MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-1091

Total Repeats: 38505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021825	AAG	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525880189
2	NC_021825	GTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880189
3	NC_021825	GTT	2	6	1421	1426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880189
4	NC_021825	ACA	2	6	1566	1571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880189
5	NC_021825	GTA	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880189
6	NC_021825	CAT	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880189
7	NC_021825	CAC	2	6	1786	1791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525880189
8	NC_021825	AGC	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880189
9	NC_021825	AAC	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880189
10	NC_021825	CTT	2	6	2095	2100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880189
11	NC_021825	ATT	2	6	2211	2216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880189
12	NC_021825	ATC	2	6	2218	2223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880190
13	NC_021825	ATC	2	6	2303	2308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880190
14	NC_021825	ACT	2	6	2447	2452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880190
15	NC_021825	TGT	3	9	2585	2593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880191
16	NC_021825	CAT	2	6	2599	2604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880191
17	NC_021825	TGT	2	6	2630	2635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880191
18	NC_021825	TAA	2	6	2649	2654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880191
19	NC_021825	TTC	2	6	2665	2670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880191
20	NC_021825	CTT	2	6	2721	2726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880191
21	NC_021825	TAA	2	6	2772	2777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880191
22	NC_021825	CAA	2	6	2779	2784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880191
23	NC_021825	AAT	2	6	2785	2790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880191
24	NC_021825	CTT	2	6	2922	2927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880192
25	NC_021825	ATT	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880192
26	NC_021825	TTA	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880192
27	NC_021825	TAG	2	6	3005	3010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880192
28	NC_021825	ATA	2	6	3081	3086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880193
29	NC_021825	TTG	2	6	3103	3108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880193
30	NC_021825	TCT	2	6	3120	3125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880193
31	NC_021825	TGG	2	6	3196	3201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525880193
32	NC_021825	TGG	2	6	3277	3282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525880193
33	NC_021825	TCT	2	6	3309	3314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880193
34	NC_021825	TCA	2	6	3362	3367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880193
35	NC_021825	TTA	2	6	3381	3386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880193
36	NC_021825	TGT	2	6	3396	3401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880193
37	NC_021825	TGC	2	6	3516	3521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880194
38	NC_021825	CTG	2	6	3528	3533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880194
39	NC_021825	CAA	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880194
40	NC_021825	TTC	2	6	3709	3714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880194
41	NC_021825	GTT	2	6	3808	3813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880194
42	NC_021825	ATC	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880194
43	NC_021825	GAT	2	6	4215	4220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880194
44	NC_021825	CAG	3	9	4289	4297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880194
45	NC_021825	TCT	2	6	4399	4404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880194
46	NC_021825	AAC	2	6	4466	4471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880195
47	NC_021825	CGC	2	6	4477	4482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525880195
48	NC_021825	AAC	2	6	4648	4653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880195
49	NC_021825	CAG	2	6	4663	4668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880195
50	NC_021825	CAG	2	6	4687	4692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880195
51	NC_021825	AGT	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880195
52	NC_021825	GTT	2	6	4785	4790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880195
53	NC_021825	TCT	2	6	4806	4811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880195
54	NC_021825	TGC	2	6	4876	4881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880195
55	NC_021825	TTG	2	6	4906	4911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880195
56	NC_021825	CGG	2	6	4940	4945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525880195
57	NC_021825	GAC	2	6	4949	4954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880195
58	NC_021825	TCG	2	6	5082	5087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880195
59	NC_021825	ATC	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880195
60	NC_021825	TGC	2	6	5119	5124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880195
61	NC_021825	TTA	2	6	5218	5223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880195
62	NC_021825	TGT	2	6	5258	5263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880195
63	NC_021825	AGA	2	6	5285	5290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525880195
64	NC_021825	CTA	2	6	5302	5307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880195
65	NC_021825	CCG	2	6	5325	5330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525880195
66	NC_021825	TAA	2	6	5335	5340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880195
67	NC_021825	ATG	2	6	5523	5528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877703
68	NC_021825	AGT	2	6	5845	5850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877703
69	NC_021825	TTG	2	6	5940	5945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525877703
70	NC_021825	CAG	2	6	5983	5988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525877703
71	NC_021825	TTG	2	6	6006	6011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525877703
72	NC_021825	TCT	2	6	6036	6041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877703
73	NC_021825	CTT	2	6	6046	6051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877703
74	NC_021825	GCT	2	6	6295	6300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525877703
75	NC_021825	AAC	2	6	6302	6307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525877703
76	NC_021825	TAA	2	6	6347	6352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877703
77	NC_021825	ATT	2	6	6368	6373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525877703
78	NC_021825	GTA	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877703
