MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A

Total Repeats: 1222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021826	ATGA	2	8	197	204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021826	GGAT	2	8	1097	1104	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021826	GTTA	2	8	1231	1238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021826	ATTA	2	8	1403	1410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021826	TAAA	2	8	1534	1541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021826	ATTG	2	8	1594	1601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021826	ATTA	2	8	2752	2759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021826	TCAG	2	8	3275	3282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021826	AGAA	2	8	5691	5698	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021826	ATCA	2	8	5869	5876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021826	CTTT	2	8	5903	5910	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021826	AGCA	2	8	9757	9764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021826	AAGT	2	8	16042	16049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021826	ACTT	2	8	16066	16073	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021826	AAAT	2	8	16136	16143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021826	GTTG	2	8	16286	16293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021826	ACTG	2	8	22063	22070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021826	GTAG	2	8	25653	25660	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021826	ATGT	2	8	25685	25692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021826	TTAT	2	8	45635	45642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021826	AATC	2	8	45879	45886	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021826	TAAT	2	8	59372	59379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021826	TCCC	2	8	79677	79684	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_021826	TTAT	2	8	82428	82435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021826	AGAA	2	8	83740	83747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021826	TTAT	2	8	83782	83789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021826	AGCT	2	8	90380	90387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021826	ACTT	2	8	90465	90472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021826	ATAA	2	8	94703	94710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021826	ATGA	2	8	98499	98506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021826	GTTG	2	8	100125	100132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021826	TTTC	2	8	100239	100246	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021826	AACA	2	8	105722	105729	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021826	AATA	2	8	109550	109557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021826	ACAA	2	8	112461	112468	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021826	GTCG	2	8	112561	112568	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021826	TGGA	2	8	112649	112656	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021826	TCCA	2	8	112739	112746	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021826	TAAA	2	8	113154	113161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021826	AAAG	2	8	121147	121154	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021826	AGGA	2	8	122687	122694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021826	ACAA	2	8	122705	122712	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021826	CCTA	2	8	126616	126623	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021826	CAAT	2	8	127481	127488	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021826	GGGA	2	8	134382	134389	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021826	ATTA	2	8	138717	138724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021826	TTTG	2	8	139170	139177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021826	TATG	2	8	139578	139585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021826	GAAT	2	8	141011	141018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021826	TAAA	2	8	141086	141093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021826	AAAG	2	8	149552	149559	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021826	TTTC	2	8	153300	153307	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021826	ATTG	2	8	153378	153385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021826	AGAA	2	8	159668	159675	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021826	ATAA	2	8	165547	165554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021826	AATT	2	8	169752	169759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021826	CAAA	2	8	170761	170768	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021826	CCAA	2	8	173535	173542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021826	ATTT	2	8	176407	176414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021826	TTTA	2	8	176990	176997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021826	CAAA	2	8	181080	181087	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021826	ACAT	2	8	181143	181150	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021826	CAAT	2	8	181866	181873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021826	ATGG	2	8	188696	188703	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021826	ATAA	2	8	188714	188721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021826	TCTA	2	8	188847	188854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021826	CTTG	2	8	200592	200599	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021826	TGCT	2	8	208010	208017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021826	ATTA	2	8	211955	211962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021826	CTTT	2	8	212002	212009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021826	TAAA	2	8	213090	213097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021826	TTGA	2	8	232715	232722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021826	AATT	2	8	236647	236654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021826	TCCT	2	8	236739	236746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021826	TTGC	2	8	241716	241723	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021826	CTTA	2	8	248947	248954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021826	GATT	2	8	250141	250148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021826	TTTG	2	8	259377	259384	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021826	TTAT	3	12	262795	262806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021826	CATA	2	8	262881	262888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021826	TGTT	2	8	262910	262917	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021826	AATG	2	8	264207	264214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021826	TGCT	2	8	274620	274627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021826	ATTT	2	8	277669	277676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021826	TAAT	2	8	277726	277733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021826	AAAG	2	8	282140	282147	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021826	TCTT	2	8	290032	290039	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021826	AATG	2	8	291450	291457	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021826	TACT	2	8	291594	291601	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021826	GAAA	2	8	304560	304567	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021826	TATT	2	8	309781	309788	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021826	ATTT	2	8	311065	311072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021826	CTTT	2	8	311084	311091	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021826	TCCT	2	8	314866	314873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021826	ACTT	2	8	319864	319871	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021826	TTGT	2	8	319935	319942	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021826	AAAT	2	8	319969	319976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021826	ATTC	2	8	331392	331399	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021826	TAAA	2	8	332819	332826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021826	TTTA	2	8	333869	333876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021826	CTTG	2	8	350594	350601	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021826	TCCC	2	8	351369	351376	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_021826	CACT	2	8	351392	351399	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021826	AAAT	2	8	351439	351446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021826	TGTA	2	8	353287	353294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021826	TGTT	2	8	353388	353395	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021826	TACT	2	8	360619	360626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021826	ATTA	2	8	363083	363090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021826	AAAT	2	8	363192	363199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021826	CCCT	2	8	366919	366926	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_021826	GAAG	2	8	367536	367543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021826	TTTA	2	8	373329	373336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021826	TGTT	2	8	377241	377248	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021826	AGCA	2	8	377342	377349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021826	AACA	2	8	378716	378723	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021826	AATT	2	8	380015	380022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021826	TTCC	2	8	384643	384650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021826	CCTT	2	8	395680	395687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021826	GGTG	2	8	395711	395718	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021826	TAAA	2	8	397340	397347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021826	ATAA	2	8	397966	397973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021826	AATT	2	8	399616	399623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021826	GTTT	2	8	403301	403308	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021826	CGTT	2	8	411287	411294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021826	TATG	2	8	413627	413634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021826	TATT	2	8	422585	422592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021826	ATTT	2	8	422606	422613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021826	TTAA	2	8	425224	425231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021826	TCAA	2	8	425266	425273	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021826	AATT	2	8	425361	425368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021826	AAGC	2	8	426495	426502	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021826	TAAG	2	8	432243	432250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021826	ACTC	2	8	449601	449608	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021826	AAAC	2	8	453824	453831	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021826	GTTT	2	8	453856	453863	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021826	TACT	2	8	457380	457387	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_021826	ATTC	2	8	459268	459275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021826	TATT	2	8	459277	459284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021826	AAGT	2	8	459329	459336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021826	AAAG	2	8	459476	459483	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021826	CAGC	2	8	459504	459511	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021826	TAAA	2	8	460656	460663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021826	CTTT	2	8	460695	460702	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021826	TAAT	2	8	466239	466246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021826	CTTC	2	8	469255	469262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021826	TATT	2	8	469297	469304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021826	TAAC	2	8	471753	471760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021826	CAAA	2	8	471768	471775	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_021826	ATTT	2	8	471815	471822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021826	TTAA	2	8	472388	472395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021826	CTAA	2	8	474798	474805	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_021826	AGCC	2	8	476693	476700	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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