MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-1091

Total Repeats: 1104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021825	TTATCT	2	12	4318	4329	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525880194
2	NC_021825	TCGATT	2	12	6572	6583	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525880196
3	NC_021825	CTTATA	2	12	6853	6864	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525880196
4	NC_021825	AATTTG	2	12	9447	9458	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525880197
5	NC_021825	TCAGTT	2	12	9472	9483	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525880197
6	NC_021825	CTTTTG	2	12	13923	13934	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525877704
7	NC_021825	CCGTCA	2	12	14346	14357	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525877705
8	NC_021825	ATTTTT	2	12	14502	14513	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525877705
9	NC_021825	AAAAGA	2	12	14740	14751	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525880200
10	NC_021825	GTGTGA	2	12	15014	15025	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525880201
11	NC_021825	TCCTGT	2	12	16345	16356	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525877706
12	NC_021825	GCTAAA	2	12	17308	17319	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525880204
13	NC_021825	GATAAA	2	12	23331	23342	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525880207
14	NC_021825	ACATTC	2	12	25687	25698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880212
15	NC_021825	AATATC	2	12	28379	28390	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525877712
16	NC_021825	CATAGC	2	12	28792	28803	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525877712
17	NC_021825	CCACTC	2	12	29628	29639	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	525880221
18	NC_021825	ATGCTG	2	12	31173	31184	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525877714
19	NC_021825	AATGAA	2	12	36634	36645	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525880233
20	NC_021825	TTAAAT	2	12	44392	44403	50 %	50 %	0 %	0 %	525880236
21	NC_021825	ATTGTT	2	12	56772	56783	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525877722
22	NC_021825	AGCAAA	2	12	61811	61822	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525877725
23	NC_021825	AAATCA	2	12	62417	62428	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525877726
24	NC_021825	ACCTTT	2	12	69138	69149	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525877730
25	NC_021825	TTCTGC	2	12	69227	69238	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525877731
26	NC_021825	ATTTTT	2	12	73152	73163	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525877733
27	NC_021825	ATTTTG	2	12	75598	75609	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525877738
28	NC_021825	CCGCCA	2	12	75719	75730	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525877738
29	NC_021825	ATTTCA	2	12	78852	78863	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525880253
30	NC_021825	ATCTTT	2	12	79689	79700	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525880254
31	NC_021825	ACATAA	2	12	83341	83352	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525880257
32	NC_021825	TGGTGA	2	12	93260	93271	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525877747
33	NC_021825	TTTTGG	2	12	95021	95032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880260
34	NC_021825	TTTCAA	2	12	105171	105182	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525877758
35	NC_021825	TGATGT	2	12	107566	107577	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525877760
36	NC_021825	CTTTAT	2	12	107920	107931	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525877760
37	NC_021825	CCAAAA	2	12	108821	108832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880264
38	NC_021825	ATGAAG	2	12	109185	109196	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525880264
39	NC_021825	TGAAAA	2	12	110200	110211	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525877762
40	NC_021825	CCAGTA	2	12	110932	110943	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525877763
41	NC_021825	GTTGAA	2	12	115554	115565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880266
42	NC_021825	TAAATT	2	12	115942	115953	50 %	50 %	0 %	0 %	525880266
43	NC_021825	ATTTTC	2	12	117449	117460	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525880268
44	NC_021825	TTTTGC	2	12	118073	118084	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525880268
45	NC_021825	TGCTTT	2	12	120891	120902	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525877768
46	NC_021825	TCTTCA	2	12	122612	122623	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525877769
47	NC_021825	ATCAAA	2	12	125558	125569	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525877770
48	NC_021825	AATTTC	2	12	125930	125941	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525877770
49	NC_021825	TGCAAG	2	12	127157	127168	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525877771
50	NC_021825	TGCTTT	2	12	130984	130995	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525877775
51	NC_021825	TAAAAG	2	12	136344	136355	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525880270
52	NC_021825	CAGAAA	2	12	141831	141842	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525877786
