MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 354

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021824	TTACC	2	10	948	957	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021824	CACGA	2	10	2669	2678	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_021824	AATTA	2	10	3828	3837	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021824	AAGTT	2	10	15170	15179	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021824	AATTT	2	10	33013	33022	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021824	TTATG	2	10	38344	38353	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021824	AAACA	2	10	40560	40569	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021824	TATTT	2	10	46403	46412	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021824	ATAAG	2	10	60849	60858	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021824	GTTTT	2	10	69432	69441	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021824	TCAAA	2	10	87966	87975	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021824	TAAAA	2	10	100121	100130	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021824	AACGA	2	10	100163	100172	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021824	TTTTA	2	10	101994	102003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021824	CTTTT	2	10	108141	108150	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021824	AGCAA	2	10	129133	129142	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021824	TTTAT	2	10	129271	129280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021824	GGAAA	2	10	131288	131297	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021824	ATCTT	2	10	139254	139263	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021824	TATCA	2	10	142004	142013	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021824	TACCA	2	10	143454	143463	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_021824	AAACA	2	10	154477	154486	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021824	GCTTT	2	10	156477	156486	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021824	ATAAA	2	10	156490	156499	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021824	GTTTG	2	10	174300	174309	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021824	GAAAG	2	10	186154	186163	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021824	CTTTT	2	10	187997	188006	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021824	AAATA	2	10	201412	201421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021824	AAGTC	2	10	201441	201450	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021824	TTTAT	2	10	201451	201460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021824	ATTAT	2	10	204611	204620	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021824	ATCAT	2	10	213778	213787	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021824	TTATA	2	10	225719	225728	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021824	TTTTA	2	10	226135	226144	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021824	CACCC	2	10	229543	229552	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
36	NC_021824	TTACC	2	10	232236	232245	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_021824	CACGA	2	10	233958	233967	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_021824	GCATG	2	10	234843	234852	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021824	AATTA	2	10	235117	235126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021824	TCGTT	2	10	239500	239509	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021824	CAAGG	2	10	239546	239555	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021824	GAAAA	2	10	239577	239586	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021824	AAACT	2	10	251531	251540	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_021824	TTAAT	2	10	262545	262554	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021824	TACAA	2	10	267330	267339	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021824	TTAGA	2	10	267551	267560	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021824	ATTTT	2	10	267646	267655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021824	TAAAA	2	10	286442	286451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021824	ACATC	2	10	305160	305169	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_021824	TATTT	2	10	318263	318272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021824	ATTAA	2	10	326351	326360	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021824	TTTCC	2	10	329820	329829	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_021824	TCATG	2	10	342335	342344	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021824	TAAAA	2	10	343801	343810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021824	CAAAC	2	10	344795	344804	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_021824	CTTTT	2	10	351460	351469	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021824	GGCTA	2	10	353069	353078	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021824	TTGGA	2	10	361964	361973	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021824	TATAG	2	10	368152	368161	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021824	AAAAT	2	10	374070	374079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021824	TATAT	2	10	386232	386241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021824	TAGAA	2	10	396917	396926	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021824	TATTT	2	10	402689	402698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021824	CTTAA	2	10	427827	427836	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021824	TTTTA	2	10	429328	429337	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021824	TAAAA	2	10	441617	441626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021824	AAACC	2	10	442503	442512	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_021824	GGTTT	2	10	450942	450951	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021824	CACTC	2	10	462324	462333	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
