MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A

Total Repeats: 2291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021826	AAGAA	2	10	267	276	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021826	CACCC	2	10	2615	2624	20 %	0 %	0 %	80 %	525888611
3	NC_021826	AAAAT	2	10	3383	3392	80 %	20 %	0 %	0 %	525888612
4	NC_021826	ACAAA	2	10	6890	6899	80 %	0 %	0 %	20 %	525886096
5	NC_021826	AAGAA	2	10	7265	7274	80 %	0 %	20 %	0 %	525886096
6	NC_021826	GTTTT	2	10	7664	7673	0 %	80 %	20 %	0 %	525886097
7	NC_021826	TTTGA	2	10	8797	8806	20 %	60 %	20 %	0 %	525886098
8	NC_021826	ATTAA	2	10	12744	12753	60 %	40 %	0 %	0 %	525886101
9	NC_021826	AAAGC	2	10	14433	14442	60 %	0 %	20 %	20 %	525886104
10	NC_021826	GGTAG	2	10	14742	14751	20 %	20 %	60 %	0 %	525886104
11	NC_021826	TTTCC	2	10	14770	14779	0 %	60 %	0 %	40 %	525886104
12	NC_021826	TTTTC	2	10	15371	15380	0 %	80 %	0 %	20 %	525888620
13	NC_021826	TTATT	2	10	15433	15442	20 %	80 %	0 %	0 %	525888620
14	NC_021826	TTGAT	2	10	16257	16266	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021826	AATCA	2	10	17029	17038	60 %	20 %	0 %	20 %	525888622
16	NC_021826	TAGTT	2	10	17793	17802	20 %	60 %	20 %	0 %	525888622
17	NC_021826	TTCGT	2	10	18015	18024	0 %	60 %	20 %	20 %	525886105
18	NC_021826	TTTTA	2	10	18301	18310	20 %	80 %	0 %	0 %	525886106
19	NC_021826	CAACC	2	10	18608	18617	40 %	0 %	0 %	60 %	525886106
20	NC_021826	ATCAT	2	10	18655	18664	40 %	40 %	0 %	20 %	525886106
21	NC_021826	GTAAA	2	10	19578	19587	60 %	20 %	20 %	0 %	525886108
22	NC_021826	TGTAT	2	10	20520	20529	20 %	60 %	20 %	0 %	525886109
23	NC_021826	AGATG	2	10	21739	21748	40 %	20 %	40 %	0 %	525886110
24	NC_021826	GATAT	2	10	22589	22598	40 %	40 %	20 %	0 %	525886112
25	NC_021826	AATTC	2	10	24293	24302	40 %	40 %	0 %	20 %	525886115
26	NC_021826	GCTTA	2	10	28842	28851	20 %	40 %	20 %	20 %	525886120
27	NC_021826	AAACA	2	10	30603	30612	80 %	0 %	0 %	20 %	525886121
28	NC_021826	AATGC	2	10	31032	31041	40 %	20 %	20 %	20 %	525886122
29	NC_021826	AACAA	2	10	31355	31364	80 %	0 %	0 %	20 %	525886123
30	NC_021826	CAAGA	2	10	33807	33816	60 %	0 %	20 %	20 %	525886125
31	NC_021826	CGATT	2	10	35761	35770	20 %	40 %	20 %	20 %	525886129
32	NC_021826	ACGTT	2	10	39441	39450	20 %	40 %	20 %	20 %	525886133
33	NC_021826	AACAG	2	10	41767	41776	60 %	0 %	20 %	20 %	525886135
34	NC_021826	TGATA	2	10	41824	41833	40 %	40 %	20 %	0 %	525886135
35	NC_021826	AAATA	2	10	44369	44378	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021826	GTCTT	2	10	45175	45184	0 %	60 %	20 %	20 %	525886138
37	NC_021826	ATTTA	2	10	49887	49896	40 %	60 %	0 %	0 %	525886142
38	NC_021826	AACCA	2	10	49974	49983	60 %	0 %	0 %	40 %	525886142
39	NC_021826	TAAAA	2	10	54420	54429	80 %	20 %	0 %	0 %	525886146
40	NC_021826	GAAAA	2	10	55032	55041	80 %	0 %	20 %	0 %	525886148
41	NC_021826	CATTA	2	10	57877	57886	40 %	40 %	0 %	20 %	525886153
42	NC_021826	TAAAC	2	10	59421	59430	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021826	AATCG	2	10	59823	59832	40 %	20 %	20 %	20 %	525888623
44	NC_021826	ATATT	2	10	60653	60662	40 %	60 %	0 %	0 %	525888623
45	NC_021826	TGATT	2	10	63306	63315	20 %	60 %	20 %	0 %	525886157
46	NC_021826	CTTGC	2	10	64324	64333	0 %	40 %	20 %	40 %	525886158