53	NC_021825	TGGAAT	2	12	145845	145856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877789
54	NC_021825	GGTTGT	2	12	147160	147171	0 %	50 %	50 %	0 %	525877790
55	NC_021825	GCATTC	2	12	151441	151452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525877793
56	NC_021825	TGAAAA	2	12	152409	152420	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525877795
57	NC_021825	GTTGGT	2	12	159217	159228	0 %	50 %	50 %	0 %	525877800
58	NC_021825	CTTGTT	2	12	159663	159674	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525877801
59	NC_021825	ATTTTA	2	12	161747	161758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525877805
60	NC_021825	ATTGAT	2	12	165175	165186	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525877807
61	NC_021825	GAATAT	2	12	170949	170960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525880271
62	NC_021825	GAAACG	2	12	171091	171102	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525880271
63	NC_021825	CAAGGT	2	12	173084	173095	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525877811
64	NC_021825	AAATAA	2	12	179046	179057	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525877816
65	NC_021825	AATTTT	2	12	179636	179647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525877817
66	NC_021825	CTAAAA	2	12	180449	180460	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525877818
67	NC_021825	ATTAAA	2	12	184634	184645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880272
68	NC_021825	GAAATA	2	12	187847	187858	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525880278
69	NC_021825	AATATT	2	12	198938	198949	50 %	50 %	0 %	0 %	525877833
70	NC_021825	GAAAGC	2	12	203579	203590	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525877838
71	NC_021825	ATTGAA	2	12	203651	203662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525877838
72	NC_021825	AACGGA	2	12	204338	204349	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525877840
73	NC_021825	CAGAAA	2	12	206317	206328	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525877841
74	NC_021825	GAAAAT	2	12	208339	208350	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525877842
75	NC_021825	AAAGAT	2	12	212668	212679	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525877846
76	NC_021825	TTTATT	2	12	213835	213846	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525877847
77	NC_021825	AAAGTA	2	12	217590	217601	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525880281
78	NC_021825	TATGCT	2	12	218389	218400	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525880281
79	NC_021825	GTGCAT	2	12	224007	224018	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525877852
80	NC_021825	TTTTCT	2	12	226174	226185	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525877852
81	NC_021825	AGAAAC	2	12	228564	228575	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525877855
82	NC_021825	ACAGAG	2	12	229349	229360	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525877856
83	NC_021825	TGCTTC	2	12	230285	230296	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525877857
84	NC_021825	ATAACA	2	12	232745	232756	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525877860
85	NC_021825	AGATGT	2	12	236699	236710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877863
86	NC_021825	GCAATT	2	12	237656	237667	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525877864
87	NC_021825	AAGATA	2	12	239746	239757	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525877865
88	NC_021825	AAAAAT	2	12	242933	242944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525877866
89	NC_021825	TCAATT	2	12	246783	246794	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525880285
90	NC_021825	TTACCT	2	12	247170	247181	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525880285
91	NC_021825	TTAAAA	2	12	248468	248479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880286
92	NC_021825	ATTGAA	2	12	249074	249085	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525880286
93	NC_021825	AACCGG	2	12	261904	261915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525877880
94	NC_021825	TGATAG	2	12	263858	263869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877882
95	NC_021825	CGGCTC	2	12	266891	266902	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525877885
96	NC_021825	TAGTTG	2	12	277545	277556	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525877892
97	NC_021825	TAAAAA	2	12	278083	278094	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525877893
98	NC_021825	AATGGC	2	12	278655	278666	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525877894
99	NC_021825	AGTAAC	2	12	280203	280214	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525877895
100	NC_021825	ATTTTC	2	12	280936	280947	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525877897
101	NC_021825	AAAATC	2	12	282555	282566	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525880288
102	NC_021825	ATTAAT	2	12	284386	284397	50 %	50 %	0 %	0 %	525880291
103	NC_021825	AAATAG	2	12	286313	286324	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525880293
104	NC_021825	TGAAAT	2	12	287841	287852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525880294
105	NC_021825	ATAACA	2	12	288105	288116	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525880294
106	NC_021825	AAAATT	2	12	288176	288187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880294