70	NC_021824	TATCA	2	10	505836	505845	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021824	TACAT	2	10	506828	506837	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_021824	AAATG	2	10	530560	530569	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021824	AAAGG	2	10	542119	542128	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021824	TTCTA	2	10	542613	542622	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021824	GACTT	2	10	557915	557924	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021824	ATGGT	2	10	560166	560175	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021824	AAATA	2	10	562222	562231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021824	TAAAA	2	10	563204	563213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021824	TTATG	2	10	565411	565420	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021824	TAAAA	2	10	586063	586072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021824	ATTTT	2	10	595617	595626	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021824	ATATC	2	10	615958	615967	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_021824	AGAGA	2	10	626784	626793	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021824	TTACT	2	10	628223	628232	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021824	AAAGT	2	10	630464	630473	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021824	AGTAG	2	10	652173	652182	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021824	GATAA	2	10	655889	655898	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021824	ATATG	2	10	662869	662878	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021824	TTGTA	2	10	674907	674916	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021824	ATAGA	2	10	695612	695621	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021824	TTGTC	2	10	701138	701147	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021824	ACAAA	2	10	701503	701512	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_021824	ATATA	2	10	709249	709258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021824	GAGTG	2	10	717274	717283	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021824	AGCCG	2	10	725451	725460	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_021824	GAAAA	2	10	733568	733577	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021824	GAATA	2	10	737065	737074	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021824	AAATT	2	10	738750	738759	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021824	TAATT	2	10	738951	738960	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021824	TCGTG	2	10	740110	740119	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021824	AAGGT	2	10	741578	741587	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021824	GGCAT	2	10	758871	758880	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021824	AGTGA	2	10	780988	780997	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021824	AATTA	2	10	783146	783155	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021824	TGGCT	2	10	793292	793301	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021824	ACTAA	2	10	794668	794677	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_021824	TATAA	2	10	799894	799903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021824	AAAGA	2	10	803122	803131	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021824	TTATT	2	10	825678	825687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021824	TAGAT	2	10	828105	828114	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021824	TAAAA	2	10	839896	839905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021824	ATTGT	2	10	855339	855348	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021824	TTTTA	2	10	865345	865354	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021824	AGGAG	2	10	868976	868985	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021824	ATAGA	2	10	869280	869289	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021824	AAATG	2	10	878158	878167	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021824	CACAC	2	10	879092	879101	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
118	NC_021824	AAATT	2	10	879722	879731	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021824	GTGAT	2	10	894372	894381	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021824	AAAAC	2	10	896185	896194	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_021824	TTTGG	2	10	901283	901292	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021824	AAAAG	2	10	901350	901359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021824	CAAAA	2	10	922161	922170	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_021824	TAGAT	2	10	931404	931413	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021824	AGGTG	2	10	953456	953465	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021824	GGAAA	2	10	958581	958590	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021824	CTTAT	2	10	973078	973087	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021824	TTTAT	2	10	992754	992763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021824	TTTCT	2	10	997127	997136	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021824	ATACA	2	10	1018693	1018702	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021824	ATAAA	2	10	1032951	1032960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021824	AAAAC	2	10	1044960	1044969	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021824	GTTTT	2	10	1044982	1044991	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021824	AAACA	2	10	1047489	1047498	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_021824	TATAG	2	10	1065663	1065672	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021824	GAAAA	2	10	1069773	1069782	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021824	TAGAC	2	10	1085983	1085992	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_021824	TAAAA	2	10	1091911	1091920	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021824	CTATG	2	10	1099356	1099365	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_021824	AAAGA	2	10	1104810	1104819	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021824	ATAAA	2	10	1119781	1119790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021824	AGAAT	2	10	1120651	1120660	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021824	TGGAA	2	10	1120779	1120788	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021824	TAGAA	2	10	1120789	1120798	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021824	AATCA	2	10	1123787	1123796	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021824	TATAA	2	10	1131732	1131741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021824	ATTGA	2	10	1131770	1131779	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021824	ATTAA	2	10	1145078	1145087	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021824	AAAAT	2	10	1147394	1147403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_021824	TCTAT	2	10	1531788	1531797	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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272	NC_021824	ATAAA	2	10	2239107	2239116	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_021824	TTATT	2	10	2241389	2241398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_021824	TTTCA	2	10	2311166	2311175	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
