ATGA	2	8	36766	36773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021827	ATTA	2	8	37009	37016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021827	AGCA	2	8	37959	37966	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021827	AATT	2	8	38381	38388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021827	ATTC	2	8	41220	41227	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021827	GAAA	2	8	44004	44011	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021827	TAGC	2	8	44019	44026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021827	ACTT	2	8	60038	60045	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021827	TAAG	2	8	60058	60065	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021827	AATT	2	8	74421	74428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021827	TTAA	2	8	76897	76904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021827	TAAA	2	8	86936	86943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021827	GGGA	2	8	88047	88054	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021827	ATTT	2	8	89156	89163	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021827	TTTC	2	8	89231	89238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021827	CTGC	2	8	89395	89402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021827	CGTT	2	8	89476	89483	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021827	TTGT	2	8	89789	89796	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021827	ATTC	2	8	89849	89856	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021827	ATCA	2	8	89891	89898	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021827	TGTA	2	8	90163	90170	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021827	CGCA	2	8	90921	90928	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021827	TCCA	2	8	95542	95549	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021827	TTGG	2	8	97128	97135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021827	ACCA	2	8	97164	97171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021827	ATTT	2	8	110315	110322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021827	CTAT	2	8	111257	111264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021827	AAGT	2	8	111306	111313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021827	AAAC	2	8	112905	112912	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021827	CTTC	2	8	114066	114073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021827	ATTC	2	8	122022	122029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021827	AAAG	2	8	122063	122070	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021827	ACTT	2	8	124049	124056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021827	ATTT	2	8	129399	129406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021827	TATT	2	8	129419	129426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021827	TTCC	2	8	145592	145599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021827	AAAT	2	8	145674	145681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021827	GGTT	2	8	147616	147623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021827	TTCT	2	8	148093	148100	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021827	GTGC	2	8	148269	148276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021827	ATAA	2	8	150496	150503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021827	GTTT	2	8	150590	150597	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021827	CATT	2	8	151752	151759	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021827	ATGT	2	8	154423	154430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021827	AAAT	2	8	159881	159888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021827	CTTT	2	8	160085	160092	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021827	TTGA	2	8	161376	161383	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021827	CGCT	2	8	161529	161536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021827	CTTT	2	8	164452	164459	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021827	TGTA	2	8	175356	175363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021827	ATTT	2	8	175970	175977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021827	TAAC	2	8	181399	181406	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021827	TAAG	2	8	184584	184591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021827	AATA	2	8	185310	185317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021827	CTTC	2	8	185325	185332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021827	TGAA	2	8	186278	186285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021827	CTAA	2	8	186737	186744	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021827	CTAA	2	8	188103	188110	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021827	CACT	2	8	188836	188843	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021827	TTAT	2	8	188914	188921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021827	ATTT	2	8	195476	195483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021827	AAGG	2	8	202777	202784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021827	TTCC	2	8	211181	211188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021827	ATTT	2	8	211360	211367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021827	AGCA	2	8	218685	218692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021827	CTTT	2	8	236339	236346	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021827	TAAT	3	12	240530	240541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021827	AAAT	2	8	242518	242525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021827	TTGT	2	8	254344	254351	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021827	TATT	3	12	254354	254365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021827	CGGA	2	8	264476	264483	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021827	TTAC	2	8	270618	270625	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021827	GTAT	2	8	271182	271189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021827	ATTT	2	8	272922	272929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021827	GTAA	2	8	273154	273161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021827	TTTA	2	8	279970	279977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021827	TTAA	2	8	294578	294585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021827	AGCA	2	8	295372	295379	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021827	ATAG	2	8	304970	304977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021827	TCTA	2	8	304998	305005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021827	AGGA	2	8	305124	305131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021827	GGTT	2	8	307242	307249	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021827	ATTT	2	8	307343	307350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021827	CTTC	2	8	309323	309330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021827	AATT	2	8	311057	311064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021827	ATTT	2	8	313092	313099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021827	AAAG	2	8	313105	313112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021827	AGAA	2	8	314786	314793	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021827	GGTG	2	8	317423	317430	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021827	TTTG	2	8	317435	317442	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021827	AAAT	2	8	319512	319519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021827	TTAT	2	8	320804	320811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021827	AATA	2	8	320981	320988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021827	TTCA	2	8	325890	325897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021827	ACAG	2	8	332651	332658	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021827	GAGG	2	8	333861	333868	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021827	TGAA	2	8	337982	337989	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021827	TCCC	2	8	338306	338313	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_021827	AAAT	2	8	341949	341956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021827	TTTG	2	8	348415	348422	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021827	CAAT	2	8	348456	348463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021827	ATAA	2	8	351693	351700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021827	TGCC	2	8	354702	354709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021827	AAGG	2	8	360784	360791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021827	GTGG	2	8	361324	361331	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021827	GAGT	2	8	361368	361375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021827	TTAC	2	8	364923	364930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021827	TGAC	2	8	365131	365138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021827	AGGT	2	8	366696	366703	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021827	AAGG	2	8	378214	378221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021827	CTTA	2	8	378934	378941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021827	AATT	2	8	379044	379051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021827	TTGA	2	8	379054	379061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021827	AATT	2	8	379442	379449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021827	TATT	2	8	379466	379473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021827	TGAA	2	8	381320	381327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021827	AAAG	2	8	383208	383215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021827	TTTC	2	8	386140	386147	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021827	CTAA	2	8	390098	390105	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021827	TAAA	2	8	390128	390135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021827	TCTT	2	8	390192	390199	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021827	GGAA	2	8	400376	400383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021827	AGAA	2	8	401516	401523	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021827	CTTA	2	8	401559	401566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_021827	AAGA	2	8	401608	401615	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021827	GTTT	2	8	401769	401776	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021827	TAAA	2	8	401875	401882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021827	ACAA	2	8	404461	404468	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021827	GTGA	2	8	408588	408595	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_021827	ATTC	2	8	411961	411968	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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