79	NC_021825	GTT	2	6	6548	6553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880196
80	NC_021825	CCG	2	6	6590	6595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525880196
81	NC_021825	ATA	2	6	6597	6602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880196
82	NC_021825	GTA	2	6	7069	7074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880196
83	NC_021825	AAT	2	6	7100	7105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880196
84	NC_021825	TCA	2	6	7106	7111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880196
85	NC_021825	ATT	2	6	7231	7236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880196
86	NC_021825	TAT	2	6	7505	7510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880197
87	NC_021825	AAT	2	6	7512	7517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880197
88	NC_021825	TAC	2	6	7629	7634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880197
89	NC_021825	TTA	2	6	7648	7653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880197
90	NC_021825	GTT	2	6	7817	7822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880197
91	NC_021825	TCT	2	6	7823	7828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880197
92	NC_021825	CGC	2	6	7857	7862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525880197
93	NC_021825	CAG	2	6	7871	7876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880197
94	NC_021825	GCT	2	6	7891	7896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880197
95	NC_021825	AGC	2	6	8196	8201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880197
96	NC_021825	ACT	2	6	8263	8268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880197
97	NC_021825	GTA	2	6	8425	8430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880197
98	NC_021825	CAA	2	6	8471	8476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880197
99	NC_021825	ATT	2	6	8478	8483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880197
100	NC_021825	TGC	2	6	8484	8489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880197
101	NC_021825	TTA	2	6	8617	8622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880197
102	NC_021825	CTG	2	6	8633	8638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880197
103	NC_021825	TTC	2	6	8650	8655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880197
104	NC_021825	CTG	2	6	8762	8767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880197
105	NC_021825	TTA	2	6	9133	9138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880197
106	NC_021825	TGT	2	6	9153	9158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880197
107	NC_021825	ATA	2	6	9220	9225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880197
108	NC_021825	TAT	2	6	9245	9250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880197
109	NC_021825	TCG	2	6	9301	9306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880197
110	NC_021825	ATA	2	6	9373	9378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880197
111	NC_021825	TTC	3	9	9427	9435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880197
112	NC_021825	TGT	3	9	9694	9702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880197
113	NC_021825	TGT	2	6	9715	9720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880197
114	NC_021825	CTA	2	6	9821	9826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880197
115	NC_021825	CTT	2	6	9929	9934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880197
116	NC_021825	CCG	2	6	10015	10020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525880197
117	NC_021825	GTT	2	6	10060	10065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880197
118	NC_021825	GTT	2	6	10081	10086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880197
119	NC_021825	TTC	2	6	10135	10140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880197
120	NC_021825	TTA	2	6	10210	10215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880197
121	NC_021825	CAA	2	6	10244	10249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880197
122	NC_021825	GCT	2	6	10315	10320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880197
123	NC_021825	CTA	2	6	10358	10363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880197
124	NC_021825	AAT	2	6	10386	10391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880197
125	NC_021825	CAG	2	6	10400	10405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880197
126	NC_021825	CTA	2	6	10514	10519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880197
127	NC_021825	ATT	2	6	10645	10650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880197
128	NC_021825	GCG	2	6	10660	10665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525880197
129	NC_021825	CCA	2	6	10726	10731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525880197
130	NC_021825	CTA	2	6	10798	10803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880197
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133	NC_021825	CTG	2	6	11075	11080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880197
134	NC_021825	GTT	2	6	11125	11130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880197
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241	NC_021825	ATC	2	6	20045	20050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525877707
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244	NC_021825	ATT	2	6	20325	20330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525877707
245	NC_021825	CCT	2	6	20350	20355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525877708
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249	NC_021825	ATA	2	6	20525	20530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877708
250	NC_021825	GTA	2	6	20624	20629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877708
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253	NC_021825	TGT	2	6	20834	20839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525877708
254	NC_021825	TAA	2	6	20985	20990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877708
255	NC_021825	TCA	2	6	21054	21059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525877708
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259	NC_021825	TCT	2	6	21213	21218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877708
260	NC_021825	ATC	2	6	21320	21325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525877708
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262	NC_021825	CTG	2	6	21437	21442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525877708
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281	NC_021825	GAG	2	6	22414	22419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525880206
282	NC_021825	ATT	2	6	22449	22454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880206
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285	NC_021825	TTA	2	6	22803	22808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880206
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360	NC_021825	ATT	2	6	30597	30602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525877713
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369	NC_021825	ATG	2	6	31439	31444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877714
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