MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021824	CGCCTA	2	12	289	300	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021824	TTTCCT	2	12	2192	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021824	TTGAAT	2	12	3764	3775	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021824	TTGTCT	2	12	114939	114950	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021824	CTTTTT	2	12	154423	154434	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021824	ATCCCA	2	12	174337	174348	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021824	TTTTTA	2	12	186164	186175	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021824	CGCCTA	2	12	231577	231588	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021824	TTTCCT	2	12	233481	233492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021824	TTGAAT	2	12	235053	235064	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021824	CCTCTT	2	12	277524	277535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021824	TAAATC	2	12	300546	300557	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021824	TTATCT	2	12	403803	403814	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021824	TATCAA	2	12	450047	450058	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021824	TAAAAA	2	12	450131	450142	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021824	AAGTAT	2	12	450998	451009	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021824	CTATTA	2	12	508324	508335	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021824	CAGGTT	2	12	646675	646686	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021824	ACACTT	2	12	674894	674905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021824	AATAAA	2	12	701213	701224	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021824	GAAAAC	2	12	728132	728143	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021824	ATTCAA	2	12	739013	739024	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021824	AAGGAA	2	12	740584	740595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021824	TAGGCG	2	12	742237	742248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021824	AGTCAA	2	12	744051	744062	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021824	TTATAT	2	12	758837	758848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021824	AACTTT	2	12	794559	794570	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021824	TAAAAA	2	12	799928	799939	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021824	AATACA	2	12	804377	804388	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021824	CATAGA	2	12	856040	856051	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021824	AAATTT	2	12	879617	879628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021824	ATGATA	2	12	902398	902409	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021824	TTGTTT	2	12	922189	922200	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021824	ACAAAA	2	12	981204	981215	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021824	AAATGT	2	12	1069854	1069865	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021824	AGATTT	2	12	1077985	1077996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021824	AAATAA	2	12	1118287	1118298	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021824	ATCATT	2	12	1148182	1148193	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021824	TGTAAA	2	12	1170118	1170129	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021824	ATCATT	2	12	1189950	1189961	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021824	GAATAA	2	12	1217033	1217044	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021824	GTTTTA	2	12	1222725	1222736	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021824	TATAGG	2	12	1239942	1239953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021824	AATTAG	2	12	1267388	1267399	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021824	TGTTGA	2	12	1278444	1278455	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021824	TTACTT	2	12	1359813	1359824	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021824	AAATAG	2	12	1396233	1396244	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021824	GTAATC	2	12	1403036	1403047	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021824	TTACAA	2	12	1403054	1403065	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021824	ATGAAA	2	12	1411658	1411669	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021824	TACTTG	2	12	1439058	1439069	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021824	TTGACT	2	12	1534661	1534672	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021824	AGGAAG	2	12	1544849	1544860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021824	AACAAT	2	12	1583853	1583864	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021824	CTTTTT	2	12	1600149	1600160	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021824	AAATAA	2	12	1645689	1645700	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021824	TTTAGT	2	12	1651202	1651213	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021824	CTTTTT	2	12	1689617	1689628	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021824	CTTTTT	2	12	1724078	1724089	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021824	GAAAAA	2	12	1754042	1754053	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021824	AGTAAA	2	12	1773235	1773246	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021824	TATTAA	2	12	1830743	1830754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021824	GTACAA	2	12	1944015	1944026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021824	TAATCA	2	12	1977378	1977389	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021824	TACCAA	2	12	1995310	1995321	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021824	CTCTTC	2	12	2124161	2124172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021824	TAAAAA	2	12	2139622	2139633	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021824	TCATTA	2	12	2160484	2160495	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021824	GGTTGT	2	12	2174809	2174820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021824	GAATAA	2	12	2176362	2176373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021824	GTAAAC	2	12	2177513	2177524	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021824	ACAAAA	2	12	2186137	2186148	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021824	AAAATA	2	12	2190457	2190468	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021824	TAAAAA	2	12	2191367	2191378	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021824	CTTATT	2	12	2277374	2277385	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021824	CGCCTA	2	12	2280878	2280889	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021824	TTTCCT	2	12	2282530	2282541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021824	TTGAAT	2	12	2284102	2284113	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021824	CGCCTA	2	12	2383700	2383711	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021824	TTTCCT	2	12	2385351	2385362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021824	TTGAAT	2	12	2386923	2386934	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021824	AAATGG	2	12	2387907	2387918	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021824	GTTTTG	2	12	2394874	2394885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021824	CTTTTG	2	12	2417462	2417473	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021824	TCTACT	2	12	2443815	2443826	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021824	CTCTAT	2	12	2495833	2495844	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021824	TCATTT	2	12	2497031	2497042	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021824	GTTTTC	2	12	2524201	2524212	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021824	CAAAAA	2	12	2541925	2541936	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021824	GAAAAA	2	12	2545785	2545796	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021824	TTCACT	2	12	2696001	2696012	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021824	ATTCAA	2	12	2706731	2706742	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021824	TATATT	2	12	2768226	2768237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021824	AATTTT	2	12	2825928	2825939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021824	AAATTG	2	12	2832104	2832115	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021824	CTCTGT	2	12	2838948	2838959	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021824	TTATTT	2	12	2893967	2893978	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021824	TAATAC	2	12	2922712	2922723	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.