MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 4045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021827	TTC	2	6	4	9	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021827	AAC	2	6	13	18	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021827	CTT	2	6	40	45	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021827	GCG	2	6	53	58	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021827	CTG	2	6	99	104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021827	TCC	2	6	387	392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021827	CGC	2	6	420	425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021827	TCT	3	9	624	632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021827	TCT	2	6	659	664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021827	AGC	2	6	676	681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021827	CAA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021827	TGA	2	6	748	753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021827	TTG	2	6	5834	5839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021827	TGG	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021827	TTG	2	6	6038	6043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021827	AGA	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021827	AAT	2	6	8959	8964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021827	CCT	2	6	11090	11095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021827	GTT	2	6	11148	11153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021827	ATT	2	6	11196	11201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021827	TAT	2	6	11243	11248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021827	TCC	2	6	13923	13928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_021827	TAA	2	6	13962	13967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021827	CCT	2	6	16576	16581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021827	CTT	2	6	16584	16589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021827	GAA	2	6	20203	20208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021827	CCT	2	6	21511	21516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_021827	TAT	2	6	22407	22412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021827	AAC	2	6	22413	22418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021827	AGG	2	6	22496	22501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021827	AGT	2	6	24227	24232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021827	AAG	2	6	24610	24615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021827	CTT	2	6	24635	24640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021827	TCC	2	6	25123	25128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_021827	TCC	2	6	25583	25588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_021827	TCT	2	6	28577	28582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021827	ATT	2	6	28616	28621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021827	GAA	2	6	28637	28642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021827	TTC	2	6	30399	30404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021827	TTC	2	6	30438	30443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021827	AAT	2	6	30448	30453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021827	TAA	2	6	32156	32161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021827	CTC	2	6	32182	32187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_021827	TCG	2	6	32288	32293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021827	AGG	2	6	32353	32358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021827	TAA	2	6	33463	33468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021827	TAT	2	6	33487	33492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021827	TTG	2	6	33523	33528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021827	TCC	2	6	36986	36991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_021827	AGA	2	6	37032	37037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021827	CAA	2	6	37515	37520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021827	CAC	2	6	37859	37864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_021827	GCT	2	6	37879	37884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021827	TTC	2	6	37981	37986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021827	ATA	3	9	37996	38004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021827	CTA	2	6	38091	38096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021827	AAT	2	6	38114	38119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021827	ATC	2	6	38121	38126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021827	ATC	2	6	38175	38180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021827	AAT	2	6	38239	38244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021827	TAG	2	6	38477	38482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021827	CTT	2	6	38526	38531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021827	CCT	2	6	40441	40446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_021827	GTA	2	6	41206	41211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021827	TAG	2	6	41277	41282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021827	TAT	2	6	42222	42227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021827	ACA	2	6	42249	42254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021827	TAT	2	6	42257	42262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021827	AAC	2	6	44034	44039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021827	TAC	2	6	45931	45936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021827	GAA	2	6	47290	47295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021827	ATT	2	6	47375	47380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021827	TCA	2	6	47464	47469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021827	TCC	2	6	48315	48320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_021827	TAA	2	6	48321	48326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021827	TAT	2	6	48340	48345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021827	TGG	2	6	48387	48392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021827	CCT	2	6	58770	58775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_021827	CCT	2	6	62176	62181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_021827	TCC	2	6	63107	63112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_021827	AAG	2	6	63164	63169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021827	ATT	2	6	63260	63265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021827	CTA	2	6	63290	63295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021827	ACC	2	6	64723	64728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_021827	ACC	2	6	66036	66041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_021827	TTC	2	6	66966	66971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021827	AAG	2	6	67050	67055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021827	AGT	2	6	71744	71749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021827	TAT	2	6	71750	71755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021827	TAT	2	6	72638	72643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021827	ATA	2	6	74435	74440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021827	ATT	2	6	74466	74471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021827	AAC	2	6	74546	74551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021827	TTA	2	6	76770	76775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021827	TAC	2	6	77005	77010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021827	TCC	2	6	77840	77845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_021827	TCC	2	6	80226	80231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_021827	AGA	2	6	80477	80482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021827	ATT	2	6	83713	83718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021827	TAA	2	6	83779	83784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021827	TAT	2	6	85675	85680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021827	TCT	2	6	85706	85711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021827	TTA	2	6	87423	87428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021827	ACT	2	6	87466	87471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021827	TTG	2	6	87986	87991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021827	TAT	2	6	88082	88087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021827	TTA	2	6	88642	88647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021827	TAT	2	6	88934	88939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021827	TCA	2	6	88953	88958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021827	GTT	2	6	89113	89118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021827	GAT	2	6	89173	89178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021827	ATT	2	6	89225	89230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021827	CTT	2	6	89270	89275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021827	CAG	2	6	89290	89295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021827	CTT	2	6	89374	89379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021827	AAC	2	6	89403	89408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021827	CTT	2	6	89413	89418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021827	CGG	2	6	89461	89466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021827	CTA	2	6	89494	89499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021827	TGT	2	6	89564	89569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021827	GGT	2	6	89618	89623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021827	CTT	2	6	89869	89874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021827	CAG	2	6	89941	89946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021827	TTC	2	6	89993	89998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021827	TTC	2	6	90144	90149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021827	TAA	2	6	90889	90894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021827	CTA	2	6	94679	94684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021827	GCT	2	6	94738	94743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021827	TAT	2	6	94796	94801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021827	AAG	2	6	94852	94857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021827	CCT	2	6	95453	95458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_021827	ATA	2	6	95559	95564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021827	AGA	2	6	95593	95598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021827	CCT	2	6	97946	97951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_021827	AGC	2	6	100494	100499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021827	CCT	2	6	101657	101662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_021827	CTC	2	6	102688	102693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_021827	CCT	2	6	103278	103283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_021827	TCC	2	6	108146	108151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_021827	TCC	2	6	109165	109170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_021827	TAT	2	6	109258	109263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021827	ATT	2	6	110448	110453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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