MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A

Total Repeats: 4395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021826	ATT	2	6	68	73	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021826	GAA	2	6	83	88	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021826	AGT	2	6	128	133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021826	ATA	2	6	237	242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021826	TGA	2	6	310	315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021826	CTA	2	6	390	395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021826	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021826	TTA	2	6	446	451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021826	TAA	2	6	472	477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021826	AGA	2	6	520	525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021826	AGA	2	6	592	597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021826	GAA	2	6	643	648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021826	AAT	2	6	688	693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021826	GAA	2	6	882	887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021826	AGA	2	6	926	931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021826	ACG	2	6	1116	1121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021826	TCG	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021826	AAT	2	6	1153	1158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021826	TTG	2	6	1246	1251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021826	ATA	2	6	1336	1341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021826	AAT	2	6	1428	1433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021826	TCC	2	6	1554	1559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_021826	TCA	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021826	CAT	2	6	1612	1617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021826	AAC	2	6	1618	1623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021826	AAG	2	6	1648	1653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021826	CAT	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021826	AGA	2	6	1730	1735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021826	ATT	2	6	2638	2643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021826	AAT	2	6	2655	2660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021826	ACA	2	6	2696	2701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021826	ATA	2	6	2819	2824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021826	ATT	2	6	2919	2924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021826	CTA	2	6	2944	2949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021826	AAC	2	6	3016	3021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021826	TAA	2	6	3040	3045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021826	AAT	2	6	3056	3061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021826	CTT	2	6	3155	3160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021826	GAT	2	6	3217	3222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021826	ATT	2	6	4662	4667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021826	TGG	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021826	ATA	2	6	5725	5730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021826	TTA	2	6	5771	5776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021826	ATA	2	6	5815	5820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021826	GAG	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021826	TAA	2	6	5931	5936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021826	AAC	3	9	5969	5977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021826	CAG	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021826	AAT	2	6	6004	6009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021826	TCT	2	6	7289	7294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021826	CCT	2	6	9624	9629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_021826	ATA	2	6	9727	9732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021826	TTA	2	6	9742	9747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021826	TCT	2	6	13578	13583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021826	CCT	2	6	13584	13589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_021826	AGG	2	6	13632	13637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021826	ACA	2	6	13994	13999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021826	ATC	2	6	15221	15226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021826	AGG	2	6	15263	15268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021826	AGT	2	6	16078	16083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021826	AGG	2	6	16208	16213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021826	AAT	2	6	16217	16222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021826	CCT	2	6	16244	16249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_021826	TAT	2	6	16280	16285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021826	AGG	2	6	16301	16306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021826	TCC	2	6	18245	18250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_021826	TCC	2	6	18884	18889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_021826	TCT	2	6	18995	19000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021826	CCT	2	6	19422	19427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_021826	ATT	2	6	19433	19438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021826	GAA	2	6	19479	19484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021826	TAG	2	6	19988	19993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021826	TAT	2	6	20005	20010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021826	ATT	2	6	22126	22131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021826	GAG	2	6	22152	22157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021826	GAA	2	6	22159	22164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021826	TGT	2	6	25604	25609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021826	TGG	2	6	25678	25683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021826	TTG	2	6	25802	25807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021826	CAA	2	6	25952	25957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021826	ATT	2	6	27030	27035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021826	TCT	2	6	27097	27102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021826	AGG	2	6	27179	27184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021826	AGG	2	6	29980	29985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021826	GAG	2	6	33854	33859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021826	ATA	2	6	33863	33868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021826	AGG	2	6	34791	34796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021826	AGG	2	6	38815	38820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021826	AGG	2	6	39962	39967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021826	TTC	2	6	43909	43914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021826	TAA	2	6	43939	43944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021826	TGG	2	6	44253	44258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021826	ACG	2	6	44274	44279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021826	TAA	2	6	44356	44361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021826	AAG	2	6	44413	44418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021826	CTT	2	6	44454	44459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021826	AGG	2	6	44479	44484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021826	AGA	3	9	45893	45901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021826	GAG	2	6	49474	49479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021826	AGG	2	6	51765	51770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021826	GGT	2	6	52432	52437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021826	GGA	2	6	54445	54450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021826	GGA	2	6	57713	57718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021826	TAT	2	6	59415	59420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021826	GAA	2	6	59445	59450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021826	TTC	2	6	61539	61544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021826	TGG	2	6	61697	61702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021826	GAT	2	6	62473	62478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021826	AAC	2	6	62517	62522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021826	CGA	2	6	65631	65636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021826	TCC	2	6	79214	79219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_021826	TAT	2	6	81244	81249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021826	AGA	2	6	81254	81259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021826	ATG	2	6	81322	81327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021826	GAA	2	6	81344	81349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021826	TTA	2	6	81350	81355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021826	GAC	2	6	81518	81523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021826	AGA	2	6	81551	81556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021826	TAG	2	6	81605	81610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021826	GTT	2	6	81625	81630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021826	TCA	2	6	82476	82481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021826	GTT	2	6	82587	82592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021826	AAG	2	6	82641	82646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021826	AGG	2	6	83775	83780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021826	GTG	2	6	85661	85666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021826	AAC	2	6	85677	85682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021826	CCA	2	6	85687	85692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_021826	ATA	2	6	86152	86157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021826	TTA	2	6	86159	86164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021826	TGA	2	6	86174	86179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021826	GGT	2	6	86768	86773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021826	TTA	2	6	86823	86828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021826	GGT	2	6	86830	86835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021826	AAG	2	6	86888	86893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021826	GAA	3	9	90368	90376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021826	ATG	2	6	90490	90495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021826	ATA	2	6	98419	98424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021826	AGG	2	6	98507	98512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021826	CAT	2	6	100164	100169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021826	TAC	2	6	100193	100198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021826	GGT	2	6	100226	100231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021826	GGA	2	6	101198	101203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021826	AAG	2	6	102931	102936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_021826	AGG	2	6	206058	206063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
282	NC_021826	TAT	2	6	207008	207013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_021826	AGG	2	6	208120	208125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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