MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A

Total Repeats: 386

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021826	AAGAA	2	10	267	276	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021826	TTGAT	2	10	16257	16266	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021826	AAATA	2	10	44369	44378	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021826	TAAAC	2	10	59421	59430	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021826	TAAAA	2	10	79707	79716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021826	ATTTA	2	10	79735	79744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021826	ATTTT	2	10	81301	81310	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021826	TATAA	2	10	114197	114206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021826	TAAAA	2	10	114265	114274	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021826	CTTTA	2	10	114482	114491	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021826	CTATA	2	10	114670	114679	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021826	ACTTG	2	10	121693	121702	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021826	AAAGA	2	10	124187	124196	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021826	TACTA	2	10	133170	133179	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021826	TAAAA	2	10	133215	133224	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021826	ATTTA	2	10	139587	139596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021826	ATTTC	2	10	165624	165633	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021826	TACTT	2	10	173846	173855	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021826	TTTAT	2	10	188649	188658	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021826	GAATA	2	10	188856	188865	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021826	ATACT	2	10	258205	258214	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021826	AACCG	2	10	258238	258247	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_021826	AAATA	2	10	264223	264232	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021826	TAAAA	2	10	284729	284738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021826	AGGAA	2	10	287249	287258	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021826	TAATA	2	10	288699	288708	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021826	AAAAC	2	10	291613	291622	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021826	TGTAT	2	10	294427	294436	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021826	AAATA	2	10	294472	294481	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021826	TTTAT	2	10	300951	300960	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021826	ATAAA	2	10	327338	327347	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021826	TTATA	2	10	350573	350582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021826	CTTTA	2	10	354599	354608	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021826	TAAAA	2	10	363101	363110	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021826	AATGA	2	10	368909	368918	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021826	CTGTT	2	10	369039	369048	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021826	TCTAT	2	10	373343	373352	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021826	TCATT	2	10	379851	379860	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021826	GTAAA	2	10	395612	395621	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021826	GCGCC	2	10	395759	395768	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_021826	TTTCT	2	10	395843	395852	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021826	ATTGA	2	10	397912	397921	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021826	ATTAA	2	10	432168	432177	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021826	AAATT	2	10	443741	443750	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021826	CTTTT	2	10	446479	446488	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021826	CCTCT	2	10	475923	475932	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_021826	TTTTA	2	10	487579	487588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021826	TCTAT	2	10	487646	487655	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021826	ACAAA	2	10	487657	487666	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021826	ACTAT	2	10	488238	488247	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021826	GTTAA	2	10	490502	490511	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021826	CAAAA	2	10	493397	493406	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_021826	TTAGT	2	10	499459	499468	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021826	AATTT	2	10	501844	501853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021826	AGTCA	2	10	508688	508697	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021826	TTTAC	2	10	517088	517097	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021826	TCAGA	2	10	526130	526139	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021826	TAAAA	2	10	551185	551194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021826	ATATT	2	10	553055	553064	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021826	TGCAA	2	10	554449	554458	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021826	ATAAA	2	10	554844	554853	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021826	TGATA	2	10	555086	555095	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021826	TTCGA	2	10	555251	555260	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021826	TAGAA	2	10	581886	581895	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021826	CTTTT	2	10	584843	584852	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021826	AATTC	2	10	598569	598578	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021826	AGCCA	2	10	599088	599097	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_021826	GTATA	2	10	600516	600525	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021826	TTATT	2	10	605421	605430	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021826	TTTAT	2	10	605474	605483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021826	TATAA	2	10	608113	608122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021826	TCCAT	2	10	609091	609100	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_021826	TATCA	2	10	615465	615474	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021826	CTTTT	2	10	624442	624451	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021826	ATATT	2	10	637024	637033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021826	CGCGC	2	10	641328	641337	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
77	NC_021826	TTACC	2	10	645566	645575	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_021826	CACGA	2	10	647038	647047	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_021826	AATTA	2	10	648197	648206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021826	ATCAT	2	10	648374	648383	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_021826	AAATA	2	10	653376	653385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021826	TATTT	2	10	653399	653408	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021826	AATGA	2	10	674896	674905	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021826	TTGAA	2	10	698494	698503	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021826	TGATG	2	10	698702	698711	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021826	AAAAG	2	10	698974	698983	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021826	TAAAC	2	10	717233	717242	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_021826	AAGCT	2	10	718099	718108	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021826	TAAAA	2	10	720032	720041	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021826	TTTCA	2	10	730097	730106	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_021826	AAGAT	2	10	732955	732964	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021826	AAAAT	2	10	747590	747599	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021826	CTTAC	2	10	757054	757063	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_021826	TGTTC	2	10	762158	762167	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021826	TTTTA	2	10	770719	770728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021826	AAAAG	2	10	775512	775521	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021826	TTTTA	2	10	785169	785178	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021826	AGGTT	2	10	797146	797155	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021826	TTACC	2	10	803309	803318	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_021826	CACGA	2	10	804779	804788	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_021826	AATTA	2	10	805938	805947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021826	ACTCC	2	10	813254	813263	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