286	NC_021824	AAGAT	2	10	2314024	2314033	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_021824	AAAAT	2	10	2328640	2328649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_021824	CTTAC	2	10	2338104	2338113	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
289	NC_021824	TGTTC	2	10	2343208	2343217	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
290	NC_021824	TTTTA	2	10	2351769	2351778	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_021824	AAAAG	2	10	2356563	2356572	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
292	NC_021824	TTTTA	2	10	2366220	2366229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_021824	AGGTT	2	10	2378197	2378206	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
294	NC_021824	TTACC	2	10	2384359	2384368	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
295	NC_021824	CACGA	2	10	2385828	2385837	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
296	NC_021824	AATTA	2	10	2386987	2386996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_021824	GTATA	2	10	2394812	2394821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
298	NC_021824	CAAAA	2	10	2395039	2395048	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
299	NC_021824	TCTAT	2	10	2400265	2400274	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
300	NC_021824	TGCGT	2	10	2417356	2417365	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
301	NC_021824	TAAAA	2	10	2424451	2424460	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_021824	ATACA	2	10	2437341	2437350	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
303	NC_021824	ACTTT	2	10	2439175	2439184	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
304	NC_021824	ATTTC	2	10	2443366	2443375	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
305	NC_021824	AAAGT	2	10	2444252	2444261	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_021824	TAGCA	2	10	2471770	2471779	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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311	NC_021824	AGCAT	2	10	2496898	2496907	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
312	NC_021824	AAAAT	2	10	2500456	2500465	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_021824	ATAGA	2	10	2521388	2521397	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
314	NC_021824	CTTTA	2	10	2527907	2527916	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
315	NC_021824	AATTT	2	10	2541408	2541417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_021824	CTAGC	2	10	2541513	2541522	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
317	NC_021824	TTAAA	2	10	2547286	2547295	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_021824	TAACA	2	10	2588242	2588251	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
322	NC_021824	TTGCT	2	10	2592576	2592585	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
323	NC_021824	AAATT	2	10	2600566	2600575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_021824	CTTTT	2	10	2621607	2621616	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
325	NC_021824	TTAAA	2	10	2631242	2631251	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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329	NC_021824	AATTC	2	10	2666471	2666480	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
330	NC_021824	TTTTA	2	10	2670941	2670950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_021824	CTTTT	2	10	2687145	2687154	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
332	NC_021824	AGCAT	2	10	2700476	2700485	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
333	NC_021824	ACTAA	2	10	2734385	2734394	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
334	NC_021824	TAAAG	2	10	2751398	2751407	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
335	NC_021824	AATTT	2	10	2756160	2756169	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
336	NC_021824	CACTA	2	10	2764050	2764059	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
337	NC_021824	GTATC	2	10	2767155	2767164	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
338	NC_021824	GAAAA	2	10	2767361	2767370	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
339	NC_021824	ATTGT	2	10	2768166	2768175	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
340	NC_021824	GTAAA	2	10	2772909	2772918	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
341	NC_021824	TTTGT	2	10	2810327	2810336	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
342	NC_021824	TAAAA	2	10	2818066	2818075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_021824	TCTAT	2	10	2821170	2821179	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
344	NC_021824	ATCTT	2	10	2825161	2825170	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
345	NC_021824	TTAAA	2	10	2850875	2850884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
346	NC_021824	TCTTT	2	10	2852491	2852500	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
347	NC_021824	TTATG	2	10	2852512	2852521	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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349	NC_021824	ATATA	2	10	2885228	2885237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
350	NC_021824	TAACA	2	10	2897075	2897084	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
351	NC_021824	TCACT	2	10	2907207	2907216	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
352	NC_021824	CTATA	2	10	2922652	2922661	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
353	NC_021824	GAAAA	2	10	2928749	2928758	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
354	NC_021824	TTAAT	2	10	2940162	2940171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.