107	NC_021825	GATATG	2	12	292789	292800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877902
108	NC_021825	TCGCTC	2	12	296541	296552	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525877904
109	NC_021825	AATGGT	2	12	303626	303637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877910
110	NC_021825	TGAAAA	2	12	304214	304225	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525877911
111	NC_021825	AAGCAG	2	12	304842	304853	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525877913
112	NC_021825	TTCCTG	2	12	309770	309781	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525877919
113	NC_021825	TCCGAC	2	12	310893	310904	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525877920
114	NC_021825	CCAAGA	2	12	315934	315945	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525877926
115	NC_021825	GTTCGT	2	12	316813	316824	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525877927
116	NC_021825	TACAAG	2	12	324951	324962	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525877933
117	NC_021825	TTTGTA	2	12	327020	327031	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525877935
118	NC_021825	TGCGGT	2	12	328093	328104	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525877935
119	NC_021825	GATGTG	2	12	329386	329397	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525877936
120	NC_021825	TGCTGG	2	12	329757	329768	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525877936
121	NC_021825	TGTTGC	2	12	330078	330089	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525877936
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125	NC_021825	GGTATG	2	12	343964	343975	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525877949
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228	NC_021825	GAAGAT	2	12	608516	608527	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525878201
229	NC_021825	TGGTGT	2	12	616852	616863	0 %	50 %	50 %	0 %	525878209
230	NC_021825	TGGTCG	2	12	617038	617049	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525878209
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232	NC_021825	ATAAAT	2	12	618509	618520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880322
233	NC_021825	GTTCTT	2	12	621584	621595	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525878214
234	NC_021825	TTTTTC	2	12	621709	621720	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525878214
235	NC_021825	CAATTG	2	12	626200	626211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525878220
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239	NC_021825	AACACC	2	12	636242	636253	50 %	0 %	0 %	50 %	525878227
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343	NC_021825	TCTGTT	2	12	881663	881674	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525880367
344	NC_021825	AATTAT	2	12	883250	883261	50 %	50 %	0 %	0 %	525878408
345	NC_021825	TAAAAG	2	12	884193	884204	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525878409
346	NC_021825	GAAATT	2	12	884657	884668	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525878409
347	NC_021825	GATGGC	2	12	886172	886183	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525878410
348	NC_021825	TGCTTG	2	12	888679	888690	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525878413
349	NC_021825	TTCACC	2	12	891698	891709	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525878414
350	NC_021825	TATGAC	2	12	893695	893706	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525880370
351	NC_021825	GATGGA	2	12	895406	895417	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525878417
352	NC_021825	ACTTCT	2	12	896190	896201	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525880372
353	NC_021825	TTTTCT	2	12	896686	896697	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525880372
354	NC_021825	TCCTTT	2	12	898723	898734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525878420
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369	NC_021825	AATTAG	2	12	948205	948216	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525878468
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374	NC_021825	TTTTCT	2	12	957023	957034	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525878476
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447	NC_021825	TTGATA	2	12	1177696	1177707	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525880407
448	NC_021825	TCCTGT	2	12	1178342	1178353	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525880407
449	NC_021825	GTAAAA	2	12	1178985	1178996	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525880407
450	NC_021825	CTTTTG	2	12	1182478	1182489	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525878661
451	NC_021825	TTGAGG	2	12	1184808	1184819	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525878663
452	NC_021825	AAAGCA	2	12	1184875	1184886	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525878664
453	NC_021825	TTTTTC	2	12	1191455	1191466	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525878672
454	NC_021825	TTTCAC	2	12	1199136	1199147	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525878680
455	NC_021825	AATCGC	2	12	1199847	1199858	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525878681
456	NC_021825	AAGGAA	2	12	1202137	1202148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525878684
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