47	NC_021826	TTTTA	2	10	64691	64700	20 %	80 %	0 %	0 %	525886158
48	NC_021826	TGAAA	2	10	66230	66239	60 %	20 %	20 %	0 %	525886160
49	NC_021826	CAAAA	2	10	66944	66953	80 %	0 %	0 %	20 %	525886161
50	NC_021826	ACTTA	2	10	67418	67427	40 %	40 %	0 %	20 %	525886162
51	NC_021826	AATTG	2	10	67616	67625	40 %	40 %	20 %	0 %	525886162
52	NC_021826	ATTTT	2	10	67738	67747	20 %	80 %	0 %	0 %	525886162
53	NC_021826	ACGTA	2	10	69777	69786	40 %	20 %	20 %	20 %	525886164
54	NC_021826	CGAAC	2	10	70949	70958	40 %	0 %	20 %	40 %	525886165
55	NC_021826	CGTTC	2	10	72435	72444	0 %	40 %	20 %	40 %	525888625
56	NC_021826	CAAGC	2	10	72819	72828	40 %	0 %	20 %	40 %	525886166
57	NC_021826	ATTTA	2	10	76416	76425	40 %	60 %	0 %	0 %	525886171
58	NC_021826	GCGAG	2	10	77820	77829	20 %	0 %	60 %	20 %	525886172
59	NC_021826	TAAAA	2	10	79707	79716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021826	ATTTA	2	10	79735	79744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021826	AAATG	2	10	80697	80706	60 %	20 %	20 %	0 %	525886178
62	NC_021826	ATTTT	2	10	81301	81310	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021826	ACAAA	2	10	83593	83602	80 %	0 %	0 %	20 %	525886180
64	NC_021826	GATTG	2	10	85402	85411	20 %	40 %	40 %	0 %	525886182
65	NC_021826	CTGGA	2	10	86276	86285	20 %	20 %	40 %	20 %	525886184
66	NC_021826	ATTTC	2	10	88585	88594	20 %	60 %	0 %	20 %	525886186
67	NC_021826	ATGCA	2	10	94041	94050	40 %	20 %	20 %	20 %	525886188
68	NC_021826	AAAAT	2	10	96256	96265	80 %	20 %	0 %	0 %	525886190
69	NC_021826	TACGA	2	10	97839	97848	40 %	20 %	20 %	20 %	525886190
70	NC_021826	CTTAT	2	10	100654	100663	20 %	60 %	0 %	20 %	525886194
71	NC_021826	TGGTG	2	10	101539	101548	0 %	40 %	60 %	0 %	525886195
72	NC_021826	CACGA	2	10	102794	102803	40 %	0 %	20 %	40 %	525886195
73	NC_021826	ATAAA	2	10	102979	102988	80 %	20 %	0 %	0 %	525886196
74	NC_021826	GTTAT	2	10	103531	103540	20 %	60 %	20 %	0 %	525886196
75	NC_021826	ATTTT	2	10	103774	103783	20 %	80 %	0 %	0 %	525886196
76	NC_021826	TCTCA	2	10	104119	104128	20 %	40 %	0 %	40 %	525886196
77	NC_021826	ATGAT	2	10	104503	104512	40 %	40 %	20 %	0 %	525886196
78	NC_021826	TCTAG	2	10	104514	104523	20 %	40 %	20 %	20 %	525886196
79	NC_021826	CAAAA	2	10	104842	104851	80 %	0 %	0 %	20 %	525886196
80	NC_021826	AACGC	2	10	105928	105937	40 %	0 %	20 %	40 %	525886198
81	NC_021826	AAACC	2	10	111421	111430	60 %	0 %	0 %	40 %	525886203
82	NC_021826	CGATG	2	10	111964	111973	20 %	20 %	40 %	20 %	525886204
83	NC_021826	AAATT	2	10	113213	113222	60 %	40 %	0 %	0 %	525888626
84	NC_021826	TATAA	2	10	114197	114206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021826	TAAAA	2	10	114265	114274	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021826	CTTTA	2	10	114482	114491	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_021826	CTATA	2	10	114670	114679	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_021826	TCTTA	2	10	115265	115274	20 %	60 %	0 %	20 %	525888628
89	NC_021826	TTTAG	2	10	117807	117816	20 %	60 %	20 %	0 %	525888628
90	NC_021826	ACTTG	2	10	121693	121702	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_021826	TTTAT	2	10	122404	122413	20 %	80 %	0 %	0 %	525886209
92	NC_021826	TGCAA	2	10	123007	123016	40 %	20 %	20 %	20 %	525886210