103	NC_021826	GTATA	2	10	813764	813773	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021826	CAAAA	2	10	813991	814000	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_021826	TCTAT	2	10	819217	819226	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021826	TAAAA	2	10	843127	843136	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021826	ATACA	2	10	856029	856038	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021826	ACTTT	2	10	857863	857872	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_021826	GTAAA	2	10	878365	878374	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021826	CATTT	2	10	886241	886250	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021826	TAGCA	2	10	890459	890468	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_021826	TAAAG	2	10	904613	904622	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021826	AGCAT	2	10	915586	915595	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021826	ATAGA	2	10	940075	940084	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021826	CTTTA	2	10	946594	946603	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_021826	AATTT	2	10	960094	960103	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021826	CTAGC	2	10	960198	960207	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_021826	TTAAA	2	10	965971	965980	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021826	TTCAT	2	10	971573	971582	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021826	ACCTT	2	10	992907	992916	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_021826	CAAAC	2	10	1003281	1003290	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_021826	TAACA	2	10	1006927	1006936	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_021826	TTGCT	2	10	1011261	1011270	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_021826	AAATT	2	10	1019252	1019261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021826	CTTTT	2	10	1040293	1040302	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_021826	TTAAA	2	10	1049928	1049937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021826	TATCT	2	10	1070916	1070925	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021826	TACGA	2	10	1075581	1075590	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_021826	CTTGA	2	10	1077181	1077190	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021826	CACTT	2	10	1081703	1081712	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_021826	AATTC	2	10	1087523	1087532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_021826	TTTTA	2	10	1091993	1092002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021826	CTTTT	2	10	1108197	1108206	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021826	AGCAT	2	10	1121528	1121537	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_021826	ACTAA	2	10	1155438	1155447	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021826	TAAAG	2	10	1172451	1172460	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021826	AATTT	2	10	1177213	1177222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021826	CACTA	2	10	1185103	1185112	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_021826	GTATC	2	10	1188208	1188217	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_021826	GAAAA	2	10	1188414	1188423	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021826	ATTGT	2	10	1189219	1189228	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021826	GTAAA	2	10	1193961	1193970	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021826	TTTGT	2	10	1231378	1231387	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021826	TAAAA	2	10	1239117	1239126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021826	ATCTT	2	10	1246197	1246206	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021826	TTAAA	2	10	1271912	1271921	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021826	TCTTT	2	10	1273528	1273537	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_021826	TTATG	2	10	1273549	1273558	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021826	GGAGA	2	10	1291320	1291329	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021826	ATATA	2	10	1306266	1306275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021826	TAACA	2	10	1318113	1318122	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_021826	TCCAT	2	10	1324095	1324104	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
153	NC_021826	GTTTT	2	10	1324284	1324293	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021826	TCACT	2	10	1328240	1328249	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
155	NC_021826	TTTAT	2	10	1343502	1343511	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021826	CTATA	2	10	1343684	1343693	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_021826	TCCGT	2	10	1360896	1360905	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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161	NC_021826	TTACC	2	10	1365198	1365207	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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165	NC_021826	AATTT	2	10	1397552	1397561	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_021826	CTTTT	2	10	1510944	1510953	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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183	NC_021826	ATCTT	2	10	1542056	1542065	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_021826	TACCA	2	10	1546256	1546265	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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189	NC_021826	GTTTG	2	10	1577101	1577110	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_021826	AAATA	2	10	1604214	1604223	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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221	NC_021826	GGCTA	2	10	1765783	1765792	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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272	NC_021826	TCGTG	2	10	2198850	2198859	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
273	NC_021826	AAGGT	2	10	2200317	2200326	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
274	NC_021826	TAATT	2	10	2203710	2203719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_021826	TCGTG	2	10	2204869	2204878	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
276	NC_021826	AAGGT	2	10	2206337	2206346	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
277	NC_021826	GGCAT	2	10	2223628	2223637	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_021826	TGGCT	2	10	2258037	2258046	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
282	NC_021826	ACTAA	2	10	2259413	2259422	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
283	NC_021826	TATAA	2	10	2264639	2264648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_021826	AAAGA	2	10	2267867	2267876	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
285	NC_021826	TTATT	2	10	2290423	2290432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_021826	TATCA	2	10	2293352	2293361	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_021826	ATTTT	2	10	2293380	2293389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_021826	GAAAT	2	10	2293513	2293522	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_021826	TAAAA	2	10	2307408	2307417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021826	ATTGT	2	10	2317849	2317858	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
291	NC_021826	TTTTA	2	10	2327856	2327865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_021826	AGGAG	2	10	2331997	2332006	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
293	NC_021826	ATAGA	2	10	2332300	2332309	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
294	NC_021826	GTGAT	2	10	2355084	2355093	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
295	NC_021826	AAAAC	2	10	2356897	2356906	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
296	NC_021826	CAAAA	2	10	2377767	2377776	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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320	NC_021826	AGAAT	2	10	2577926	2577935	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_021826	AATCA	2	10	2581057	2581066	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
323	NC_021826	TATAA	2	10	2589001	2589010	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_021826	ATTGA	2	10	2589039	2589048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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330	NC_021826	GAAAT	2	10	2667166	2667175	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_021826	ATTTA	2	10	2680841	2680850	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_021826	GGGGA	2	10	2690594	2690603	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
334	NC_021826	TATTT	2	10	2696832	2696841	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
335	NC_021826	AGAGA	2	10	2696982	2696991	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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377	NC_021826	GTTTT	2	10	3036284	3036293	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_021826	AAGTT	2	10	3050458	3050467	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.