93	NC_021826	GTAAA	2	10	124134	124143	60 %	20 %	20 %	0 %	525886210
94	NC_021826	AAAGA	2	10	124187	124196	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021826	TGAAA	2	10	124839	124848	60 %	20 %	20 %	0 %	525886212
96	NC_021826	TAGAA	2	10	125049	125058	60 %	20 %	20 %	0 %	525886212
97	NC_021826	AAAAT	2	10	126351	126360	80 %	20 %	0 %	0 %	525886214
98	NC_021826	AATTT	2	10	126968	126977	40 %	60 %	0 %	0 %	525886215
99	NC_021826	TTTGT	2	10	127779	127788	0 %	80 %	20 %	0 %	525888630
100	NC_021826	ATTAA	2	10	128836	128845	60 %	40 %	0 %	0 %	525888632
101	NC_021826	CATCC	2	10	130676	130685	20 %	20 %	0 %	60 %	525886218
102	NC_021826	ATATT	2	10	131719	131728	40 %	60 %	0 %	0 %	525886219
103	NC_021826	TTACG	2	10	132728	132737	20 %	40 %	20 %	20 %	525886219
104	NC_021826	CAAAA	2	10	133020	133029	80 %	0 %	0 %	20 %	525886219
105	NC_021826	TACTA	2	10	133170	133179	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021826	TAAAA	2	10	133215	133224	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021826	CAAAA	2	10	133278	133287	80 %	0 %	0 %	20 %	525886220
108	NC_021826	TGAAA	2	10	133376	133385	60 %	20 %	20 %	0 %	525886220
109	NC_021826	ACAAA	2	10	134845	134854	80 %	0 %	0 %	20 %	525886222
110	NC_021826	AAATG	2	10	137688	137697	60 %	20 %	20 %	0 %	525886225
111	NC_021826	TAATT	2	10	138086	138095	40 %	60 %	0 %	0 %	525886225
112	NC_021826	GTATT	2	10	138270	138279	20 %	60 %	20 %	0 %	525886225
113	NC_021826	ACTAG	2	10	139522	139531	40 %	20 %	20 %	20 %	525886227
114	NC_021826	ATTTA	2	10	139587	139596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021826	CAAAA	2	10	142900	142909	80 %	0 %	0 %	20 %	525886231
116	NC_021826	ATTTT	2	10	148903	148912	20 %	80 %	0 %	0 %	525886238
117	NC_021826	AAATT	2	10	150979	150988	60 %	40 %	0 %	0 %	525886239
118	NC_021826	AATGA	2	10	151284	151293	60 %	20 %	20 %	0 %	525886239
119	NC_021826	CATTA	2	10	153041	153050	40 %	40 %	0 %	20 %	525886240
120	NC_021826	CTTTT	2	10	153738	153747	0 %	80 %	0 %	20 %	525886241
121	NC_021826	GCCAA	2	10	155386	155395	40 %	0 %	20 %	40 %	525886243
122	NC_021826	GCCGT	2	10	156893	156902	0 %	20 %	40 %	40 %	525886244
123	NC_021826	GATTG	2	10	157901	157910	20 %	40 %	40 %	0 %	525886246
124	NC_021826	ATTTT	2	10	158951	158960	20 %	80 %	0 %	0 %	525886248
125	NC_021826	AATTA	2	10	159522	159531	60 %	40 %	0 %	0 %	525886248
126	NC_021826	TGGCA	2	10	160914	160923	20 %	20 %	40 %	20 %	525886250
127	NC_021826	ATTAA	2	10	163425	163434	60 %	40 %	0 %	0 %	525886251
128	NC_021826	AATTA	2	10	164159	164168	60 %	40 %	0 %	0 %	525886251
129	NC_021826	ATTTC	2	10	165624	165633	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021826	CAAAC	2	10	167517	167526	60 %	0 %	0 %	40 %	525886253
131	NC_021826	TGGCG	2	10	168207	168216	0 %	20 %	60 %	20 %	525886254
132	NC_021826	GAATA	2	10	168867	168876	60 %	20 %	20 %	0 %	525886254
133	NC_021826	CAAAT	2	10	168990	168999	60 %	20 %	0 %	20 %	525886254
134	NC_021826	CCGTA	2	10	169010	169019	20 %	20 %	20 %	40 %	525886254
135	NC_021826	TACTT	2	10	173846	173855	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021826	TAGCT	2	10	174041	174050	20 %	40 %	20 %	20 %	525886259
137	NC_021826	GGTTT	2	10	174544	174553	0 %	60 %	40 %	0 %	525886259
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